《藥師經》中生字難字僻字頗多，誦讀者往往視為畏途。最初我親見一位法師講此經時，因前期準備不足，遇到生僻字無法解讀甚為尷尬的情況，故於自己學習之初，即特別留意這些字的讀音及釋義。年深日久，累積頗多。未敢自是，特單獨錄出，供大家參考，並請批評指正，以臻完善。所據底本，為中華藏之底本高麗藏，故與坊間流通本頗有不同，讀者不需驚異，蓋此經流通之時，對於一些生僻字已經做了修改，甚至連玄奘法師的一些獨特翻譯方式，都被改為大家熟悉的表述。故還原大藏經本，非常必要。但同時，考慮流通本增加八菩薩名和說藥師灌頂真言一段，對於眾生利益甚大，得到印光大師的肯定，故保留這一作法，方便普通讀誦學習者。至於深入研究，則當據大藏經本為宜。弘一法師抄寫《藥師經》即據大藏經本，不抄寫增加補充進去的內容。二者出發點不同，不可執一非餘，是則兩全其美也。而讀音的定音，根據「音從義定」的原則，而且採用學術界公認的目前水平最高的《漢語大詞典》（羅竹風主編，中國漢語大詞典編輯委員會、漢語大詞典編纂處編纂，漢語大詞典出版社出版。1986年11月第一卷出版，至1993年11月全書十二卷及索引一卷出齊）的解釋和定音作為依據（也參考《漢語大字典》的解釋）。越來越可能還有些字，我看沒有問題，但大家可能感覺對於讀音拿不準的，也可以留言，我再增加注音，希望越來越完備。祝福學修進步吉祥。
南無藥師琉璃光如來！
沙門宗舜識於2019年6月23日，京華無盡傳燈精舍
薄伽（qié）梵（fàn）
住樂（yuè）音樹下
大苾（bì）芻（chú）眾
菩薩摩訶（hē）薩
而為（wèi）說法
偏袒（tǎn）一肩
如是相（xiānɡ）類諸佛名號
為欲利樂（lè）像法轉（zhuǎn）時
汝今諦（dì）
當為（wèi）汝說
唯（wěi）然願說
我等樂（yào）聞
東方去此過十殑（jìng）伽沙等佛土
應（yīnɡ）、正等覺、
調（tiáo）御（yù）士
本行（xínɡ）菩薩道時
得阿耨（nòu）多羅三藐（miǎo）三菩提
熾（chì）然照曜（yào）無量無數無邊世界
八十隨好（hǎo）
淨無瑕（xiá）穢（huì）
幽冥（mínɡ）眾生
隨意所趣（qū）
莫令眾生有所乏少（shǎo）
若行聲聞、獨覺乘（chénɡ）者
還（huán）得清淨
不墮惡趣（qū）
醜（chǒu）陋（lòu）頑愚
盲聾（lónɡ）喑（yīn）啞（yǎ）
攣（luán）躄（bì）背僂（lǚ）
端正黠（xiá）慧
出魔罥（juàn）網
縲（léi）縛鞭撻（tà）
系（xì）閉牢獄
或當刑戮（lù）
蚊虻（méng）寒熱
如其所好（hào）
花鬘（mán）塗香
鼓樂（yuè）眾伎（jì）
隨心所玩（wán）
城闕（què）宮閣
正法寶藏（zàng）
惟懷貪吝（lìn）
闕（quē）於信根
無量慳（qiān）貪有情
積（jī）集資財
奴婢（bì）作使
或傍（pánɡ）生趣
從彼處沒（mò）
還（huán）生人中
得宿（sù）命念
不樂（yào）欲樂（lè）
好（hào）行惠施
血肉身分（fèn）
無量俱胝（zhī）有情
還（huán）生人趣
善調（tiáo）意樂（lè）
慳貪嫉（jí）妒（dù）
作牛馬駝（tuó）驢（lǘ）
恆被鞭撻（tà），
永斷魔罥（juàn）
破無明□（què）
竭（jié）煩惱河
更（ɡēnɡ）相鬥（dòu）訟（sònɡ）
告召（zhào）山林樹冢（zhǒnɡ）等神
祭祀（sì）藥叉
羅剎（chà）娑（suō）等
而咒詛（zǔ）之
厭（yā）媚蠱（ɡǔ）道
及嫌（xián）恨心
受持八分（fēn）齋戒
乘（chénɡ）神通來
不復更（ɡènɡ）生諸餘惡趣
瘦瘧（nüè）幹（ɡān）消
或被厭（yā）魅蠱（ɡǔ）道所中（zhònɡ）
或時橫（hènɡ）死
於肉髻（jì）中出大光明
鞞（pí）殺社窶（jù）嚕
薜（bì）琉璃
缽喇（lá）婆
曷（hé）囉（lā）闍（shé）也
呾（dá）他（tuō）揭多也
三藐三勃陀耶（yé）
呾侄（zhí）他（tuō）
唵（wēnɡ）
三沒（mò）揭帝
莎（suō）訶
受安隱（wěn）樂
清淨澡漱（shù）
至心殷（yīn）重
勿令乏少（shǎo）
像法轉（zhuǎn）時
花鬘（mán）瓔（yīnɡ）珞（luò）
幡（fān）蓋
以五色彩（cǎi）
作囊盛（chéng）之
敷（fū）設高座
皆詣（yì）其所
當知是處無復橫（hènɡ）死
敷清淨座而安處（chǔ）之
散（sàn）種種花
以種種幢（chuáng）幡
隨所樂（yào）願
一切皆遂（suì）
皆悉隱沒（mò）
熊、羆（pí）
惡蠍（xiē）
蚰（yóu）蜒（yán）
汝為信不（fǒu）
唯除一生所系（xì）菩薩
長病羸（léi）瘦
啼（tí）泣（qì）圍繞
見琰（yǎn）魔使
隨其罪福而處（chǔ ）斷之
轉（zhuǎn）讀此經
乃至命難（nàn）
長四十九搩（zhǎ）手
不為諸橫（hènɡ）惡鬼所持
星宿（xiù）變怪難
日月薄蝕（shí）難
赦（shè）諸系閉
無有暴虐（nüè）藥叉等神
皆即隱（yǐn）沒（mò）
妃（fēi）主
散（sàn）雜色花
九橫死耶（yé）
然無醫藥及看（kān）病者
呼諸魍（wǎng）魎（liǎng ）
欲冀（jì）延年
信邪倒（dào）見
橫被王法之所誅戮（lù）
畋（tián）獵嬉戲
耽（dān）淫嗜酒
橫為水溺（nì）
惡獸所啖（dàn）
厭（yā）禱咒詛
起屍鬼等之所中（zhòng）害
頞（è）你羅大將
毗羯（jié）羅大將
我等相率（shuài）
國邑（yì）
以五色縷（lǚ）
揭路荼（tú）
緊捺（nà）洛
回向偈（jì）
願以此功德，莊嚴佛淨土。上報四重恩，下濟三途苦。
若有見聞者。悉發菩提心。盡此一報身。同生極樂國。
（圓滿）
願解如來真實義！