圖片說明：美國聯邦調查局與中情局標誌
在歷史學家們看來，作為美國國家安全的兩個支柱，聯邦調查局(FBI)和中央情報局兩者之間的暗中角力已持續了幾十年，某些時候甚至危及美國的國家安全。
始於兩個人的恩怨
這兩大諜報機構的緊張關係，可以追溯到二戰時期埃德加·胡佛領導的FBI和威廉·多諾萬麾下的戰略情報局(中情局前身)互相瞧不上眼。
1939年二戰爆發後，胡佛嚴防其他競爭機構介入他的情報領域，因此經常與海軍情報局和陸軍情報局發生糾紛。為加強國內管控，美國總統羅斯福於1940年6月賦予胡佛國內調查的管轄權，從此胡佛的地位便不可動搖，但對外情報工作卻給他帶來挑戰。
1941年初，13個不同的機構源源不斷地將國外情報送進白宮，羅斯福面臨一個建立情報秩序的緊迫問題。同年夏天，羅斯福派一戰英雄多諾萬出國考察，後者隨後建議成立一個新的機構，全面負責海外情報活動並監督對外宣傳。
稍後，珍珠港事件爆發，儘管後世對美國是否事先知道日本的偷襲計劃有所爭論，但在當時，這場災難性事件被認為是FBI的重大情報失誤，美國媒體甚至寫道，「國內的超級偵探、聯邦調查局局長埃德加·胡佛成為眾矢之的」。胡佛則稱「夏威夷事務的管轄權主要屬於海軍」。
在這種情況下，美國決策者們決定「集中化」情報組織。1942年6月，戰略情報局成立，多諾萬任局長。這是美國第一個統一的中央情報機構。
大戰期間，多諾萬與胡佛的矛盾甚多。1942年10月，當多諾萬手下的特工潛入西班牙駐墨西哥使館偷拍一本海事密碼簿時，FBI的人也趕到。警報嘶鳴，紅燈忽閃，戰略情報局的人只好逃走。多諾萬對此大為惱火。
1943年，多諾萬提出戰略情報局與蘇聯內務人民委員會建立聯繫的計劃，胡佛聽到風聲後，立即致信白宮，警告這樣做會「對本國內部安全構成嚴重威脅」。最後該事件不了了之。1944年11月，多諾萬向羅斯福提議將戰略情報局改組為一個新的對外情報局，即現在的中情局，直接對總統負責。由於該消息被洩露，建議沒有實施。多諾萬確信是胡佛從中作梗，歷史學家們也同意他的看法。
圍繞蘇聯叛逃特工角力
二戰結束時，胡佛無可爭議地成為美國國內情報機關的首腦，在戰後海外情報的未決競爭中也獲得同等機會。但1946年1月，新總統杜魯門下令組建中央情報組，一年多後，成立中情局。兩大機構一個主內，一個主外，但產生矛盾仍然在所難免。
美國一些歷史學家認為，聯邦調查局和中情局之間的「聯絡問題」造成了1963年甘迺迪遇刺的悲劇，而兩者之間的內鬥更是妨礙了調查的展開。
這起事件聚焦點在於蘇聯叛逃特工尤裡·諾申科。1962年，他帶著外交使命前往日內瓦，同中情局取得接觸。諾申科提出只要少量錢就能為中情局服務，還自稱是克格勃某部門的副部長，並提供了一些情報。1964年，諾申科聲稱自己已經暴露，然後在中情局安排下逃往美國。
諾申科稱，他能提供刺殺案的重要信息，刺殺甘迺迪的兇手李·奧斯瓦爾德曾受克格勃監視，但克格勃從未試圖招募他。這一問題很關鍵，因為克格勃同奧斯瓦爾德的交往可能暗示蘇聯捲入刺殺事件。這時，聯邦調查局控制著的代號「費多拉」的叛逃人員證實了諾申科的說法。但複雜的是，「費多拉」最終被視為是為蘇聯工作的雙料間諜，而且中情局進行的兩次測謊都證明諾申科在奧斯瓦爾德一事上撒謊。
由此，兩大機構就蘇聯叛逃人員的忠誠發生衝突。聯邦調查局認為諾申科說的是真話，而中情局確信他通過撒謊來保護莫斯科。
中情局接著又通過力挺另一名蘇聯克格勃叛逃人員戈利岑相抗衡，後者指控諾申科是莫斯科安插的特工。1970年，「諾申科-戈利岑衝突」達到頂點時，胡佛打電話給尼克森總統，問他如何看待聯邦調查局從奧列格·利亞林(在倫敦活動的一名克格勃人員)處獲取的報告，尼克森答說從未收到過報告。胡佛這才發現，中情局反間諜處竟然宣稱那些是假情報，扣下了它們。胡佛極其憤怒。要知道，十年來中情局一直在貶低整個聯邦調查局的信息來源。
「水門」禍及CIA
聯邦調查局和中情局間的微妙關係在「水門事件」中也得到凸顯。
1972年6月，「水門事件」發生，尼克森試圖阻止FBI對該事件進行深入調查，但遭到拒絕。這時緊張氣氛也籠罩著中情局，因為白宮顧問約翰·迪安告訴中情局副局長，闖入水門大廈的人中，多數與中情局有瓜葛。為脫開干係，中情局局長赫爾姆斯指示招待處長科爾比不要主動說什麼，無論在法律上還是道德上，中情局都沒義務向FBI提供這類情報。這時胡佛已經去世，FBI代理局長格雷直接找上門，詢問闖入水門是否是中情局的某項行動計劃。赫爾姆斯自然一概否認。
尼克森方面得知FBI懷疑中情局後，建議藉助中情局的力量，用「國家安全」的名義去阻止FBI。赫爾姆斯不想違背白宮指示，又不願承擔責任，於是告訴副手，提醒格雷注意兩局達成的分工協議，根據協議，如果調查涉及中情局的人，請他們打個招呼。
FBI不久便表示不能繼續信守協議，除非對方正式發函，但赫爾姆斯不願意留下白紙黑字的證據。於是格雷直接打電話到白宮：「總統先生……您的下屬正在利用中情局和聯邦調查局，並在中情局對聯邦調查局想調查的人表示關切或不關切問題上製造混亂。」尼克森沉默片刻後說：「你繼續大膽地進行調查吧。」
後來「水門事件」真相大白，尼克森下臺，中情局被指為成為一黨一人的工具。那時的赫爾姆斯已是駐伊朗大使，他不斷飛回華盛頓作證。他不承認有罪，並信守不透露中情局秘密的誓言，被稱為「守口如瓶的人」。1977年11月4日，他被指控犯有偽證罪而判處緩期徒刑兩年，罰款2000美元。這對他來說無疑是一種羞辱。
進入20世紀90年代，中情局和聯邦調查局內部分別出現的間諜案進一步惡化了雙方的關係，致使聯絡出現問題，最終造成導致「9·11事件」的情報失誤。至今，中情局人員仍然被聯邦調查局視為知識分子、喝著葡萄酒、抽著菸斗、有時很冷淡的人。中情局則將聯邦調查局人員看成抽雪茄、喝啤酒、敲門的警察。有美國媒體形容稱，這真是一對「糟糕的朋友」。
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