一、受理部門
內地居民申請往來港澳通行證和籤注，應向本人常住戶口所在地公安機關出入境管理部門提出申請，但有下列情形之一的，按照相應規定提交申請：
（一）內地居民申請赴香港或者澳門商務籤注，向本人工作單位所在地公安機關出入境管理部門申請。
（二）內地居民通過勞務經營公司申請赴香港或者澳門逗留籤注，向勞務經營公司所在地設區的市級以上（含，下同）公安機關出入境管理部門申請。
（三）軍人申請往來港澳通行證和籤注，向部隊或者工作單位駐地公安機關出入境管理部門申請。
（四）內地居民持逗留籤注赴香港後，在香港或者返回內地期間再次申請逗留籤注（包括同時補、換發往來港澳通行證），或者在香港申請赴澳門其他籤注，可向廣東省公安廳深圳出入境籤證辦事處（以下簡稱深圳籤證辦）申請。
（五）內地居民持逗留籤注赴澳門後，在澳門或者返回內地期間再次申請逗留籤注（包括同時補、換發往來港澳通行證），或者在澳門申請赴香港其他籤注，可向廣東省公安廳珠海出入境籤證辦事處（以下簡稱珠海籤證辦）申請。
符合公安部規定的在非常住戶口所在地申辦往來港澳通行證、籤注條件的，可按照規定向有關地方公安機關出入境管理部門申請。
二、申請手續
（一）內地居民單獨申請往來港澳通行證，應當按要求填寫申請表，回答有關詢問並提交下列材料：
1、提交符合《出入境證件相片照相指引》標準的申請人照片；
2、交驗申請人居民身份證原件，申請人未滿16周歲，也可交驗居民戶口簿；軍人應交驗軍人身份證明。上述身份證件須留存複印件或者電子掃描圖片；
3、按規定提交或者核驗指紋信息；
4、按照公安部有關規定在非常住戶口所在地申請往來港澳通行證的，還須提交符合在非常住戶口所在地申請條件的證明；
5、軍人、登記備案的國家工作人員，應當提交本人所屬單位或者上級主管單位按照人事管理權限審批後出具的同意辦理出入境證件的函；
6、未實行按需申領護照地區的內地居民，還須按照有關規定出具相關證明材料。
（二）內地居民申請往來港澳籤注，應當按要求填寫申請表，回答有關詢問並提交下列材料：
1、有效往來港澳通行證（同時申請往來港澳通行證的除外）；
2、與申請事由相關的申請材料；
3、按照公安部有關規定在非常住戶口所在地申請往來港澳籤注的，還須提交符合在非常住戶口所在地申請條件的證明；
4、軍人、登記備案的國家工作人員，應當提交本人所屬單位或者上級主管單位按照人事管理權限審批後出具的同意辦理出入境證件的函；
5、未實行按需申領護照地區的內地居民，還須按照有關規定出具相關證明材料。
內地居民同時申請往來港澳通行證和籤注的,無須重複提交相關材料。
（三）申請人提交或者核驗指紋信息的具體規定如下：
1、申請人必須本人前往受理部門或者有關指定機構提交或者核驗指紋信息。
2、對申請往來港澳通行證的十六周歲（含）以上的申請人均應當採集或者核驗指紋，因指紋缺失、損壞原因無法採集指紋除外;對十六周歲以下的，根據監護人的意見確定是否採集指紋。
3、對在本省、自治區、直轄市公安機關出入境管理部門留存過指紋信息的，無須再次採集指紋，但須進行指紋核驗；核驗未通過，經調查身份屬實的，重新採集指紋。
4、已持有往來港澳通行證和逗留籤注的申請人在港澳地區期間，申請換發或者補發往來港澳通行證，無須進行指紋核驗。
5、指紋採集工作參照《電子普通護照指紋採集操作規範（試行）》實施。
（四）各類事由申請條件及相關的申請材料
1、探親。
（1）申請條件：探望在香港或者澳門定居、長期居住、就學或者就業的親屬；申請人的配偶、未滿18周歲子女可隨同申請。「親屬」是指配偶，父母或者配偶的父母，子女或者子女的配偶，兄弟姐妹，（外）祖父母、（外）孫子女；「隨同申請」是指與主申請人同時申請相同有效期和次數的探親籤注。
