今天將在LOLA11數據集上進行肺葉和肺分割的案例分析,給出部分案例結果,感興趣的趕緊試一試吧。
LOLA11的主要目標是評估用於胸部CT的最新肺葉分割方法的性能。已經發布了許多用於肺和肺葉分割的算法,但是直接比較它們很困難。通常使用不同的評估方法對不同的數據集評估不同的方法。LOLA11提供了具有不同異常情況的胸部CT掃描數據集,為此已建立了肺葉分割參考標準。通過將所有方法與該相同參考標準進行比較,可以進行公正而有意義的評估。LOLA11網站保持開放狀態,鼓勵團隊提交改進的結果。始終歡迎未參加初始階段的團隊註冊並提交結果。這樣,LOLA11網站將繼續在胸部CT掃描中反映出肺和肺葉分割的最新技術水平。一、目標任務在進行胸部CT容積掃描的情況下,任務是分割肺和/或肺葉,即將每個體素標記為六類之一:· 半自動:需要一些用戶輸入。例如,不同的掃描使用不同的手動設置算法參數或使用手動設置的種子點。二、規則數據的收集,LOLA11研究的組織以及網站的維護都需要付出巨大的努力。本著合作科學進步的精神,我們致力於維護此站點,作為基準肺和肺葉分割結果的公共存儲庫。作為回報,我們要求使用此站點的每個人都遵守以下規則。· 在任何情況下,都不得將下載的數據或從這些數據中獲取的任何數據提供給或不重新分配給不屬於註冊團隊的人員。· 註冊團隊時輸入的所有信息,包括聯繫人的姓名,所屬組織(團隊的聯繫人所服務的機構,組織或公司)以及電子郵件地址都必須完整且正確。換句話說,不允許匿名註冊。如果要匿名提交(例如,在將結果提交到需要匿名提交的會議時),請首先聯繫s.kerkstra@rad.umcn.nl。· 從本網站下載的數據只能用於準備要在本網站上提交的條目。數據不得在科學研究中用於其他目的,也不得用於訓練或開發其他算法,包括但不限於用於商業產品的算法。· 在此站點上提交的每個結果都必須隨附描述系統詳細信息的pdf文件。LOLA11組織者保留拒絕評估其說明不符合最低要求的系統的權利。有關所需描述的更多說明在下面給出。· 如果將本研究中算法的結果用於科學出版物(期刊出版物,會議論文,技術報告,大會和會議的演示文稿),則必須進行適當的引用。在發表有關該研究的期刊論文之前,請引用網站URL http://lola11.com。期刊論文發表後,必須引用該論文。該頁面將在那時更新。· 上傳到本網站的結果將在該網站上公開提供。提交結果即表示您授予我們這樣做的權限。團隊保留對該方法的完全所有權和權利。· 為了使我們能夠維護與LOLA11研究相關的出版物清單,團隊需要將(部分地)基於該站點數據的任何出版物通知該站點的維護者。三、數據對於本研究,許多胸部CT掃描可供下載。掃描來自各種來源,代表了各種臨床上常見的掃描儀和協議。選擇這些掃描,使得在大約一半的掃描中,肺和/或肺葉的分割被認為是「容易的」,而在另一半中則被認為是「困難的」。當前的最大切片間距為1.5毫米,其中大多數掃描(各向同性)。為了確保評估的一致性,無法下載數據的參考分割結果,以後也將不再提供參考分割結果。組織者將案件分為「簡單」案件和「困難」案件。容易和困難的定義可以基於存在的異常程度,但是,分割任務的困難並不總是那麼容易定義的,例如,儘管肺結核很大,但對於存在嚴重肺氣腫的掃描對於肺分割算法來說通常還是很容易的存在的異常肺組織數量。因此,我們選擇根據研討會的已提交算法的結果來定義簡單和困難:通過覆蓋所有結果,方法之間幾乎沒有重疊的區域可以定義為難以分割,其中所有方法都一致的區域易於分割。基於此,對於肺和/或肺葉分割,掃描分為易或難。下載地址:https://www.dropbox.com/sh/wzgqzkifjjl8end/AADHxyrL1IbljZVcxzpumr3ga?dl=0四、參考標準協議參考標準是通過手動分割肺和肺葉而產生的。使用一組規則來指示肺段在肺門區域與肺血管和支氣管相交的位置。這些交叉點遠端的支氣管和肺血管樹的部分被認為是肺容積的一部分。右肺:上葉:在右上葉支氣管第一次分裂之前立即:在右中葉支氣管第一次分裂之前(劃分為4/5)下葉:在右下葉支氣管分裂之前立即基底節段性支氣管(分為7/8/9/10)。請注意,右下葉的頂端或上段支氣管(6)將包括在肺容積中。左肺:上葉:在左上支氣管第一次分裂之前立即下支葉/舌狀支:在左下葉支氣管第一次分裂之前立即分裂(分為4/5)下葉:在將左下葉支氣管分割為基底節段性支氣管之前(分成7/8/9/10)。請注意,左下葉的頂部或上段支氣管(6)將包括在肺容積中。