免費Linux系統和生信寶典原創學習教程

2021-02-24 生信寶典

生物信息的學習離不開Linux系統，不管自己寫命令處理數據，還是使用現有的工具。Linux對我們來講最重要的是它強大的命令行功能，可以快速、批量、靈活的處理數據的提取、統計和整理等耗時耗力的重複性工作。事實上在日常生信分析中，多數整理工作也都是用Linux命令的組合完成的，相比於寫完整的Python或Perl程序更簡便快捷；另外，生信分析用到的工具大都只在Linux下運行，而Linux發行版眾多，更新速度不一，軟體的安裝是一個令人頭大的事情。

另外對我們大部分朋友來說，接觸電腦一直都是圖形界面系統，通過單擊、雙擊打開文件、切換目錄、安裝運行軟體都已經運用的得心應手，對文件路徑的概念也不太關注。乍一接觸Linux，會對其組織邏輯不適應，生信寶典公眾號最開始推出Linux教程就是關於文件和目錄的描述，以及與Windows系統的對應，方便做一個快速切換。

文後列出的Linux教程是屬於比較精簡的生信工作者常用的命令和命令組合。與傳統的Linux書籍不同的地方有兩點：

摒棄大部分用不到的Linux命令，只保留生信常用的，學習起來更有的放矢。

增加生信實戰中Linux命令的組合，這是通用Linux教程中所沒有的。通用教程只會提供一塊塊磚，我們是提供組合好的模塊，直接可以應用，避免只見樹木不見森林。

教程有了，還需要一個練習的環境。如果不熟悉Linux時自己安裝是比較麻煩的，所以可以藉助在線免費平臺進行練習。這又體現了我們的教程的又一好處，測試數據自帶於教程中，不依賴外部數據的導入，保證了自身的完整性。

推薦的免費平臺有2個：linuxzoo和codenvy。

linuxzoo

訪問網址：http://linuxzoo.net/，按下圖生信寶典錄製的動畫所示用郵箱註冊，註冊完之後立即可以使用。收到激活郵件點擊後，可永久使用。

註冊後，按圖示點擊選擇喜歡的作業系統，這裡選的是默認的Centos，然後就可以connect。最簡單的打開方式是直接在瀏覽器打開使用, 點擊JScript Telnet即可跳轉登錄界面。如果用根用戶登錄，輸入用戶名root和密碼secure。其它用戶名和密碼都在首頁展示，自己查詢即可獲得。

linuxzoo優點是有根用戶權限，缺點是不能連接外網，但不影響我們大部分代碼的練習。

CODENVY

訪問網址：http://codenvy.io/，也需要先註冊，如果有Github和谷歌帳號的話，可以直接登錄。然後按圖示Create Workspace，任選一個STACK就可以，都是基於Ubuntu系統的，然後等待完成初始化，即可使用了。

優點是有根用戶權限，同時可以連接外網。

教程合集

後臺回復 「生信寶典福利第一波」 獲取完整版教程。

生信寶典-Linux教程.pdf

生信寶典Py3_course.pdf

生信寶典-R學習教程.pdf

系列教程Linux

如果需要學習視頻，我們的生信程序基礎課和生信Linux學習視頻正在團購中，歡迎觀看。點擊閱讀原文 (免費視頻) 可訪問在線視頻。

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