外交部駐香港或者澳門特派員公署、中央人民政府駐香港或者澳門聯絡辦公室工作人員、中國人民解放軍駐香港或者澳門部隊幹部的內地親屬申請赴香港或者澳門探親，另行規定。
（2）申請材料：提交被探望親屬在香港或者在澳門定居、長期居住、就業、就學證明複印件，交驗親屬關係證明原件，並提交複印件。
親屬在香港定居的，提交香港居民身份證、港澳居民來往內地通行證複印件，親屬是外國籍的，提交香港永久性居民身份證、外國護照複印件；
親屬在香港長期居住的，提交香港居民身份證、有效期一年以上的有效香港進入許可以及有效旅行證件複印件；
親屬在香港就業、就學的，提交相應香港進入許可複印件以及有效旅行證件複印件。
親屬在澳門定居的，提交澳門居民身份證、港澳居民來往內地通行證複印件，親屬是外國籍的，提交澳門永久性居民身份證、外國護照複印件；
親屬在澳門長期居住的，提交澳門居民身份證或者澳門特別逗留證、有效旅行證件複印件；
親屬在澳門就業的，提交澳門主管部門批准在澳門就業的證明文件複印件、有效旅行證件複印件；
親屬在澳門就學的，提交澳門高校錄取通知書或者在學證明書複印件、有效旅行證件複印件。
親屬關係證明包括：結婚證、出生證、載明親屬關係的戶口簿、戶口所在地公安派出所出具的親屬關係證明、其他能夠證明親屬關係的具有法律效力的證明。
兩年內再次申請赴香港或者澳門探望同一親屬（配偶和姻親除外）的，免交親屬關係證明。
2、商務。
（1）申請條件：企業機構人員、個體工商戶經營者赴香港、澳門從事商務活動的或者駕駛專用交通工具往返廣東省與香港或者澳門。「企業機構」是指經國家工商管理部門登記註冊，具有獨立法人資格的企業及其分支機構；在國家稅務部門辦理了稅務登記的從事生產經營活動的機構；境外企業常駐內地代表機構。申請多次商務籤注的，企業機構須事先向所在地有審批權的公安機關出入境管理部門備案。
（2）申請材料：交驗工商營業執照副本或者有關登記證書、稅務登記證書並提交複印件；企業機構人員還須提交企業機構為本人交納社會保險的憑證（申請多次商務籤注的，須連續6個月以上繳納社會保險）或者本人屬於該企業機構的有關證明文件；企業機構出具的赴港澳商務活動事由說明。
企業機構在備案時已提交過上述有關證明材料的，企業機構人員在備案有效期內申請商務籤注時無須重複提交有關證明材料。
3、團隊旅遊。
（1）申請條件：參加國家旅遊局指定旅行社組織的團隊赴香港或者澳門旅遊。
（2）申請材料：免交與申請事由相關的申請材料。
4、個人旅遊。
（1）申請條件：開辦個人赴港澳旅遊業務城市的常住戶口居民，或者符合公安部規定條件的非常住戶口居民，申請個人赴香港或者澳門旅遊。
（2）申請材料：免交與申請事由相關的申請材料。
5、逗留。
（1）申請條件：經香港有關部門批准赴香港隨任、就學、就業、居留、培訓以及作為受養人赴香港依親的；經澳門有關部門批准赴澳門隨任、就學、就業人員，經澳門有關部門批准赴澳門居留的就業人員親屬。
（2）申請材料：赴香港隨任、就學、就業、居留、培訓人員或者作為受養人赴香港依親的人員，須交驗香港入境事務處出具的相應進入許可原件，並提交複印件。通過勞務經營公司申請赴香港就業的，還須提交有關地方商務主管部門出具的《對香港特別行政區勞務合作項目審核表》複印件。逗留籤注有效期屆滿，繼續申請逗留籤注的，交驗香港入境事務處出具的延期許可原件，並提交複印件。
赴澳門隨任，須提交中央人民政府駐澳門特別行政區聯絡辦公室人事部出具的《駐澳門內派人員未成年子女隨任身份證明表》。
赴澳門就學，須交驗澳門高等教育輔助辦公室出具的《確認錄取證明書》及澳門高等院校錄取通知書原件，並提交複印件；逗留籤注有效期屆滿，繼續申請逗留籤注的，提交澳門高等院校出具的在學證明原件。
