科研利器 | 快速提取圖形數據

2021-03-02 自我整合

通常,科研人員獲取數據大多數來源自己的實驗研究或問卷調查,也有使用公開發表的資料庫或付費數據(如金融專業)。此外,使用爬蟲技術在網絡上抓取數據也正流行。

然而,遇到無法直接獲取數據時,我們可以另闢蹊徑,從論文圖片中提取想要的研究數據。

例如:自己的原始數據丟失,論文中只留存幾幅圖,又需要提供數據時;Meta分析中,前人論文中只以圖片形式展示結果,又需要歸總前人研究數據時等等。

以下匯總一些常用的圖片數據提取軟體,介紹其原理及操作步驟。

常用的軟體包括:Origin;Getdata Dragh Digitizer;FindGraph;DigitizeXY;Un-Scan-It等等,編程軟體Matlab,在線網站WebPlotDigitizer。

其中Origin軟體和Getdata Dragh Digitizer軟體使用頻率較多。

Origin軟體

Origin軟體利用其digitizer插件,該插件可以直接從圖片中提取數據,方便科學繪圖。

詳細教程可見百度經驗:origin提取圖片中數據

網址:https://jingyan.baidu.com/

article/d5a880ebb11b1b13f147cc3c.html

或直接長按以下二維碼查看。

GetData軟體

GetData Graph Digitizer是讀取圖片格式數據的利器,也受到很多研究者的青睞。

詳細教程可見百度經驗:如何用GetData Graph讀取圖片中的數據

網址:https://jingyan.baidu.com/

article/215817f745d6171eda1423d9.html

教程網址二維碼如下。

Matlab軟體

此外,如果對Matlab軟體比較熟悉,也可以直接敲代碼實現提取圖片數據功能。

詳見百度經驗:Matlab從fig圖形文件中提取數據

網址:https://jingyan.baidu.com/

article/76a7e409eed24efc3b6e15fd.html

二維碼如下。

其基本原理:主要是將圖像類文件數位化,通過像素的排布從而得到實際圖像上的實際點坐標,並可以輸出成需要的格式。

下面簡要介紹WebPlotDigitizer,無需下載指定軟體或編程,在線提取圖片數據。

WebPlotDigitizer基於HTML5的在線工具從圖形中提取數字數據,目前網頁支持英文、德文、法文顯示,也支持簡體中文(以下步驟截圖來源中文界面),這大大減輕了非英語母語者的壓力。

此外開發人員還提供桌面版軟體,支持主流作業系統Windows、MacOS與Linux。

步驟一:

導入相應的圖片文件。

步驟二:

選擇繪圖類型,如二維圖、二維條形圖、機坐標圖、三元相圖、地圖及像素圖。

步驟三:

校準X-Y坐標軸,在坐標軸上按紅色所示順序放置4個已知點。兩個位於X軸(X1,X2),兩個位於Y軸(Y1,Y2)。

步驟四:

X和Y軸標定,分別輸入X軸上的兩個標定點的X值和Y軸上的兩個標定點的Y值。

在圖形提取的時候,分為手動模式和自動模式,自動模式下首先會根據曲線的顏色選定曲線,同時可以使用mask(box,pen,erase etc)來選定數據的有效區,選定後Filter還可以用來確認所選數據是否有效。

手動模式,按照自己想要的數據點,進行點擊,然後查看數據。完成後,可以選擇下載 .CSV格式和繪製Plotly。

感興趣的研究者,可以點擊閱讀原文直接登錄以下網址或掃描二維碼,進行嘗試~

網址:https://automeris.io/WebPlotDigitizer/

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