熟讀《紅巖》、《烈火中永生》等文藝作品或者參觀過重慶歌樂山革命烈士陵園的朋友們大都了解中美合作所這個邪惡組織。
1949年9月至11月底，國民黨當局將關押在歌樂山下的白公館、渣滓洞的包括共產黨、民革、民盟、「託派」及無黨派人士（還包括軍統局的違紀犯）在內的數百名政治犯實施血腥屠殺。這段「黎明前的黑暗」，是國人永遠不能忘卻的紀念。
實際上，中美合作所成立之初曾是中、美兩國聯合抗擊日本法西斯組織，全稱為中美特種技術合作所，成立於1943年4月15日，直接隸屬於中美兩國最高軍事統帥部，總部設在重慶西北郊歌樂山下的楊家山。該組織曾為抗戰勝利做出過重要貢獻。
1943年4月15日，中美雙方共同擬定了一份名為《中美特種技術合作協定》的條約，中美合作所的成立得到了時任美國總統羅斯福和國民政府主席蔣介石的批准。
軍統領導人戴笠、美國海軍中校梅樂斯（1943年7月美國陸軍方面改派魏今生為代表）分別擔任中美合作所正副主任。參謀長中方兩人，為鄭介民和李崇詩，美方為貝利美。主任秘書中方為潘其武，美方為史密斯。
據不完全統計，從1943年至1945年8月，中美合作所各訓練班，共訓練單位22個，完成訓練之作戰部隊49180人，各種幹部1320人，畢業學員50500人。這些「特種作戰部隊」經訓練後改編為別動軍8個縱隊、忠救軍3個縱隊，湘鄂贛邊區行動總隊（梅樂斯稱之為長江突擊隊）、鐵道破壞隊、水上破壞隊、教導營（多半由受訓學生編成）若干等敵後抗戰隊伍，為抗戰輸送了大量軍事人才。
其中，中美合作所還在福建設立東南辦事處，下轄上海、閩侯、定海、漳州4個情報站，並在安徽，湖南，河南，貴州，江西，福建，浙江，廣東等地開辦訓練班，培訓特工，軍統武裝力量因此大大加強。
隨著抗戰勝利，《中美特種技術合作協定》條約終止，1946年1月，中美合作所停止行使其原有職能。而在後續的美蔣反共的累累罪行中，這個戰時跨國軍事情報合作機構的名字卻頻頻出現，成為那個十惡不赦的魔窟。
歌樂山革命紀念館也曾一度命名為「中美合作所集中營美蔣罪行展覽館」。長篇小說《紅巖》和由此改編的電影《烈火中永生》、歌劇《江姐》等文藝作品，均以此地發生的真實事件為藍本創作而成。
以《紅巖》為例，寫到共產黨員劉思揚第二次被捕時，就描寫了押送他的汽車經過「中美合作所警衛森嚴的大門」駛進白公館集中營進行登記時，他看到登記簿上有中美合作所的英文縮寫等細節。小說中寫到渣滓洞監獄政治犯組織絕食鬥爭和1949年新年聯歡會時，還特地描寫了監獄看守長給美國「特別顧問」打電話請示報告的細節。
在小說中，國民黨特務頭子徐鵬飛威脅許雲峰：「你可受不了四十八套美國刑法！」改編成電影《烈火中永生》後，這句話改成了徐鵬飛審訊江姐時的臺詞，「美國刑法」改成了「中美合作所的幾十套刑法」。「你別忘了，這裡是中美合作所！」「真想嘗嘗中美合作所的幾十套刑法？」「老實告訴你，進了中美合作所，就是死屍，也得給我開口！」
在歌劇《江姐》的最後一場（場景說明：重慶「中美合作所」渣滓洞集中營女牢），江姐在就義前，得知敵人就要逃跑時，嘲笑沈養齋說：「怎麼？你害怕了？你們『中美合作所』這塊招牌就要摘掉了！」
大家熟知的白公館原是軍統局下面的臨時看守所，1943年，中美合作所建立時，白公館看守所奉命將人犯遷往渣滓洞，將房屋騰出來讓給美方人員作為住所。
抗戰勝利後，中美合作所美方人員陸續回國，白公館才又恢復關押政治犯的職能（後稱國防部保密局看守所），主要關押國民黨當局認為是「要犯」的較高級別的政治犯。而渣滓洞監獄，原是因白公館看守所人滿為患而增設，1946年年底將人犯遷回白公館後，曾一度關門，後於1947年年底又重新開張。
兩所監獄與昔日中美合作所處在同一位置，監獄裡所使用的辦公家具、桌椅板凳床，以及特工使用的手銬、槍枝等刻有中美合作所字樣和有USA標誌，這些都是中美合作所遺留下來的。
1949年10月，堪稱「黎明前黑暗的日子」。經過三大戰役、渡江戰役，國民黨反動政府垮臺。蔣家王朝認為他們的失敗是對共產黨手軟的結果，於是在重慶對共產黨人和進步人士進行瘋狂屠殺。根據對抗戰後期至重慶解放前夕系列大屠殺殉難者進行的統計，目前有案可查的死難者總數是321人，其中經審查已定為烈士者共計285人，加上5個隨父母犧牲的小孩，共290人，叛徒及未定性者共計31人。
迫害、屠殺發生時，中美合作所雖已撤銷，但是其長時間陰魂不散。檔案資料顯示，合作所美方副主任梅樂斯、魏今生等曾不顧美國當局禁令多次介入中國國共兩黨衝突的內政。該所訓練的作戰人員、警察和特工，獲得的美式武器與設備器材，都被國民黨當局用到了反共內戰中。「扶蔣反共」，使「中美合作所」聲名狼藉，成為中共後來反美、反蔣（國民黨）宣傳中的一個重要靶子。
新中國成立伊始，「中美合作所」便被宣傳為「美蔣反動罪行」的代表，至今很多人提起來仍然會咬牙切齒。
凡事都要辯證地看待，我們也應該承認，中美合作所作為抗日服務的軍事合作機構，曾對抗戰勝利做出過積極貢獻，這一點同樣不該被忘記。