新冠肺炎疫情在島內延燒，民進黨當局的各種防疫措施連日來飽受外界詬病。在臺灣地區流行疫情指揮中心4月5日的記者會上，指揮官陳時中和臺食藥部門主管吳秀梅公開教授民眾如何利用電鍋幹蒸口罩進行消毒，並鼓勵民眾反覆使用口罩。外界對此擔憂,這是不是島內口罩不夠用的警訊。
清明假期頭兩天，島內各大景區摩肩接踵的畫面，儼然成為全臺媒體關注的焦點，人潮源源不斷地湧入墾丁，花東訂房率高達七、八成。就連桃園市下屬的16個風景區，這幾天也湧入了23萬以上的遊客，不免讓各縣市如臨大敵、繃緊神經。
桃園市長鄭文燦：商圈跟夜市要特別注意，主要是因為墾丁爆量，讓大家擔心有防疫缺口。
花蓮市長魏嘉賢那我們希望說大家有這樣的擔心這樣的疑慮希望能夠徹底地把這些部分來做一個全面性消毒。
然而，直到假期尾聲，臺疫情指揮中心才匆匆發布警報，提醒民眾不要再湧入墾丁等多處景點。警報姍姍來遲，防疫破口似乎已經造成，據臺灣媒體報導，連假過後，各醫院的病患人數相比之前多了兩三成。高雄市兩家醫院的急診室已收治十多位去過墾丁等景點的病患，不少人劈頭蓋臉地要求做新冠肺炎篩檢；接診醫師對此坦言，壓力很大。
高雄市小港醫院急診主任劉耀華：一口氣會來好幾位，所以在我們能力方面有點吃緊。
急診室有點負擔大概都是因為去完風景區覺得身體不舒服就是有一些感冒的症狀咳嗽啊喉嚨痛啊不舒服的症狀還是會按照方式幫他做篩檢。
臺灣流行疫情指揮中心4月6日宣布，在清明連假期間曾到島內11處景點遊玩的民眾，即日起須配合進行居家辦公或自主健康管理。
臺灣地區流行疫情指揮中心指揮官陳時中：在這段時間，有外出旅遊到人潮擁擠處者，請要自主健康管理。
外界質疑，在放假前，民進黨當局一面以防疫為由，不斷宣導要大家線上掃墓、避免群聚，並取消了掃墓專車，但另一面卻又「不反對」甚至鼓勵大家出遊。此外，自從疫情暴發以來，民進黨當局動不動就將「超前部署」掛在嘴上、自我標榜，但對這些事先從高訂房率就可預期的景況卻毫無警覺，反而是人潮先超前部署到各景區，臺流行疫情指揮中心指揮官陳時中還辯稱自己沒想到會出現這樣的狀況。對此，中國國民黨前副秘書長蔡正元在「臉書」嘲諷說，「沒想到陳時中沒想到」，而民進黨當局內部對此也質疑不斷。
民進黨籍臺南市市長黃偉哲：人數反而更多的地方把它放過，地方卻很大，很空曠的地方，把它例如旅遊警示，這樣子不但是錯殺，而且是發生了縱放。
批評民進黨當局「亂槍打鳥」之餘，黃偉哲也提醒，鬧區的夜市、菜市場等地在短時間內容易發生人群聚集，這才是更該注意的地方。