功夫熊貓3》承接第二集留下的伏筆，在新一集故事裡，與阿寶失散已久的生父突然現身，重逢的父子二人一起來到了一片不為人知的熊貓樂土。在這裡，阿寶遇到了很多可愛有趣的熊貓同類。當擁有神秘力量的大反派 企圖橫掃神州大地，殘害所有功夫高手時，阿寶必須迎難而上，把那些熱衷享樂、笨手笨腳的熊貓村民訓練成一班所向披靡的功夫熊貓!而且還有可能遇到新的「女朋友」，但兩位的最後發展如何，觀眾還要拭目以待。
阿寶經歷了一場從尋根到尋找自我的升華之路。在之前的故事中羽化登仙的烏龜大師重出江湖，為了讓阿寶更好的成長，做回一隻真正的熊貓，明白當熊貓的真諦，烏龜大師在靈界給阿寶的熊貓爸爸送了一條「上帝的簡訊」，告訴他自己的兒子在哪裡，並希望他能帶阿寶回到熊貓村體驗當熊貓的感覺。此時，阿寶正在浣熊的要求下體驗當師父的感覺，並不完全明白浣熊師父那句「你就是你自己」真正含義的阿寶，師父當得一塌糊塗。收到訊息的熊貓爸爸突然現身與阿寶相認，重逢的父子一起來到了全是同類的熊貓村。
在這片樂土上，阿寶體驗了當熊貓兒子的感覺，這是跟鵝爸爸給的完全不一樣的感覺，這個爸爸不但跟他長得像，連性格愛好都一模一樣。正當父子倆無憂無慮的生活在熊貓村的時候，一個名叫「天煞」的大反派出現了，天煞每殺死一個會武功的人，就會奪走他們的「氣」，從而讓自己變得更強大。四處殘害功夫高手的天煞不停的吸食著高手們的氣，連阿寶尊敬的烏龜師父也未能逃出天煞的魔掌。身為被選中的「龍戰士」，阿寶想要學習氣功，擔負起消滅天煞的任務，並且只有學會氣功才能打敗「天煞」。而熊貓爸爸為了不失去兒子，騙了他說來熊貓村可以教你學氣功，卻沒想到，殺死了所有武林高手的天煞，正向熊貓村趕來，為了打敗天煞，阿寶必須迎難而上，把那些熱衷享樂、笨手笨腳的熊貓村民訓練成一班所向披靡的功夫熊貓。在培養熊貓軍隊的過程中，阿寶才明白浣熊師父那句話的真正意義，他因材施教，教會了熊貓們做最好的自己，並最終明白了「我是誰」。
中美合拍的《功夫熊貓3》之所以能在全球稱讚，除了雙方了解充分外，影片還兼顧了中美兩國的元素，照顧了兩國觀眾的觀影偏好，但是就目前而言，像《功夫熊貓3》如此成功的中外合拍片屈指可數。設計上，整款海報承接前作風格，採用了大量的中國元素，極具東方特色和大片質感。熊貓身後隱藏在漫漫雲海中的雪山、房屋都體現了強烈的東方色彩。影片整體將延續系列以往獨特的喜劇風格，繼續向觀眾傳遞阿寶樂觀開朗、勇往直前的精神。
中國觀眾對《功夫熊貓》系列的感情太深了，就算「總動員」和幾個國產熱門短片改編的票房常青樹，也是毫無可比性，除了其獨特的體裁，不同以往的的動畫形象，這套電影的技術和想像力，濃鬱的中國風，都已經深入人心。那麼，最新一部將帶來哪些新變化，阿寶將面對怎樣強大的對手，他的爸爸將對他產生什麼樣影響，他和熊貓美美的戀情會不會產生全系列第一場愛情故事，在熊貓的樂土上又會有哪些奇聞趣事呢？都是這一部的故事重點。
《功夫熊貓》作為一部經典動畫系列影片，在內地市場擁有堅實觀眾群體，從第一部神龍大俠「出世」，到第二部的「能力越大責任越大」與反派的強力對抗，再到這一部融合親情友情的「傳奇回歸」，故事磅礴大氣且不失豐滿細節，不得不由衷讚嘆一位不懂中文的導演，竟然可以打造出這麼一部滿滿東方元素的動畫喜劇大片。
