國際首個蘭科藤本植物完成基因組測序

國際首個蘭科藤本植物完成基因組測序

2015-02-07 23:13:40來源：中國新聞網作者：責任編輯：

　　中新網福州2月7日電 (記者 龍敏)福建農林大學7日對外通報，已完成深圳香莢蘭基因組測序的全部工作。這標誌著香莢蘭成為國際上第一個完成測序的蘭科藤本植物，意味著人類將獲取第一個重要香料植物的基因組圖譜。

　　據了解，香莢蘭(Vanillasp。)為蘭科香莢蘭屬植物，又名香子蘭、香草蘭、香草、香蘭，是典型的熱帶雨林中的一種大型蘭科香料植物，並因其獨特而無法人工合成的香味，被廣泛應用於食品、化妝品、菸草等行業，被譽為「香料皇后」。現今，香莢蘭已是僅次於藏紅花的世界第二昂貴香料，在美國市場上每公斤香莢蘭果莢高達90美元，而且前景廣闊，行情看漲。

　　福建農林大學校長蘭思仁教授介紹，蘭科植物佔全世界植物種類10%，是世界性的瀕危物種，是植物界最大和進化程度最高的家族之一，是生物多樣性和進化研究以及生物保護的「旗艦」和理想的模式類群，具有極高的科研、生態、觀賞、文化和藥用價值，是中國最珍貴的野生植物資源之一。

　　蘭思仁說，由於目前全球尚未有對香莢蘭進行基因組測序及分析的成功案例，而其所在的香莢蘭亞科在基因組測序上也仍處於空白狀態，福建農林大學聯合國家蘭科植物種質資源保護中心(深圳)於2014年7月啟動了「香莢蘭基因組項目」，計劃率先對深圳香莢蘭進行全基因組測序和生物信息分析，同時對相關種類的轉錄組進行測序和分析。

　　國家蘭科植物種質資源保護中心(深圳)主任劉仲健介紹，經過雙方科研人員的共同努力和深入研究，目前已經完成了深圳香莢蘭基因組測序工作；已經獲得260Gb測序數據，基因組大小約800Mb，測序深度為325X，組裝結果接近精細圖標準，其中ScaffoldN50=288Kb，ContigN50=22Kb，基因數量約29000個，雜合度約1.14%，屬於高雜合複雜基因組。

　　國家林業局野生動植物保護與自然保護區管理司副司長劉亞文表示，項目的順利完成為揭示蘭科植物起源和系統演化研究奠定了重要基礎，為香莢蘭保育研究工作和產業化提供新的突破口，有利於大力推進香莢蘭乃至所有蘭科植物相關產業鏈的發展，對加強蘭科植物保護、蘭花品種創新和提升中國在生物學、生物多樣性等領域的研究水平具有重大的意義，也標誌著中國蘭科植物基因組測序技術的進一步成熟。(完)