赴澳門就業，須交驗澳門治安警察局出入境事務廳出具的《「外地僱員逗留許可」名單》或者澳門人力資源辦公室、澳門社會文化司出具的有申請人姓名的批准文件原件，並提交複印件；通過勞務經營公司申請赴澳門就業，還須提交有關地方商務主管部門出具的《對澳門特別行政區勞務合作項目審核表》複印件；逗留籤注有效期屆滿，繼續申請逗留籤注的，提交澳門治安警察局出入境事務廳出具的有申請人姓名的續期名單表，或者交驗澳門人力資源辦公室、澳門社會文化司出具的有申請人姓名的批准文件原件，並提交複印件。
赴澳門就業人員的親屬，須交驗澳門治安警察局出入境事務廳出具的批准通知書原件，並提交複印件。
6、其他。
（1）申請條件：因治病、奔喪、探望危重病人、訴訟、應試、處理產業、學術交流等特殊事由申請赴香港或者澳門；持逗留籤注在香港（澳門）期間，申請前往澳門（香港）的。
（2）申請材料：持逗留籤注在香港（澳門）期間申請赴澳門（香港）的，須交驗往來港澳通行證及逗留籤注原件，並提交複印件。因其他特殊事由申請赴香港或者澳門，須交驗與申請事由相關的申請材料原件，並提交複印件。
四、申請方式
申請人須本人提出往來港澳通行證和籤注申請，但有下列情形之一的，按照相應規定提交申請：
1、未滿16周歲人員申請往來港澳通行證的，由監護人或者監護人委託他人陪同申請。監護人應當提交監護證明（如出生證明、戶口簿等）、居民身份證等身份證明並留存複印件；監護人委託他人陪同的，還須提交委託書以及陪同人的居民身份證等身份證明並留存複印件。
2、已持有效往來港澳通行證，在原往來港澳通行證或者原籤注申請受理部門申請籤注的，可以委託他人代為申請。委託他人代為申請的，委託人須出具委託書，被委託人須交驗本人居民身份證原件，並提交複印件。申請人在港澳地區的，不得委託他人代為申請。
3、已持有效往來港澳通行證，通過勞務經營公司組織赴香港或者澳門就業的，以及在港澳就業期間繼續申請逗留籤注的，可由勞務經營公司代為申請逗留籤注。勞務經營公司須事先將公司印章、負責人籤名向勞務經營公司所在地有關公安機關出入境管理部門備案。
4、內地居民按照有關規定在香港或者澳門向深圳或者珠海籤證辦提出申請的，可通過香港或者澳門中國旅行社提交有關申請材料。
五、各類籤注籤發規定
（一）探親籤注（T）
探望兄弟姐妹、（外）祖父母、（外）孫子女的，可籤發3個月一次籤注，在香港或者澳門逗留不超過14天；
探望配偶、父母或者配偶的父母，子女或者子女的配偶的，可籤發3個月多次籤注，在香港或者澳門逗留不超過自首次進入之日起90天；
申請赴港澳地區探望配偶且與港澳配偶生育有未成年子女的，可以籤發1年多次籤注，每次在香港或者澳門逗留不超過90天。
有特殊家庭困難的，經省級公安機關出入境管理部門核准，可以籤發1年多次籤注，每次在香港或者澳門逗留不超過90天。
對隨同申請人可籤發與主申請人有效期、有效次數相同的探親籤注。
（二）商務籤注（S）。
1、已備案的企業機構人員，根據備案規定，可以籤發3個月一次籤注、3個月多次籤注、1年多次籤注（赴澳門籤注除外），每次在香港或者澳門逗留不超過7天。
2、未備案的企業機構人員，個體工商戶經營者，籤發3個月一次籤注，在香港或者澳門逗留不超過7天。
3、駕駛往返廣東省與香港或者澳門專門交通工具人員，可以籤發3個月多次籤注或者1年多次籤注，每次在香港或者澳門逗留不超過7天。
（三）團隊旅遊籤注（L）。申請赴香港，可以籤發3個月一次籤注、3個月二次籤注、1年一次籤注、1年二次籤注，每次在香港逗留不超過7天；屬於公安部出入境管理局規定的特別情形的，可籤發3個月一次籤注，每次在香港逗留不超過3天。申請赴澳門，可以籤發3個月一次籤注、1年一次籤注，每次在澳門逗留不超過7天。
