網狀Meta分析三個假設檢驗的完成(一)

2021-02-15 逍遙君自習室

上一篇給大家介紹了網狀Meta分析的第4步,就是概率排序分析和作圖(網狀Meta分析概率排序分析及作圖),今天繼續我們往下面走,這次分享的是第5步:三個假設的檢驗,就是對同質性、相似性和一致性進行檢驗,因為內容比較多,今天主要分享同質性、相似性的檢驗方法。
3. 網狀Meta分析(整合直接比較和間接比較的結果,繪製相關圖形)6. 偏倚風險評估、文獻質量評價、敏感性分析、亞組分析、meta回歸等等網狀Meta分析裡提到的同質性檢驗實際上就是普通Meta分析常說的異質性檢驗。舉個例子,你納入網狀Meta分析有3種治療措施A、B、C,納入的文獻中有A和B直接比較的文獻10篇,B和C直接比較的文獻13篇,A和C直接比較的文獻12篇。那麼你的網狀Meta分析中就要包含A和B、B和C、A和C直接比較的普通Meta分析異質性分析結果。普通Meta分析異質性分析前面的文章中已經專門具體寫過,就是從臨床異質性、方法學異質性和統計學異質性三個方面去分析,大家可以去看前面的文章(聊聊Meta分析異質性的檢驗和處理)。最後這個異質性定量分析的結果會在直接比較的森林圖裡展示出來,主要就是看I2值。有的同學會提到網狀Meta分析不是應該考慮整體同質性嗎? 實際上在做網狀Meta分析的時候不需要做這個,你可以去看頂刊的網狀Meta分析文章都是做的直接比較的異質性分析。為什麼這麼做就行了,因為如果直接比較的文獻之間都沒有同質性,那就談不上整體的同質性,根本就不適合做網狀Meta分析。最後總結下網狀Meta分析的同質性檢驗實際上就是普通Meta分析的異質性分析定性用Q檢驗,定量用I2值,另外還可以比較隨機效應模型和固定效應模型的結果(這個在前面提到的一篇JAMA範文裡作者用Bland–Altman圖示法來展示了隨機效應模型和固定效應模型比較的結果),在此基礎上還可以做亞組分析和Meta回歸來找異質性來源,這個就是最後一步的事情了。理論上講,隨機效應模型和固定效應模型兩種方法一般不會獲得完全相同的結果,但是會具有一定趨勢的差異,啥意思呢?就是說一種方法的測量結果總是大於(或小於)另一種方法,這種系統誤差就是我們常說的「偏倚」。Bland-Altman法主要是計算出兩種方法測量結果的「95%一致性界限(95% limits of agreement, 95% LoA)」,並用圖形的方法直觀地反映出這個一致性界限——通常以測量結果的差值為縱軸,以測量結果的均數為橫軸,繪製散點圖,並標註出95%一致性界限。最後得出兩種方法是否具有同質性的結論。如果兩個測量結果的差異位於95% LoA內,則可以認為這兩種方法測量結果具有較好的同質性。這個Bland-Altman圖統計軟體都可以做,最常用的傻瓜式軟體是Medcalc,點點菜單就完成了,R語言來做當然是沒有問題的因為我們做網狀Meta分析全程都是用R,所以這裡我把R的代碼給到大家,主要用到的就是BlandAltmanLeh這個R包,如果打算做這個圖的可以試試。(2)設置工作路徑並安裝BlandAltmanLeh包(3)導入數據#FE指的是固定效應模型的均值,RE指的是隨機效應模型的均值,注意順序,用FE-RE, silente=F,同時給出統計量。默認的LoA計算是用差值mean±1.96SD,並且給出95%置信區間,作出來的圖如下,所有的點都95%LoA範圍內說明同質性比較好。所謂的相似性我們還是用上面的例子來舉例,我們要做A和B的間接比較,共同對照組是C,那麼相似性指的就是A和C直接比較和B和C直接比較兩者之間的相似性。相似性目前還沒有公認的統計學方法,主要還是靠主觀判斷,可以從臨床相似性和方法相似性來分析,這個其實跟普通Meta分析探討異質性也是一樣的思想。P主要指的是病人特徵,包括性別、年齡、併發症、樣本來源、納入排除標準。也就是研究設計來分析,包括隨機的方法、盲法、分配隱藏等等。既然沒有定量的統計學方法,那麼如何主觀判斷是否相似呢?實際上只要會影響到試驗效應的關鍵特徵相似即可,一些不會影響到試驗效應的特徵不相似是沒有關係的。第5步的重點就是一致性檢驗,這個內容就比較多了,我留在下周重點介紹。順便提一下,很多同學希望我把網狀Meta分析錄製成視頻分享,因為自己確實任務比較多,錄製視頻需要時間,所以就先寫成帖子來跟大家分享,大家如果有普通Meta分析的基礎,只要看我的這些帖子基本就能完成網狀Meta分析的製作,有沒有視頻實際上也不那麼重要了。

