太廟，是皇帝的家廟，是封建王朝皇帝祭祀自己先人的地方。
太廟在不同時代有不同的稱呼，夏朝的時候被稱為"世室"；商朝時稱"重屋"；到了周朝則被稱之為"明堂"，自秦漢起，在被稱為"太廟"，以後歷朝都沿用了這個名字。
明朝原來的首都是南京，明永樂十九年（1421年），因靖難之役登上皇位的明成祖朱棣，正式將首都遷至北京；作為明朝皇帝家廟的太廟，也隨之從南京遷到了北京。
此後直到明朝滅亡，北京一直是大明國都，時間長達二百二十多年。成祖和其之後的十四代皇帝，都在此登基，也在此去世，死後也都進了太廟享受祭祀。在太廟接受供奉的，除了明太祖朱元璋和明朝歷代皇帝，朱元璋的四代祖先（追贈為德祖、懿祖、熙祖、仁祖），也都擁有一牌之地。
明崇禎十七年（1644年）4月25日，李自成的大順軍攻破北京城，頭一天崇禎來到煤山自盡，統治了中國276年的大一統的明朝宣告滅亡。
42天後李自成撤離北京，攝政王多爾袞率領清兵進京，同年9月順治帝也來到紫禁城，坐上龍椅，開始了對中國200多年的統治。
順治皇帝登基之後，隨即就將自己的前輩清太祖努爾哈赤、清太宗皇太極的牌位，以及清太祖追贈的四代祖先（肇祖、興祖、景祖、顯祖）牌位自盛京（瀋陽）原清室太廟遷到了北京的太廟。
天無二日民無二主，國家也不能有兩座太廟。
清朝定都北京，就成為北京的新主人，明朝太廟就變成了清朝的，裡面供奉的皇帝以及他們的先人，自然要被請出去。
其實順治進京的時候，天下大局未定，李自成、張獻忠的部隊和南明小朝廷的軍隊還佔據著半壁江山。
但是順治皇帝還是急不可待地把明朝皇帝請出太廟，讓自己先人的牌位入住太廟。
因為這樣就等於向天下百姓宣布，清王朝受命於天，明朝滅亡是天意，江山已經換主人了，天都變了，大家要認可我這個新主人，不要再為明朝效力了，因為所謂的太廟，也是江山社稷的象徵。
那麼，在新"主人"進駐之後，明朝的歷任皇帝和朱元璋的四代祖宗牌位都弄哪去了？
不得不說，在這個問題上，清朝統治者還是很精明，處理得非常好的。
清朝統治者雖然恨不得將明朝的"餘孽"斬盡殺絕，打倒在地踏上一隻腳，讓他永世不能翻身，但他們的政治手腕還是非常高明的。
比如清軍入關，明擺著就是要奪朱家江山的，但是人家偏說是為崇禎報仇，說李自成才是滅亡大明的罪魁，因此來收買人心，讓漢人精英為他們效力，讓百姓把他們看作正統。
再比如，李自成進京之後，草草將崇禎埋葬，順治卻用上等棺木厚葬崇禎，讓百姓為前皇帝服喪三日。
不得不說，跟李自成比起來，在收買人心方面，清朝統治者技高一籌。
既然要收買人心，明朝皇帝的牌位也不能扔到大街上。可是往哪裡放呢，順治身邊的漢族大臣出了個金點子，說明朝嘉靖年間，北京曾經修建了一座"歷代帝王廟"，裡面供奉的是中國曆朝歷代皇帝配位。順治一聽茅塞頓開，就把原來在太廟供奉的明太祖的神主移到歷代帝王廟裡。
順治三年（1646年），其他明朝皇帝的牌位，也全部被"安置"到了歷代帝王廟。
康熙六十年（1721年），康熙帝一次會議上發表講話說："朕披覽史冊……前代帝王雖無過失，亦必刻意指摘，論列短長，全無公是公非，前代帝王曾為天下主，後世之人俱分屬其臣子，而可輕肆議論、定其崇祀與不崇祀乎，凡曾在位，除無道被弒、亡國之主外，應盡入廟崇祀。"
康熙這段蓋棺論定的話的意思是說，歷史不能割裂，歷代帝王都應該得到尊重，但是那些無道昏君，對不起沒有這樣的資格。
誰是明朝的無道昏君呢，康熙認為是神宗、光宗、熹宗這個三個傢伙，崇禎帝不該為明朝滅亡背鍋，因此神宗、光宗、熹宗三個神主則被趕出了歷代帝王廟。
康熙還認為，朱棣這個皇帝是發動叛亂當上的，來路不正，沒有享受祭祀的資格，所以朱棣的牌位被請了出去。
乾隆四十三年（1778年），乾隆帝提出"中華統緒，絕不斷線"的口號，給之前沒有能入廟祭祀的十六國、十國、三國、晉、隋等朝代有代表性的皇帝設立牌位，讓他們入廟接受祭祀，並把之前被請出來的朱棣的牌位也請了進去。
估計朱棣當時也一臉懵逼，昨天趕，今天請，把朕當猴耍？
不管怎麼說，大多數明朝前皇帝，在明朝滅亡後，總算有了一個歸宿。