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只要談起魚缸側濾系統，基本上就要和背濾結合在一起，因為二者原理完全相同，只是在魚缸內的位置不同罷了，再者就是過濾個體大小和濾材多少的問題了。
所以說，我們只講一個側濾大致上就可以代表背濾了。
不佔用魚缸外部空間，是魚缸側濾系統最大的優點
不管是背濾、側濾系統，二者都是需要在魚缸的內部，單獨開闢一片小天地，用來進行物理和生化過濾，因此來說，對於有一定擺放空間要求的魚缸來說，我們既不想要底櫃、也不想加個難看的上濾，更不想整天去倒騰那個濾桶，那麼，側濾或者背濾魚缸就是我們的首選。
很多魚友以為側濾系統，只會出現在以前的小型魚缸內，那樣看著更加的整潔、方便，其實不然。
大部分飼養錦鯉的地缸，都是使用的側濾系統，尤其是魚缸較長的，只會佔用一側空間，因為絕大部分錦鯉都是可以觀背的，欣賞起來的效果更佳，使用地缸飼養錦鯉，它們和主人的互動性會更好，我們飼養起來也會更有樂趣。
地缸要求水體寬大、直接在地面擺設，也不可能再去添加下濾系統，因此，側濾就是極佳選擇。
至於側濾系統的工作原理，和其他過濾系統差距並不大，缺點就是濾棉不太容易做到乾濕分離、以及佔用魚缸空間
側濾魚缸的工作原理，其實並不複雜，因為過濾系統在水中，魚缸的水流自然而然的就會進入過濾系統內，然後順著物理過濾、生化濾材，一層層的推進，最後由於水泵的吸力，把水流打回到魚缸內，前部的水位再次降低，魚缸水流又會緩緩流入到過濾倉內。
大致上就是這麼一個工作原理，和其他過濾形式的唯一區別就是濾棉泡在水裡，這個水流行進的道理和小外掛倒是差不多，只是小外掛是使用水泵直接進水，然後自然出水罷了，它的濾棉也是泡在水裡。
因此來說，一般的大型地缸都會設計單獨的沉澱倉，濾棉使用的數量不會很多，主要以毛刷為主。
也有部分魚友會在側濾之上加裝滴流盒，使用水泵把出水返流到滴流盒內，這就形成了有效地乾濕分離，不過，在較大水體的飼養密度下，以及沉澱倉和各種濾材的配合，殘餘雜質也會老老實實待在沉澱倉內，對於整體水質的影響可以忽略不計。
而小型側濾魚缸，在清洗濾棉的時候，有可能涉及到雜質回流到過濾中，這就看我們濾棉的擺放方式了，擺放好的，完全可以避免這個問題。
目前由於底濾、上濾以及滴流盒的流行，一般的小魚缸，不太選擇使用側濾系統了，關鍵還有一個問題，就是佔用魚缸的飼養空間，尤其是小魚缸，本來就養不幾條魚。
但這不是說，側濾系統就是有其完全避免不了的缺點，關鍵還是在於水質調理和觀賞魚的飼養密度，只要是飼養密度一大，什麼過濾也會照樣出問題的。
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