莎士比亞書店原為法國巴黎左岸的兩個獨立的書店。第一座書店由西爾維亞比奇（Sylvia Beach）於1919年開張，20世紀20年代成為眾多作家的聚集場所，如龐德、歐內斯特海明威、詹姆斯喬伊斯、福特馬多克斯福特等「迷惘的一代」。這座書店在1940年德國佔領巴黎時期關閉，自此之後從未在此開張。
第二家莎士比亞書店坐落於巴黎第五區，1951年由喬治惠特曼（George Whitman）創辦，最開始的時候命名為「西北風（Le Mistral）」，為了表達對西爾維亞比奇書店的尊敬，於1964年改為莎士比亞書店。像西爾維亞一樣，惠特曼把書店的二層闢為圖書館，書堆間還有床鋪，成了文人聚會，甚至臨時棲居的場所。這家書店一直延續至今。
喬治惠特曼與美國東海岸作家來往密切，在50年代，書店成了「垮掉的一代」的作家在巴黎的聚點，金斯堡和威廉巴勒斯都在書店前的空地上朗誦過他們的作品。後來舊金山城市之光書店的店主當時也經常泡在這裡。
目前的書店既是普通的書店，也是供人閱讀的圖書館，尤其是英語文學，還曾出現在電影《日落之前》和《午夜巴黎》中。
書店的四壁都是頂到天花板的書架，滿架子的書擠得看不出一點縫隙，仿佛牆壁就是由書砌成的。這個傳奇的書店一直延續至今，不僅是巴黎最大的英文書店，還是法國文化部承認的文化學院，同樣也成為巴黎不容忽視的一大旅遊景點。
莎士比亞書店深受法國文人的喜愛，世界各地的文學愛好者慕名而來，很多世界名人曾現身書店之中，更為其增添了幾分神秘色彩。