小智和小赤是不同版本的神奇寶貝主角，和我們常認識的小智障不同，起源篇小赤是遊戲裡的絕對主角，可以說是全服最大的bug。網友們也常常拿兩個主角作比較，最大的共同點就是皮卡丘。
小智的皮卡丘是從大木博士那裡拿到的，起初的小智並沒有辦法駕馭皮卡丘。而小智的皮卡丘最大的特點，就是從來不進入神奇寶貝球裡面，並且和小智旅行了這麼久，等級已經相當的高了。
而小赤的皮卡丘雖然還算不上是小赤的主力，但是作為絕對主角，小赤的皮卡丘也是扛過雷吉奇卡斯，傷過火神蛾的，論戰績的話也不差甚至還要更好一點。
於是決勝的關鍵就是在招式的威力上，畢竟是平行時空的主角，不可能讓他們正面交鋒。小智的皮卡丘最拿手的就是十萬伏特，而小赤的皮卡丘卻是能夠使用百萬伏特的，這就很明顯的差距了。
但是轉折點出現在了新篇日月裡，小智和皮卡丘靠著進化型的Z純晶竟然合力使出了千萬伏特，可以說小智這次是難得的扳回一局了，加上新招式電網的運用，或許這次小智終於要翻身了。
不過動漫設計的初期小赤就是代表著最強玩家，而小智更像是一個慢慢努力的普通人，所以小智要真想打敗小赤，還得修煉個20年吧！