（四）個人旅遊籤注（G）。申請赴香港，可以籤發3個月一次籤注、3個月二次籤注、1年一次籤注、1年二次籤注，每次在香港逗留不超過7天；對經批准實施多次「個人遊」試點政策的城市居民，符合公安部規定條件的，可按照有關規定籤發1年多次籤注，每次在香港逗留不超過7天。申請赴澳門，可以籤發3個月一次籤注、1年一次籤注，每次在澳門逗留不超過7天。
（五）逗留籤注（D）。
1、赴香港隨任、就學、就業、居留、培訓以及作為受養人赴香港依親的人員，籤發多次籤注；籤注有效期按照香港入境事務處籤發的進入許可的最長有效期籤發。持證人應當按照香港進入許可的規定入出香港。
2、赴澳門隨任、就學、就業以及就業人員的親屬，籤發多次籤注。赴澳門隨任，籤注有效期按照中央人民政府駐澳門特別行政區聯絡辦公室人事部出具的《駐澳門內派人員未成年子女隨任身份證明表》上的擬申請籤注有效期籤發；赴澳門就學，籤注有效期按照澳門高等教育輔助辦公室出具的《確認錄取證明書》批准的學習期限籤發，但最長不超過1年。赴澳門就業，籤注有效期按照澳門治安警察局出入境事務廳或者澳門人力資源辦公室、社會文化司批准的期限籤發。赴澳門就業人員的親屬，籤注有效期按照澳門治安警察局出入境事務廳批准的期限籤發。持證人每次在澳門逗留不超過澳門逗留許可有效期。
（六）其他籤注（Q）。
可以根據事由籤發3個月一次籤注、3個月二次籤注；有特殊情形確需多次前往香港或者澳門的，可籤發3個月多次籤注；每次在香港或者澳門逗留不超過14天。
六、籤發往來港澳通行證規定
往來港澳通行證的有效期分為5年和10年兩種：有效期為5年的往來港澳通行證發給申請時未滿16周歲的申請人；有效期為10年的往來港澳通行證發給申請時16周歲（含）以上的申請人。
七、換發、補發
（一）換發、補發的情形。往來港澳通行證持證人具有下列情形之一的，可以申請換發或者補發往來港澳通行證：
1、往來港澳通行證損毀、遺失或者被盜搶的；
2、往來港澳通行證有效期不足6個月，或者短於擬申請籤注有效期的；
3、個人身份信息變更的；
4、補充申請免登記使用港澳自助通關服務的；
5、持本式往來港澳通行證需換發電子往來港澳通行證的；
6、其他確需換發、補發往來港澳通行證的情形。
（二）申請材料。
1、內地居民在內地申請換發、補發往來港澳通行證，應按照首次申請往來港澳通行證的規定提交相關申請材料。
2、逗留籤注持有人在香港或者澳門申請換發、補發往來港澳通行證並申請逗留籤注的，須提交填寫完整的申請表、香港入境事務處或者澳門有關部門出具的確認其相關身份的證明。
八、辦證時限
公安機關出入境管理部門受理往來港澳通行證申請後，應當在10個工作日內予以籤發；單獨受理籤注申請後，應當在7個工作日內予以籤發。因所在地區交通不便或者因特殊情況，不能按期籤發的，經省級公安機關出入境管理部門批准，籤發時間可以延長至20個工作日。
按照公安部有關規定在非常住戶口所在地申請往來港澳通行證、籤注的，公安機關出入境管理部門應當在30日內予以籤發。
內地居民因赴港澳地區治病、探望危重病人、奔喪等特殊情況急需申請往來港澳通行證、籤注的，公安機關出入境管理部門應當按照急事急辦原則，優先審批辦理。
九、特殊情形
（一）內地居民所持往來港澳通行證在香港或者澳門遺失或者損毀，可通過香港或者澳門中國旅行社向深圳籤證辦或者珠海籤證辦申請一次有效出入境通行證返回內地。
（二）持逗留籤注在香港或者澳門的內地居民，返回內地期間，往來港澳通行證及逗留籤注遺失、損毀或者失效，因特殊情況急需返回香港或者澳門，可以向深圳籤證辦或者珠海籤證辦申請一次有效出入境通行證返回香港或者澳門。
（三）定居國外的中國公民來內地後需前往香港或者澳門的，可向居住地設區的市以上公安機關出入境管理部門申請往來港澳通行證和一次或者二次有效其他籤注。申請人除按規定填寫申請表及提交相應事由證明材料外，還須交驗中國護照和定居國外證明原件，並提交複印件。