2020年4月19日訊/
生物谷BIOON/---新型冠狀病毒SARS-CoV-2（之前稱為2019-nCoV）導致2019年冠狀病毒病（COVID-19），如今正在全球肆虐。在構建出新型冠狀病毒SARS-CoV-2的三維結構路線圖並與全球科學界分享兩個月後，美國伍斯特理工學院
生物信息學研究員Dmitry Korkin及其同事們在Viruses期刊上發表一篇標題為「Structural Genomics of SARS-CoV-2 Indicates Evolutionary Conserved Functional Regions of Viral Proteins」的論文。
圖片來自Viruses, doi:10.3390/v12040360。
在這篇論文中，Korkin及其團隊描述了他們如何使用
生物信息學和分子建模來重建SARS-CoV-2的主要病毒蛋白的三維結構及其與人蛋白的相互作用。
具體來說，Korkin團隊發現了3種嚴重急性呼吸症候群（SARS）冠狀病毒（SARS-CoV）分離株。SARS-CoV是2003年發現的一種冠狀病毒，也引起了全世界的感染，並造成大量死亡。
Korkin團隊得出了三個初步結論，這些結論可能在病毒建模和幫助科學家進行未來的藥物發現中起作用。首先，他們確定與人類SARS-CoV和其他相關動物病毒相比，構成SARS-CoV-2的蛋白發生的變化不是均勻分布的，而是經常在蛋白表面上聚集性出現。
其次，Korkin團隊發現「刺突蛋白」（SARS-CoV-2表面上的一種可以被人抗體靶向的蛋白）區域與SARS-CoV中的同一區域非常不同，這表明現有的SARS疫苗可能並不有效，人們需要一種新疫苗。
與此同時，Korkin團隊得出的第三個結論是，先前開發的抗SARS-CoV病毒候選藥物靶向的區域非常完整，這表明對這些藥物進行重新利用是可能的。
Korkin在這篇論文中寫道，「這項計算研究工作的目標是雙重的。」他說，他想「...讓這種結構路線圖和相關發現對研究界完全可用」，並且「...幫助科學家們破譯與SARS-CoV-2感染、疫苗開發和抗病毒藥物發現有關的分子機制。」
今年2月，Korkin和他的團隊構建出並公布了SARS-CoV-2的三維結構路線圖。當時，Korkin與世界各地的科學家們分享了這種路線圖，以推動對COVID-19的更多研究。為了將研究結果快速分享給研究界，Korkin的完整三維結構路線圖數據集和手稿預印本已於2月14日發布在bioRxiv上（bioRxiv, doi:10.1101/2020.02.10.942136）。（生物谷 Bioon.com）
參考資料：1.Suhas Srinivasan et al, Structural Genomics of SARS-CoV-2 Indicates Evolutionary Conserved Functional Regions of Viral Proteins. Viruses, Published: 25 March 2020, doi:10.3390/v12040360.