1月23日，針對新型冠狀病毒感染的肺炎疫情，中國民用航空局（以下簡稱民航局）再次向全行業下發緊急通知，要求湖北機場集團向各運輸航空公司提出削減涉漢航班的建議，各運輸航空公司及時制定進出武漢機場的航班削減方案，民航各單位要採取更細緻、更深入、更紮實的舉措，做好新型冠狀病毒感染的肺炎疫情防控工作。
民航局要求湖北機場集團根據武漢市政府疫情防控措施和地面保障能力，向各運輸航空公司提出削減航班的建議；各運輸航空公司及時制定進出武漢機場的航班削減方案並組織做好實施工作；民航局運行監控中心加強組織協調，確保航班削減方案落實；武漢地區民航相關單位要加強協同配合，共同做好航班削減後的安全運行和旅客服務工作，確保武漢地區民航運行安全有序。
為保障民航從業人員安全，民航局要求行業各單位加強對從業人員的個人防護，在人群密集等情況下採取佩戴口罩等防護措施。
民航局通知指出，各運輸機場要加強對候機樓防疫防控用品售賣價格的監管，嚴禁哄抬物價。
民航局提醒經營至武漢航線航班的外國及港澳臺地區航空公司，應密切關注疫情發展情況，加強研判，必要時對本公司航班計劃進行調整。
1月23日，武漢機場計劃進出港航班566班，截至11時30分，共取消了288班。
為協助旅客更好地安排出行計劃，切實保障旅客利益，中國南方航空公司（以下簡稱南航）制定了相關退改民航客票的規定，以下三類旅客可享受特殊退改政策：
首先是奮戰一線的醫療工作者。如果是一名醫護人員，需要趕往救治病患或留守醫院，造成行程取消，可憑工作證在客票有效期內免費退票。客票不限於武漢進出港，旅行日期適用於2020年1月1日（含）至2020年3月29日（含），且為南航實際承運航班及掛CZ航班號的代碼共享航班。
第二類是購買了涉及武漢航班客票的旅客。僅限在2020年1月31日（含）前購買，旅行日期為2020年1月1日（含）至2020年3月29日（含），涉及武漢的南航實際承運航班及掛CZ航班號的代碼共享航班的784客票。
第三類是身體狀況特殊的旅客。有發熱、疑似新型冠狀病毒肺炎、被確診為新型冠狀病毒肺炎或與其有密切接觸的旅客，可憑縣級（含）以上醫療機構診斷證明在客票有效期內免費退票。客票不限於武漢進出港，旅行日期適用於2020年1月1日（含）至2020年3月29日（含），且為南航實際承運航班及掛CZ航班號的代碼共享航班。
中國聯合航空公司發布了《關於涉及武漢航線退票的補充公告》，適用於持822開頭的客票，未使用航段中有一段以上的航班旅行日期在2020年1月1日（含）至2020年3月29日（含）期間，涉及中國聯合航空的國內、國際航班（含掛KN航班號的代碼共享航班，不限武漢進出港）。因本次事件造成行程取消的所有奮戰一線的醫療系統人員，持工作證和有效身份證件可在客票有效期內至原購票渠道免費辦理退票。凡是密切接觸者、發熱、疑似新型冠狀病毒肺炎、被確診為新型冠狀病毒肺炎的乘客，可憑縣級（含）以上醫療機構診斷證明在客票有效期內可至原購票渠道免費辦理退票。