影片從父子重逢與天煞降臨為故事突破設置——東方夢工廠以及中美合拍的背景，讓「阿寶」終於有機會「重返故土」，無論從形式還是內容，這都是西方文化向東方文化的一次靠攏——關於阿寶的身世之謎，關於烏龜大師的江湖心結，關於天煞的驚天陰謀，關於熊貓村的隱秘往事……為故事帶來更多的故事信息，這並非只是一次簡單的「回歸」，更是系列影片的一次重新起航。
《功夫熊貓3》以超出預期的水準，證明了一切期待都是值得的，雖然距離上一部已經快四年過去了，故事還是做到了無縫對接的，繼阿寶千辛萬苦尋訪到自己的身世之謎，他的親生父親李山意外現身，並把他帶到一片樂土，這裡有一群善良可愛的熊貓，他們無憂無慮，他們歡聲笑語，無盡的快樂中，沒有一點點的悲傷，只是偶爾會被在成長中感受到一絲甜蜜的煩惱，例如阿寶的娃娃親。還有，養父鵝爸爸和親生熊貓爸爸的父愛鬥法，阿寶和蓋世武俠以及曾經親密無間的小夥伴悍嬌虎，一起面對這個全新的集體，又怎麼一起對抗邪惡，這些人物關係在新的環境背景下，又擦出了全新的火花。 不得不說，配音也是本集笑點的一大來源，黃磊、楊冪、周杰倫、成龍、姜武、肖央、王太利、王志文、張國立、白百何，這些戲骨級的明星，讓國語版配音變得更加純正，角色們無論情感還是喜感都更接地氣，接受起來零壓力。sha、shéi、鵝也是鳥、哎呦，不錯哦，這些臺詞，不僅搞笑，也是純正的本地方言，這在以往的好萊塢動畫片中，是不可想像的。 當然，這本身就第一部原汁原味的「國語片」，上一部的好萊塢團隊還只是到中國來採風而已，這一部已經從投資到製作，場景的使用，都完成了百分百的「漢化」。當觀眾看到純正的中國場景和元素，幾乎可以不計較它是來自好萊塢還是本土，純純的自家生產。
歡樂無極限，可是驚險也要有，而且要超出以往，畢竟是一部「武俠片」，阿寶和李山一樣，都是一入江湖，身不由己，該來的終於來了，邪惡的力量出現，安寧的生活被打破。這一次，阿寶的對手是心狠手辣的天煞，一個野心勃勃的功夫高手，為了對抗敵人，阿寶的任務不再只是衝鋒陷陣那麼簡單，他要把胖胖萌萌的小夥伴們都訓練成「功夫熊貓」，天啊，這群乳臭未乾的吃貨能行嗎？懸念一波一波的展開了。 更難得的是，影片在敘事主題方面也是非常有中國武俠片的神韻，親情、俠義，成長、使命，多線齊飛，而且在風格上加以淨化，減少了血腥和暗黑，更多的光明和正義，使之成為不分老幼，無論男女都能喜聞樂見的動畫大電影。
如果說同樣相似的劇情一遍遍的重複沒有消磨透我們的耐性，那麼肯定是有其他的原因在這裡的，就像這些看似相似的故事在情節上成功的銜接，在內涵上的不斷深化，最後成功譜寫出一段段欣喜歡樂的故事，從意外的幸運落到自己的肩頭，能力越大責任越大，阿寶從此走上一條保護和平終結邪惡的無休止之路。 在這裡我們知道了永無休止的貪念往往是邪惡的發源地，友情親情，的陪伴讓我們一步步成長，愛和寬容環節一切仇恨，找回自己讓我們心如止水，那我們應該再怎樣的故事裡走向結局，是身份的確定是愛的回歸是萬般失望之時最後一個堅持下去的理由，我們不是貶低邪惡的力量，只是我們相信愛可以這個世界，這個世界上的任何人任何事，是愛把一切的不可能變成可能，從而鑄就傳奇！