即將於9月23日正式開始運營的廣深港高鐵香港段傳來了最新消息：12306鐵路購票APP已經將「香港西九龍站」更新入系統，查詢開通首日（23日）香港西九龍開往深圳北的線路，已顯示有G5754和G5752兩班車次，但是暫時無法進行購票操作。
9月1日，香港西九龍站首次舉辦公眾開放活動，港鐵公司在回應公眾和媒體時表示預計自9月10日起，港鐵將開始預售廣深港高鐵自香港西九龍站始發的高鐵車票。
根據港鐵之前公布的信息，香港方面發售的高鐵車票票價將以人民幣按一定的公布匯率折成港幣計價。在香港西九龍站內可以異地購買內地段高鐵車票，手續費為10至30元港幣。
對於廣深港高鐵香港段能否通過12306網站購票，港鐵公司此前透露相關事宜正在協調商討之中。現在看來這一購票渠道即將落實。目前，登陸12306鐵路購票APP查詢，已顯示有「香港西九龍站」，但是開通首日線路僅能查詢到香港西九龍開往深圳北的兩列車次G5754和G5752，且暫時無法進行購票操作。另一方面，在網頁版12306網站中，西九龍站尚未更新入系統。
此前據央視報導，香港特區政府宣布，廣深港高鐵定於9月23日正式通車。第一班車將由早上七點由香港西九龍站發出，到達深圳北，票價為86元港幣。
高鐵香港段開通運營後，將能到達內地44個站點，包括38個長途站點和6個短途站點。高鐵香港段的開通，將香港納入了全國高鐵網絡，可直達內地深圳、汕頭、廈門、福州、南昌、杭州、長沙、武漢、鄭州、石家莊、貴陽、桂林、昆明、上海、北京等城市。短途如由香港西九龍站出發到深圳福田只需14分鐘，而最長途到北京，也只需8小時56分鐘。據了解，目前從北京出發前往香港紅磡車站的Z97次列車，耗時在24小時以上。
據香港特區政府公布的《廣深港高鐵（一地兩檢）條例》，西九龍站採取「一地兩檢」方式，在同一樓層設香港口岸區和內地口岸區，以節省通關時間。內地居民乘坐高鐵抵達香港之後，可以直接在高鐵站辦理內地出關和香港入關手續。該條例於9月4日起正式施行。