對於大部分單機遊戲來說，遊戲通常會提供不同難度的選項，但是每個難度的配置，如主角的血量，敵人的血量等等，都是官方默認定好的。但在即將發售的《最後生還者 第二部》中，玩家將可以在遊戲裡隨時自定義修改遊戲的難度。
具體來說，《最後生還者 第二部》裡有五個跟遊戲難度相關的選項，分別是：玩家、敵人、同伴、潛行、資源。每個選項從「休閒」到「生還者」有五種不同的難度等級。你可以根據官方默認難度設定，也就是全部選項的難度都完全一致；也可以任意修改其中某一項，讓它變得更難或者更簡單。
例如在其他選項保持「普通」的情況下，將場景資源的豐富程度調整為「休閒」，那麼就可以保證遊戲的戰鬥強度不變，但是玩家總是能保持資源充沛的狀態，製作的道具數量甚至也會增加；又或者在其他選項不變的情況下，讓同伴更加積極的攻擊，從而變相地降低戰鬥難度；又或者降低潛行的難度，從而讓敵人更難以察覺到艾莉，同時艾莉也能更輕鬆的挾持和暗殺敵人。
除了可以自定義難度之外，《最後生還者 第二部》還提供了大量的輔助功能，包括視覺、聽覺、操作和解密等等。例如強化聆聽模式，可以掃描並標出附近的道具和敵人；比如禁止敵人包抄繞後，自動拾取道具，水下無限呼吸，關閉準星晃動等等。這些功能本身默認都是關閉的，如果你覺得有需要，那麼可以自己在遊戲選項中打開。
另外，玩家自定義遊戲難度以及開關以上輔助功能，這些操作都可以隨時在遊戲中進行，而且不會影響獎盃的獲取，獎盃黨們可以放心了。
在接受採訪時，《最後生還者 第二部》的總監兼編劇 Neil Druckmann 表示，本作是頑皮狗有史以來規模最大，最具野心的遊戲，劇情故事上也下了非常多的功夫和心血，因此希望可以有更多的玩家接觸和嘗試本作，並且最終能夠順利通關。
為此，他們做了一些用戶調研，詢問玩家沒有嘗試前作，或者沒有通關前作的原因和難點，以及希望遊戲能夠提供哪方面的輔助。根據玩家的反饋，他們最終決定加入上面這些功能，從而讓更多玩家能夠好好享受遊戲和劇情。