臨床數據不夠?可以挖掘別人的數據發自己的 SCI

2020-12-17 騰訊網

優秀的數據能夠幫助臨床醫生更順利地發文章，但是臨床醫生常常沒時間做實驗，更多的是從病歷裡或者資料庫裡收集數據，導致數據單薄很難支撐文章內容。

這個時候需要的是生信分析——深度的數據挖掘和分析處理，可以幫助臨床醫生通過數據處理得到自己想要的信息，更快速地發文章。

學習哪種生信分析的工具？

眾所周知，R 語言作為統計計算和統計製圖的優秀工具，是生信分析處理裡的科研全能王。

1. 生而為統計

除了提供一些集成的統計工具，它更多提供的是各種數學計算、統計計算的函數，從而使使用者能靈活機動地進行數據分析，甚至創造出符合需要的新統計計算方法。

2. 強大的作圖功能

基本的散點圖、氣泡圖以及高級分析的時序圖、熱圖等都可實現，而且可以靈活地進行調整，直到達到滿意的效果, 不僅符合 SCI 論文要求，圖形更能直觀地反應實驗結果，吸引編輯和讀者喲。

圖片來源：文獻

3. 機器學習

R 語言能夠使用機器學習的方法完整地構建預測模型，能夠很好地完成特徵選擇、建模、模型測試以及預測效果的評價。

4. 數據挖掘與生物信息學

R 語言是數據挖掘神器，可以很快從 GEO，TCGA 等資料庫裡提取到想要的數據，還能進一步尋找、分析差異基因，進行相關研究。

5. 好用、免費的各種工具包

目前 R 的工具包的數量已超過 1 萬，各種包和函數的透明性極好，這使得對函數地調整和改良變得非常便利，這種事情放在任何其他統計軟體裡都近乎奢望。

選擇哪種方式學習 R 語言？

大部分的人會選擇利用零碎時間自己搜集資料學習，很多只是停留在了解理論知識，也沒有合適的伺服器和資料庫能供自己操作練習，遇到問題到處求助解答，找不到 bug 令人頭疼不已，學習過程往往吃力且效率低下。

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來源：創客貼製作

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能夠用 R 語言進行數據分析

掌握 PCA、共表達、聚類、Heatmap、富集、Cytoscape 等分析

掌握 GEO 資料庫數據的下載、挖掘

了解其他領域的方法在醫學領域中的推廣

雖然很難從小白一下子變成 R 語言高手，可是在這裡，你能邁開第一步，不會擔心裝不上各種軟體，不會看不懂反饋的分析圖，給自己信心，才是成為高手的第一步。

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    2、10篇經典套路數據挖掘範文：經典的套路範文，零基礎入門必學的套路，及其簡單。3、GEO臨床數據挖掘發SCI全套視頻+萬能代碼（已更新完畢）：這個視頻教程適合零基礎快速發表SCI的同學，因為它是萬能傻瓜式代碼。
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    在數據挖掘課程研發的早期（2020開春，疫情期間），我們就有預感，它會成為醫學生/臨床醫師首選技能提高課，誠意滿滿的3周馬拉松式授課，第一期就收到了非常棒的評價，見：數據挖掘第一期學習反饋，一個季度過去了，第四期數據挖掘課程也順利落幕，同樣的有學員樂於跟大家分享她參加學習班的筆記和心得體會，如果你看完後覺得有必要，可以考慮一下我們生信技能樹舉辦的最適合醫學生
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    回 答：這裡可以考慮聯合分析的，只要是原作者沒做的內容你都可以嘗試。有時候別人測序目的就是一個小問題，可能分析的時候附帶的結論和結果就沒有寫了，有時候結果多了，可能給自己的文章投稿帶來麻煩，不過正是這樣，數據挖掘才越來越有意義。
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    例如，每當我們用信用卡消費時，商業企業就可以在信用卡結算過程收集商業消費信息，記錄下我們進行消費的時間、地點、感興趣的商品或服務、願意接收的價格水平和支付能力等數據；當我們在申辦信用卡、辦理汽車駕駛執照、填寫商品保修單等其他需要填寫表格的場合時，我們的個人信息就存入了相應的業務資料庫；企業除了自行收集相關業務信息之外，甚至可以從其他公司或機構購買此類信息為自己所用。