自由撰稿人長岡修死在家中，兇手是誰？有人推測說是組織開發科技新城的議員大賀仁策，也有人說是企圖給姐姐古芝秋穗復仇的古芝伸吾。經警官草薙和他的同事內海薰、岸谷等人調查，發現此案與「神探伽利略」湯川學有某種神秘的聯繫，真相究竟如何呢？
東野圭吾的小說《禁斷的魔術》給我們帶來了不一樣的破案故事，撲朔迷離的案情背後是對人性的深刻反思與解讀。每次用不同名字且只付現金入住酒店高級套房的神秘女子是誰呢？她為什麼會突然死在酒店中呢？自由撰稿人長岡修又是被誰殺害在家中的呢？工廠員工古芝伸吾為什麼突然失蹤呢？「神探伽利略」湯川學到底在此案中扮演什麼樣的角色呢？
長岡修因為反對科技新城計劃而開始調查力主建設新城計劃的議員大賀仁策，他發現了大賀仁策和古芝秋穗不同尋常的關係，於是調查了古芝秋穗的死因，並得悉了古芝伸吾的復仇計劃。長岡修聯繫了同樣反對科技新城計劃的勝田幹生，邀他到家中一談。沒想到勝田被大賀仁策重金利誘之下成了間諜，又因為餐廳營業狀況不佳經濟陷入困境，便想用這個情報向大賀仁策狠狠勒索一筆，故對長岡修起了歹意，趁其不備用領帶將其勒死了。
草薙等人調查清楚長岡修的死因後，也得知了古芝伸吾刺殺大賀仁策的計劃。他們請湯川學幫忙一起阻止古芝伸吾，以免他自毀前途。湯川學在千鈞一髮之際說服了古芝伸吾放棄用磁軌炮射殺大賀仁策，成功阻止了一場謀殺。
古芝伸吾本來擁有著非常光明的前途，考上了東京帝都大學，也順利取得了獎學金。若不是與他相依為命的姐姐古芝秋穗突然死亡，他是不會放棄學業的。深愛姐姐的古芝伸吾覺得姐姐的突然死亡很不尋常，便開始追查真相，結果發現了姐姐的死是因為她的情人大賀仁策見死不救造成的。為了給姐姐復仇，古芝伸吾毅然退學並來到一個小工廠打工，藉此機會改進自己中學時候同湯川學一起研製的磁軌炮。待到時機成熟，他便要用改良好的磁軌炮擊殺大賀仁策。幸虧，湯川學勸阻了他，才不致使他造成更大的不幸。
沒有無緣無故的愛，也沒有無緣無故的恨。從這個故事中，我們看到了古芝姐弟之間的深情，也看到了政治家大賀仁策的薄情，同時也看到了勝田的利慾薰心，還有湯川學對古芝伸吾的庇護之情。最難測的是人心，古芝秋穗那樣為大賀仁策考慮，卻沒想到大賀仁策在她命懸一線時選擇視而不見，棄之不顧。本來一個電話就可以救她的命，他卻連一個電話也不願打。那般親密無間的關係，竟也可以這般冷漠，一個人何至於冷酷至此？政治真的是這麼殘酷的東西嗎？一個人為了政治生命就可以捨棄所有的溫情嗎？
人心，永遠是捉摸不透的。正如東野圭吾所說的：這個世界上有兩樣東西不可直視，一個是太陽，一個是人心。不管你在人海中幾經沉浮，你還是無法看透人心。有時候，連我們自己也不明白自己，更何況是別人呢？愛一個人掏心掏肺，恨一個人翻臉無情。愛恨之間，一念之間。為善為惡，也是瞬息萬變。只是，你做出了什麼樣的選擇，就要走什麼樣的路，更要承擔起這份選擇所帶來的種種或好或壞的結果。譬如說大賀仁策，他選擇了政治，也就意味著他捨棄了自己的靈魂。相信，從今以後他也遇不到真心。一個沒有靈魂的人，活著不過是行屍走肉罷了。反倒不如古芝伸吾這些小人物，至少他們活得真實。