柯南中最具亮眼的劇情莫過於和黑衣組織的對決了，而對決過程中，柯南最大的依仗就是工藤新一變小了這個秘密，一旦這個秘密被識破，那麼柯南就會隨時暴露在危險中。世上沒有不透風的牆，柯南的秘密也還是被其他人知道了，今天就暗時間順序盤點一下柯南身份被人點破的緊張瞬間。
一．《江戶川柯南誘拐事件》
江戶川柯南只是工藤新一的化名，世界上不存在這個人，自然，江戶川柯南也不會有父母。但是，毛利事務所卻來了這樣一個女人，她叫江戶川文代，自稱是柯南的媽媽。從毛利事務所把柯南帶走，第一次看這集時，小編本以為這個女人會因為小看柯南而被柯南戲耍，柯南也並不緊張，質問文代究竟是誰。結果文代獰笑著說出了柯南父母的身份，並且直接說出柯南就是工藤新一這件事。要不是後面還有幾百集，小編還以為柯南就要完結了。至於結局，因為結局太出人意外了，避免沒有看過這集的朋友被劇透，所以就不在這裡說了。
二．《福爾摩斯迷殺人案件》
在一群福爾摩斯迷中發生的案件，也是服部平次第二次登場，在這集中，柯南本來不會暴露，但是由於他自己作死。將平次麻醉，用平次的聲音進行推理，結果平次在中途就醒了過來，把柯南推理的聲音都聽了下來。作為西部的工藤新一，服部的推理能力也是毋庸置疑的，掌握到了這麼明顯的證據，自然輕鬆的推斷出了柯南就是新一的事實。在和柯南獨處時點破了這件事，最初柯南並不承認，但服部用告訴小蘭作為威脅，柯南只能把一切都招了。這一次完全是柯南自作自受，不過經過了這個事件，他和服部平次的關係也變得非常緊密，也算是因禍得福了。
三．《來自黑衣組織的女人》
柯南的班裡來了轉學生，名叫灰原哀，積極的少年偵探團成員立刻就把她拉進了團裡；灰原最初不打算加入，聽說柯南也在後才同意了。轉學的第一天一起解決了假鈔綁架案；在回家的路上向柯南講述A藥以及自己的身份。柯南最初不信，等灰原點破他身份後，柯南想到阿笠博士可能因為自己而被組織殺害，精神幾乎崩潰。跑到阿笠博士家後發現一切正常才鬆了口氣，那些話都是灰原開的玩笑。畢竟灰原是柯南裡最腹黑的人，現在再重溫這一集，看到柯南被灰原恐嚇的樣子，非常搞笑。灰原叛離組織後就成為了紅方的堅實戰力，多次為柯南提供A藥的解藥。
四．《漆黑的追蹤者》
前面三人雖然點破了柯南的身份，但畢竟是自己人，不會有什麼嚴重後果。這次發現柯南身份是黑衣組織成員愛爾蘭。他通過對比柯南與新一的指紋，發現了事情的真相。在某起案件中組織的一個成員被殺，事實上並非針對組織的案件。為了取回內存卡以及調查事件，易容成松本清長的身份，參與調查案件。在東京塔上，柯南識破了愛爾蘭偽裝成松本的事情，但愛爾蘭並不緊張，悠閒的喝著紅酒，並且反而說出了柯南就是新一的事情。這是柯南最危險的一次了，這次柯南不僅要逃跑，而且還必須擊敗愛爾蘭，保住自己的秘密才行。最後，愛爾蘭被琴酒射殺，永遠保守了這個秘密；某種意義上說，是琴酒拯救了柯南。
由於柯南的劇情到了後期，這種情節應該也很難出現了，下一次再出現這種情節的時候，估計就是紅與黑的決戰了。