各企業、單位出納人員對上述各種歸檔資料必須進行科學的管理，做到妥善保管、存放有序、查找方便；要嚴格執行安全和保密制度，不能隨意堆放，以免毀損、散失和洩密。
一、出納憑證的整理和保管
出納記帳所編制和使用的各種收、付款記帳憑證及其所附原始憑證，一般說來，在出納過帳以後，要傳遞給記帳會計，在年終歸檔前由記帳會計進行整理與保存。出納人員主要要做好原始憑證的整理及全部會計憑證在出納業務處理階段的保管工作。對於一些像「支票申請單」之類的原始憑證，為了保管與查對的便利，平時也可由出納人員單獨保管並整理成冊，年終統一歸檔。
二、出納帳簿的整理和保管
出納帳簿在更換新帳後，應將舊帳歸入會計檔案。移交歸檔前應對舊帳進行整理，對編號、扉頁內容、目錄等項目填寫不全的，應按照有關要求填寫齊全；使用活頁式（如用計算機記帳的單位，帳簿資料輸出裁剪後類似活頁帳）或卡片式輔助帳的單位，對於活頁式或卡片式帳，在歸檔時必須加以裝訂，編齊頁碼，並要像訂本帳一樣加上扉頁，註明單位名稱、所屬時期、共計頁數和記帳人員籤章等，並且要加蓋公章。