《言葉之庭》的故事發生在現代東京，故事講述了以製鞋人為目標的少年秋月和神秘女子雪野的戀愛故事。故事源於萬葉集開篇的「孤悲」之戀，作品中透露出鞋、萬葉集、日本庭園、雨等因素。
年方15歲的高中生秋月孝雄，專心學業的過程中不得不為了生計打工賺錢。母親離家出走，他與哥哥過著看不到前方的生活。入梅之日，孝雄逃課來到日本庭園。在一座安靜的小亭子裡，27歲的職場女性雪野百香裡邊吃巧克力邊飲啤酒的樣子引起了孝雄的注意。
似曾相識的二人，每到落雨之日便從世俗的煩惱中逃脫出來，相會於這座鋼筋鐵骨都市叢林中宛若世外桃源的幽靜角落。在梅雨季節的日子裡，他們的心漸漸向彼此靠攏。志願成為手工鞋匠的秋月，決心以雪野為模特做一雙鞋。雨過天晴，豔陽高照，庭園中久久不見秋月和雪野的身影，相會無期亦有期
女主由於在學校中的某位男生單戀她，而致使女生統一口徑造謠污衊她的事情，對她造成了巨大的心理壓力，並出現了一些生理和心理上的問題，因為學校的流言沒有勇氣上班而逃避，與孝雄相遇後才逐漸釋懷。
影片多以雨天為場景。「隱約雷鳴 陰霾天空 但盼風雨來 能留你在此，隱約雷鳴 陰霾天空 即使天無雨 我亦留此地。」最美不是下雨天，而是與你一起躲避的屋簷。十五歲的他和二十七歲的她在雨中的邂逅，兩人互有好感，雨天庭中見。十五歲的他心思縝密，並沒有無畏的向前衝，而是以製鞋圓夢去擁有她。一無所知的他懷揣著深沉的夢向她靠近……結果卻不盡人意。她不過是他生命中的擺渡人，而他認為她是他的全部。
誠然就劇情，使《言葉之庭》在對愛的渲染上總覺有所欠缺，但新海誠對動畫質感的苛求，營造了一場美到極致的電影，在簡短的46分鐘時長裡，電影的每一幀都是那麼的無可挑剔，而在這個簡單的愛情故事中，其所賦予的距離感，又將一種微妙的感情隱晦的表達而出，契合出色的動畫質感給人以一種恬靜的藝術表達，或許也只有新海誠的動畫電影才能如此嫻熟的把控，令本年齡懸殊的愛戀居然蒙上了一層迷人的基色。