根據土耳其方面報導稱，雖然土耳其10萬大軍出兵敘利亞，包括在利比亞部署了超過3500人，但是這依然沒有阻攔土耳其總統埃爾多安繼續對土耳其土耳其軍隊內部調查，進行「大清洗」的動作！土耳其方面報導稱，土耳其軍隊未遂的軍事政變中，葡萄牙特種部隊代表團在政變中暗中支持土耳其軍隊，葡萄牙又遭到土耳其調查。土耳其情報局情報文件顯示，葡萄牙特種兵代表團訪問土耳其，是承擔了美國CIA情報局提供的任務。
土耳其情報局秘密文件透露，土耳其政府秘密調查了來自北約盟國葡萄牙的軍事代表團。根據土耳其情報局獲得的文件，葡萄牙總參謀部聯合行動副司令，洛倫科少將率領的代表團計劃訪問土耳其特種部隊總部。
土耳其警察對該代表團進行了秘密調查，並向土耳其第四軍司令部要求提供有關葡萄牙代表團訪問土耳其時所進行的行動以及具體活動和交流人群等所有信息，作為未遂政變調查的一部分。土耳其情報局發現了這些葡萄牙軍官就是受到了美國指派，參與了秘密支持土耳其軍隊政變的行為。葡萄牙代表團由五名不同級別的軍官組成，主要在葡萄牙特種部隊任職。這次訪問是官方層級的國外軍事高層訪問計劃的一部分，屬於信息交流和擴大兩軍之間關係的範圍。葡萄牙作為北約的創始國，自1950年代以來一直在北約的作戰地區與土耳其密切合作。
葡萄牙代表團由阿圖爾·阿爾維斯上校、內爾森·索羅埃中校、裡卡多·席爾瓦中校，法裡尼亞上校組成。葡萄牙總參謀部特種部隊司令部向伊斯坦堡和安卡拉的中央司令部發出了緊急信息，一位上校被任命為負責協調土耳其政變軍官出擊，向北約、美國發送情報的任務。而在土耳其軍隊政變失敗後，葡萄牙代表團還協助大批土耳其軍官逃跑。土耳其內政部長蘇萊曼·蘇伊魯很快將矛頭指向了美國，北約，土耳其要求美國及北約對其立場進行一些自我批評和檢討。
而土耳其埃爾多安總統，以軍事政變為藉口解僱了約4000名土耳其軍隊高級軍事人員，這些人員曾在歐洲和美國的北約工作。政變失敗後，大批土耳其軍官被大清洗多次，在北約軍官被清洗後，北約最高指揮官美軍將領柯蒂斯·斯卡帕羅蒂說，土耳其的軍事清洗已經「貶損」了北約，而且他不認為被土耳其清洗的土耳其軍官，參與了2016年的軍事政變。
而土耳其在過去四年中經歷了不斷加深的對軍隊打擊，土耳其軍事政變失敗後，包括州長，法官，教師和士兵在內的13萬多名公職人員被解僱，約6萬人被指控從事武裝活動。政變發生後，埃爾多安將幾乎所有土耳其高級軍官從土耳其武裝部隊中撤出，這項政策嚴重損害了土耳其與北約的關係，相反，土耳其與俄羅斯發展了更緊密的關係。隨後，土耳其總統埃爾多安，將土耳其的議會制度改為行政總統職位，並推動對敘利亞的軍事入侵。