據網上小道消息傳言，霓虹人民是非常有計劃的，如果不提前預訂酒店直接上門，即使有房也不一定會讓入住，而且會被鄙視為「失禮的人」，所以提前預訂酒店是絕對必要的。何況櫻花季，京都的酒店熱火無比，不提前訂的同學可以考慮體驗日本街頭幕天席地睡一晚。當然，如果臨時去可以找找看「love hotel」據說非常有特色，你們懂的。
訂酒店對於自助遊的人來說，一定首要是滿足出行需求。所以交通便利度要提前考慮。樓主在地點上有如下建議：
東京的酒店建議住東京都地鐵站或新宿地鐵站附近，兩個地方都是地鐵大交點，也是新幹線的乘坐處。東京都地鐵站離銀座、築地魚市和迪士尼、上野距離都比較近，新宿沒住所以沒關注，但是感覺夜生活比較豐富購物方便，離原宿、六本木比較近。
京都的酒店建議在烏丸御池或者最好四條河源町（地鐵站名），四條河源町周邊有一堆日式風情民俗旅館，榻榻米很好玩一定要嘗試一下。
大阪的酒店建議在難波附近靠近，最好靠近道頓崛心齋橋，晚上餓了去道頓崛覓食很方便。
酒店預訂方便一般都選擇agoda\booking，另外有個一休日本自由行的訂房也不錯，價格比agoda實在很多，但是就是沒有中文網頁，要麼上日本網頁查，要麼打電話求推薦。
另外京都民宿方面，借鑑馬蜂窩某強人的推薦：
頂級類
京都有三大頂級日式旅館，被稱為「御三家」，分別是『俵屋』、『柊家』、『炭屋』，世界各國名人都曾選擇入住，從裝飾到服務到飲食都無可挑剔：
✿ 京都俵屋 http://www.tawaraya.co.jp/ ，たわらや，超過三個世紀的悠久歷史，被稱為全球最傑出住宿場所之一
✿ 京都佟家 http://www.hiiragiya.co.jp/ ，高雅的一流日式旅館，有新館與舊館，新的設施更好一些，舊的相對古典優雅，在預訂時要注意區分，按自己的喜好選擇
✿ 京都炭屋 http://www2.odn.ne.jp/sumiya/index.html ，這家並未在LP上推薦，我查詢了臺灣的背包客網站上得知，也是非常出色的。
高級類
❉ 佟家別館 http://www.hiiragiya.co.jp/bekkan/ ，從名稱就可以看出，是佟家的分店，如果感覺總店的價格有些超預算，那麼這裡是個相對合適的選擇—— 相似的住宿條件，相對低廉的費用（只是相對總店而言）
❉ 白梅料理旅館 http://www.shiraume-kyoto.jp/ ，這是一家位於祗園四條附近的旅館，雖然未被LP推薦，也未曾受臺灣背包客追捧，但網上對她的好評率非常高，列為全京都酒店中排名第一。
❉ 元奈古旅館 http://www.motonago.com/zh-CN/top.html ，連續幾年入選《米其林指南》，網站還很罕有的提供中文簡體（預約版面仍只有日文與英文）
樓主本來想嘗試一次這些頂級民宿，畢竟是蜜月遊，但是後來一查價格，櫻花季一晚價格在5000人民幣以上，小農的樓主覺得一晚一個iphone實在逆天，遂放棄。
樓主選擇的酒店是：
東京：Hotel Ryumeikan Tokyo（東京龍名館）
此行評價最高酒店，東京都八重洲南口出來往左看啊就在斜對面。酒店大堂不在一樓，但是大廳吧非常漂亮，落地窗望出去神清氣爽。房間不大是日本通病，但是反正只是睡覺所以可以接受。房型是Forus Semi Double – designed comfort sleep，床很有意思會有睡眠系統和叫醒系統，睡覺起床的時候床會震動然後有音樂輔助，不得不說那個音樂真的很好聽。。。推薦。洗手間在冬天會讓你覺得很幸福因為馬桶有加熱。。。（好丟臉），配的洗漱用品簡直可以用大跌眼鏡來形容，除了平時國內有的，還有男生和女生的（分開的）洗面奶、化妝水、乳液、潤 膚乳（重點是男生的=.=），據某人說洗面奶比國內的好用太多，所以我們又小農的帶了回來。價格大概是1100RMB一晚上，旁邊有一條櫻花街非常漂亮。 PS，這個酒店入選米其林精選了 LP也有推薦。
京都：京都蒙特雷酒店
這個酒店是在一休預訂的，後來一看比agoda便宜了很多，也在地鐵站旁但是距離四條河源町有15分鐘的步行距離，英式風格，裝修比東京那個老了一些，房間大小差不多。酒店可以泡溫泉。價格大概是900RMB左右。
京都2：Guest Inn Chita
這個旅館是日式民居，在東本願寺對面小巷裡，是背包客很喜歡的地方，房間是日式榻榻米設計，無獨立衛生間。老闆娘很可愛。可以嘗試，但是清潔情況一般誒。價格很歡樂，500RMB。（櫻花季什麼的最討厭了。）
大阪：Hotel il Cuore Namba
地鐵難波站哪個出口忘記了，也找了一會兒，類似七天的設計，房卡和前臺設計都比較先進。價格700RMB。