美國冷泉港實驗室科學家開發了世界上第一款基於蘋果作業系統的移動式基因組序列分析程序,用蘋果手機配上手持式DNA測序儀,就可創建一個移動式遺傳學實驗室。這使人不禁想起美劇《星際迷航》中的「三錄儀」。
斯波克隊長的體檢三錄儀曾給《星際迷航》的影迷留下深刻印象,這也是人們對未來醫療幻想的象徵。劇中的三錄儀讓醫生無論是在飛船上還是在外星球執行任務時,可以隨時評估一個人的醫療狀況,讓他能夠快速、輕鬆地做無創診斷。
隨著測序儀的不斷縮小,目前尚無可在行動裝置上研究DNA的技術。大多數DNA研究,如比對和分析工作,都是在大型伺服器或高端筆記本電腦上進行的。而研究流行疾病的科學家必須在手提箱中滿載測試儀、筆記本電腦和其他工具,才能在偏遠地區進行分析。
冷泉港實驗室開發的iGenomics應用程式可完全在蘋果手機上運行,減少了在現場對筆記本電腦或大型設備的需求,這對流行疾病和生態工作者非常有用。應用程式的開發是對牛津納米孔公司生產的微型DNA測序設備的補充。
該項研究發表在《Gigascience》上,論文中指出, iGenomics算法可快速定位病毒病原體(如流感病毒或寨卡病毒)的DNA序列,並識別出對診斷和治療很重要的突變。研究人員還提供了在線教程,以分析其他病毒基因組,如來自新冠肺炎患者的基因組。
iGenomics使基因組研究變得便攜化、可訪問且負擔得起。用戶可通過蘋果作業系統的應用程式相互傳送測序數據,從而在最遙遠的地方,甚至那些無法訪問網際網路的地方進行DNA分析。研究人員介紹,iGenomics可能很快就會送到太空人手中,在太空中進行DNA測序。
研究人員表示,最新智慧型手機已相當於一部專業相機,不難想像在接下來的幾年裡,智慧型手機也可以是一部可攜式DNA測序儀。帶上一部手機,檢測環境、尋找病原體甚至掃描人體發現病情,都將不再是科幻劇情。
【來源:摘自科技日報】
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