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大自然中很多物種會突破人類對其固有認知，比如明明是鳥類的企鵝不會飛，但確是遊泳健將。這是什麼原因呢？其實這背後涉及到非常複雜的生物分類學知識。
物種分類方式
其實，物種的分類方式，代表著科學的進步。
在古代時，人類對動植物沒有系統的認識，對生物的分類也比較粗糙，比如：藥用植物、可食用植物、有毒植物等等，雖然這些分類有一些不正確，或者有失偏頗的地方，但對於那時的人類來說，也足夠應付日常使用了。
後來，隨著科學的進步，人類逐漸認識到物種之間的內部聯繫，比如有些物種雖然長相不同、生長環境不同，但它們卻是由共同祖先演化而言，比如：人類和黑猩猩，在幾千萬年前是同一個祖宗，再比如人類和老鼠，在1億年前擁有共同的祖先，都屬於哺乳動物。
根據這些認識，科學家們把生物物種分為界——門——綱——目——科——屬——種。
根據這個分類方法，企鵝屬於動物界——脊索動物門——鳥綱——企鵝目——企鵝科，再根據不同的企鵝種類，企鵝又分為不同的屬和種。
之所以把企鵝歸為鳥類，其實和人類的分類方式有關。
分類方式的起源
早在古希臘時，亞里斯多德就提出用性狀對比的方式，來區分生物的種類，不過由於缺乏科學觀測儀器，因此他對生物的分類比較簡單，他主要採用二分法來進行分類，比如：這個東西是活的嗎？如果是的話，他就會繼續問：它有血還是沒血？
就這樣一直問下去，直到某一個具體的物種。
按照亞里斯多德的邏輯，最大的是類：比如植物類，接著按照二分法（有時多於兩個）分成「種」，如此反覆分類，直到某一個具體的物種為止。
亞里斯多德的分類方式比較粗糙，但開啟了人類對於生物分類的革命。
亞里斯多德之後，一大批科學家對動物和植物開始進行研究，但他們的研究帶有「有色眼鏡」，它們把人類世界的道德觀附加在動物身上，因此他們在研究動物時，並不是研究內在生物邏輯，而是生物行為學和生態學。
16世紀初，有5位科學家就是這樣分類，比如Turner，他是英國博物學家，他觀測鳥類的生活習性和體型特徵，並以此為根據，將鳥類分為：猛禽，有蹼足的水鳥，沒有蹼足的沼澤鳥、陸地鳥、林間鳥、小鳥等等。
這些分類方式本質上和亞里斯多德的分類方式沒什麼區別，都更傾向於博物學，而非生物學，因此沒有對後來科學界產生很大的影響。
分類學之父林奈
1707年，被後世譽為分類學之父的林奈出生了，林奈非常痴迷於物種分類，他在《植物哲學》一書中，還把植物學家分為：植物學家，植物愛好者，收藏家，演說家，辯論家等。
林奈沒有採用前人所使用的二分法分類方式，而是把自然界的物種分為5個階元層次的等級結構：
界——綱——目——屬——種。
這種分類方式和亞里斯多德的二分法不同的點在於更精準，比如亞里斯多德把物種分為兩類：有血動物和無血動物，之後又分為：四足動物，兩足動物，多足動物，無足等等，這些分類繁瑣又不科學，因此林奈的分類方式更科學，更有助於科學家歸類。
但是，林奈所創建的分類方式，並不完整，比如界分為：植物界、動物界和礦物界，而目前我們所使用的界是：原核生物界 、原生生物界、植物界、菌物界 、動物界（也有版本說是4界或者6界）。
由於林奈生活的年代達爾文還沒出生，因此當時的林奈認為物種是沒有變化的，從古至今都是如此，現在我們知道，動物是在不斷演化的。
所以，林奈在分類時，他分類的方式沒有親緣關係，後來，達爾文的《物種起源》發表後，人類又根據物種的演化，將生物按照親緣關係分類。
也就是說，林奈構建了一個框架，後人根據新的理論以及新的觀察，修改了框架裡的內容，逐漸修改成「界——門——綱——目——科——屬——種」的分類方式。
企鵝為什麼被劃定為鳥類？
從以上分類方式中，我們來分析一下企鵝為什麼會被劃分為鳥類。
動物界：企鵝之所以被劃分為動物界，是因為它滿足動物界對生物的分類要求：以有機物為食，可以移動，有感覺，能夠自主運動。
脊索動物門：企鵝屬於脊索動物門，脊索動物門的特點是封閉式循環系統（尾索動物除外），位於肛門後面的尾巴；具有內骨骼；如果有心臟，那麼心臟位於消化管的腹面，企鵝的生理特徵滿足這一要求。
門之下還有一個分類為脊索動物亞門，企鵝屬於脊索動物亞門之下的鳥綱。
鳥綱：鳥綱和哺乳動物的區別是，鳥綱是卵生，而哺乳綱是胎生；鳥綱的生物有羽毛，而哺乳綱有體毛，兩者都屬於恆溫生物。
鳥綱的特點還有，前肢具有鳥翼特徵，有時鳥翼會退化；心臟特點是2心房2心室，骨多孔隙，有利於飛行；呼吸系統除了肺之外，還有氣囊。
而企鵝完全滿足了這些要求，因此企鵝屬於鳥類。