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一、先說職能：
海事局的職能是：
（一）擬定和組織實施國家水上安全監督管理和防止船舶汙染、船舶及海上設施檢驗、航海保障以及交通行業安全生產的方針、政策、法規和技術規範、標準。
（二）統一管理水上安全和防止船舶汙染。監督管理船舶所有人安全生產條件和水運企業安全管理體系；調查、處理水上交通事故、船舶汙染事故及水上交通違法案件；歸口管理交通行業安全生產工作。
（三）負責船舶、海上設施檢驗行業管理以及船舶適航和船舶技術管理；管理船舶及海上設施法定檢驗、發證工作；審定船舶檢驗機構和驗船師資質、審批外國驗船組織在華設立代表機構並進行監督管理；負責中國籍船舶登記、發證、檢查和進出港（境）籤證；負責外國籍船舶入出境及在我國港口、水域的監督管理；負責船舶載運危險貨物及其他貨物的安全監督。
（四）負責船員、引航員適任資格培訓、考試、發徵管理。審核和監督管理船員、引航員培訓機構資質及其質量體系；負責海員證件的管理工作。
（五）管理通航秩序、通航環境。負責禁航區、航道（路）、交通管制區、港外錨地和安全作業區等水域的劃定；負責禁航區、航道（路）、交通管制區、錨地和安全作業區等水域的監督管理，維護水上交通秩序；核定船舶靠泊安全條件；核准與通航安全有關的岸線使用和水上水下施工、作業；管理沉船沉物打撈和礙航物清除；管理和發布全國航行警（通）告，辦理國際航行警告系統中國國家協調人的工作；審批外國籍船舶臨時進入我國非開放水域；負責港口對外開放有關審批工作以及中國便利運輸委員會日常工作。
（六）航海保障工作。管理沿海航標無線電導航和水上安全通信；管理海區港口航道測繪並組織編印相關航海圖書資料；歸口管理交通行業測繪工作；組織、協調和指導水上搜尋救助，負責中國海上搜救中心的日常工作。
（七）組織實施國際海事條約；履行「船旗國」及「港口國」監督管理義務，依法維護國家主權；負責有關海事業務國際組織事務和有關國際合作、交流事宜。
（八）組織編制全國海事系統中長期發展規劃和有關計劃；管理所屬單位基本建設、財務、教育、科技、人事、勞動工資、精神文明建設工作；負責船舶港務費、船舶噸稅有關管理工作；負責全國海事系統統計和行風建設工作。
海關的職能是：
海關是國家的進出境監督管理機關，實行垂直管理體制，在組織機構上分為3個層次：第一層次是海關總署；第二層次是廣東分署，天津、上海2個特派員辦事處，41個直屬海關和2所海關學校；第三層次是各直屬海關下轄的562個隸屬海關機構。此外，在布魯塞爾、莫斯科、華盛頓以及香港等地設有派駐機構。中國海關現有關員（含海關緝私警察）48000餘人。
目前，共有國家批准的海、陸、空一類口岸253個，此外還有省級人民政府原來批准的二類口岸近200個。
海關總署是中國海關的領導機關，是中華人民共和國國務院下屬的正部級直屬機構，統一管理全國海關。海關總署機關內設15個部門，並管理6個直屬事業單位、4個社會團體和3個駐外機構。中央紀委監察部在海關總署派駐紀檢組監察局。
依照《中華人民共和國海關法》等有關法律、法規，中國海關主要承擔4項基本任務：監管進出境運輸工具、貨物、物品；徵收關稅和其他稅、費；查緝走私；編制海關統計和辦理其他海關業務。根據這些任務主要履行通關監管、稅收徵管、加工貿易和保稅監管、海關統計、海關稽查、打擊走私、口岸管理等7項職責。
中國海關實行關銜制度。關銜設五等十三級。分別為一等：海關總監、海關副總監；二等：關務監督（一級、二級、三級）；三等：關務督察（一級、二級、三級）；四等：關務督辦（一級、二級、三級）；五等：關務員（一級、二級）。
二、職能概括：
總的來說海關主要是管理進出口的報關、關稅的徵收，其緝私局負責打擊走私等工作，海關設置地不一定旁邊有海（由於大家對海關比較了解，這裡就不多說了）；海事局是交通運輸部下轄副部級單位，負責海上船舶的登記、審查、船員管理、海上交通事故、汙染事故處理等等，有點像海上警察加一定的海上路政職能（是個海上的大管家婆，但水上行業的從業許可權在交通運輸部水運司，因此海事部門是對從業後的單位管理），國家海事局的各直屬局一定設在臨海或臨水，比如長江海事局（臨水）、廣東海事局（臨海） 。
總的說這兩個單位都是很不錯的。海關的工資福利最好，但現在正在下調，辦公環境好，但緝私局容易和走私犯罪接觸危險性高，海關的權利在一定程度上容易滋生腐敗，建議定力不強的考友不要填報；海事局還是不錯的單位，但是除部海事局外都是一般事業編制，工資福利在當地都是不錯的，但水上作業崗位比較辛苦，航標管理等單位辦公地風浪大，條件不是很好。
三、工作環境和工資福利
海關是國家的進出境監督管理機關，實行垂直管理體制，在組織機構上分為3個層次：第一層次是海關總署；第二層次是廣東分署，天津、上海2個特派員辦事處，41個直屬海關和2所海關學校；第三層次是各直屬海關下轄的562個隸屬海關機構。此外，在布魯塞爾、莫斯科、華盛頓以及香港等地設有派駐機構。中國海關現有關員（含海關緝私警察）48000餘人。
目前，共有國家批准的海、陸、空一類口岸253個，此外還有省級人民政府原來批准的二類口岸近200個。
海關總署是中國海關的領導機關，是中華人民共和國國務院下屬的正部級直屬機構，統一管理全國海關。海關總署機關內設15個部門，並管理6個直屬事業單位、4個社會團體和3個駐外機構。中央紀委監察部在海關總署派駐紀檢組監察局。
依照《中華人民共和國海關法》等有關法律、法規，中國海關主要承擔4項基本任務：監管進出境運輸工具、貨物、物品；徵收關稅和其他稅、費；查緝走私；編制海關統計和辦理其他海關業務。根據這些任務主要履行通關監管、稅收徵管、加工貿易和保稅監管、海關統計、海關稽查、打擊走私、口岸管理等7項職責。
中國海關實行關銜制度。關銜設五等十三級。分別為一等：海關總監、海關副總監；二等：關務監督（一級、二級、三級）；三等：關務督察（一級、二級、三級）；四等：關務督辦（一級、二級、三級）；五等：關務員（一級、二級）。
四、報考熱度
海關的報考熱度要遠過於海事局，海事局有些艱苦崗位每年需要調劑完成。
以上是我對兩部門的闡述，總的說，我認為如果是複習比較到位的可報海關，相對較不到位的可報海事。注意海關有大小關，海事有三大海事局福利好，注意你的選擇是要單位好還是要報名人數少。
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