至今為止，《名偵探柯南》的漫畫已經連載了二十多年了，動畫劇集也播出了1000多集。眾所周知，柯南的真實身份是工藤新一，一名天才高中偵探。他之所以會變成小孩子，都是因為黑衣人組織。
從現實角度來講，雖然工藤新一的心思很縝密，但畢竟還是一個十幾歲的小青年。在扮演柯南的日子裡，還是需要承受很大的壓力的。不過再大的秘密也是需要向人傾訴的。在故事中，柯南一共主動向多人說過自己的身份，被逼無奈的讓多人知道身體變小的事情。
訴說的第一個人是阿笠博士，柯南是真的很信賴阿笠博士啊！在故事的開頭，柯南變小的第一件事就是就將這個秘密告訴了阿笠博士。阿笠博士也確實是一個嘴很嚴的人，不但幫助他保守秘密（但告訴了工藤夫婦），還會給他提供相關的技術支持。
第二個人主動告知身份的是宮野明美。宮野明美是黑衣人組織的，到那時她並不是一個壞人，她是別逼無奈的。令人遺憾的是，她最後還是被琴酒殺害了。在宮野明美臨死的時候，柯南向他說出了自己是工藤新一的真相。
而因為黑衣組織而得之柯南身份的人還有貝爾摩得、灰原哀。還有很多人是通過推理獲得，像是服部平次第一次登場就猜出了柯南不簡單，然後推理出了柯南就是新一，是《名偵探柯南》中第一個主動發現柯南身份的人。
後面的劇情還有本堂瑛佑，是毛利蘭的同班同學。他和黑衣人組織也是敵對的關係，他的爸爸和姐姐都是中央情報局的成員。後來，他的爸爸和姐姐被安排到黑衣人組織做臥底，爸爸犧牲了，姐姐下落不明。本堂瑛佑很喜歡小蘭，也早就懷疑柯南是新一。在故事中，本堂瑛佑用激將法間接引柯南說出了自己的秘密。
例外還有番外篇亞倫史密斯。在番外動畫《魯邦三世VS名偵探柯南》中，柯南很大方向一個叫亞倫史密斯的人承認了自己就是工藤新一。
當然還有像怪盜基德，世良真純等等人都知道。唯獨不知道的就是在柯南身邊的小蘭跟小五郎。
其實在故事的初期，柯南還差點向小蘭說出自己的秘密呢！不過，就在他要說出秘密的時候，毛利小五郎從樓梯上摔了下來，就是這一摔，柯南改變了主意！可憐小蘭二十年的等待啊！但是最近又有人說小五郎一早就知道了。
最新的劇情是跟毛利小五郎有關的，那就是黑衣組織的二號人物朗姆身份曝光了，居然是米花伊呂波壽司店廚師兼毛利小五郎的二號徒弟，而小五郎的大徒弟是黑衣組織臥底安室透。以前總覺得這些人圍著柯南走，但現在才發現，他們都是跟在毛利小五郎的背後。
這麼看來，小五郎真的「深不可測」，才會讓這些人拼命的想要接近他？