6.網狀Meta分析進行模型構建及圖形繪製

7.網狀Meta分析概率排序分析及作圖

逍遙君:南京醫科大學博士,主治醫師,發表論文20餘篇,第一作者或通訊作者SCI論文8篇,主持國自然及各級別課題多項,著有《逍遙君說科研系列課程》,主講Meta分析、基金標書、論文寫作,丁香園、募格學術金牌講師,同時具有多年基金、股市、數字貨幣投資經驗。

精彩專欄,點擊直達

科研經驗 | 文獻精讀 | 論文修煉 | 課題基金 | 神器工具 

循證醫學 | 留學深造 | 醫路有你 | 觀點時評 | 醫學統計

醫護理財 | 課外生活 | 碩博考研 | 心路歷程 | 研究生日常


哥哥姐姐弟弟妹妹,送朵花吧

相關焦點

  • 網狀Meta分析系列文章(一):網狀Meta分析背後的原理是什麼
    回到圖1中,假設現在分別進行3個不同的pairwise Meta分析,分別得到3個不同的結果: 然而,這三個結果並不能得到一個一致的決策來決定誰是最優的幹預。一個簡單的例子假設A、B、C三個人的體重比較為:A比B重2kg,B比C重3kg,那麼我們應該得知A比C重5kg。然而此時我們又得知A比C僅重2kg,那麼我們無法得出哪個人最重,因為出現了不一致。
  • 網狀Meta分析系列文章(二):貝葉斯框架
    通常情況下這兩類方法的選擇沒有優劣之分,但是在這裡的網狀Meta分析中,貝葉斯方法有一些獨特的優勢,比如靈活性高、天然的決策模型等等,因此本文主要介紹貝葉斯網狀Meta分析模型。首先考慮Pairwise Meta分析,假設有M個試驗,均為幹預1對比幹預2。
  • 2天一夜教會您獨立完成Meta分析和網狀Meta分析線上學習班(11月28-29日 線上班)
    分析和網狀meta分析為案例主線,全程實戰講解,現場教學,現場答疑,演示全部代碼和操作,全程錄製屏幕,不限時間回放。課後自己可以獨立完成1篇meta分析和1篇網狀meta分析。 猴哥:孫老師,主講《meta分析的選題、寫作與投稿》,碩士生導師,副主任醫師。主持多項國家級基金項目,歷任3家公司數據分析師,共發表meta分析文章25篇,累積影響因子100+。
  • 網狀Meta分析概率排序分析及作圖
    Meta分析的過程以及相關圖形的製作(網狀Meta分析進行模型構建及圖形繪製),今天接著上一個帖子繼續分享網狀Meta分析的製作,我們進行到了第四步就是繪製累積概率排序圖的製作,我們繼續用上個帖子的數據,軟體還是用R 語言 gemtc 程序包通過調用對應的 rjags 程序包(提前安裝JAGS軟體)來執行。
  • NMA(網狀meta分析)stata簡易教程(2)之二 - 網狀圖的千變萬化
    相關問題如果有疑惑,請先查看前期網狀meta分析相關推文:網狀Meta分析簡介與實戰NMA(網狀meta分析)stata簡易教程 - 之一   Open the data editor window:#輸入Edit The variable study contains the ID
  • 【Meta分析】32條軍規完成網狀Meta分析的製作
    當直接研究證據缺乏時,可通過對比共同對照措施進行間接比較,直接研究證據不足時,可合併直接證據和間接證據增加證據的可信性,而這種合成間接證據與直接證據進行不同幹預措施排序比較的方法被稱作網狀Meta分析,在接下來的推送中,我們將轉載逍遙君自習室介紹網狀Meta分析的相關內容供讀者學習。
  • 2天1夜教會您獨立完成Meta分析和網狀Meta分析線上學習班(免費提供所有數據、代碼3月20-21日 線上班)
    2天1夜教會您獨立完成Meta分析和網狀Meta分析線上學習班(免費提供所有數據、代碼3月20-21日 線上班)歡迎新老客戶預定消費預存卡
  • 【Meta分析】網狀Meta分析中網絡證據圖的繪製(R語言版)
    當直接研究證據缺乏時,可通過對比共同對照措施進行間接比較,直接研究證據不足時,可合併直接證據和間接證據增加證據的可信性,而這種合成間接證據與直接證據進行不同幹預措施排序比較的方法被稱作網狀Meta分析,在接下來的推送中,我們將轉載逍遙君自習室介紹網狀Meta分析的相關內容供讀者學習。
  • 2天1夜教會您獨立完成Meta分析和網狀Meta分析線上學習班(免費提供所有數據、代碼12月26-27日 線上班)
    線上互動好 線下服務好 老師建群長期耐心答疑本培訓班以1篇meta分析和網狀meta分析為案例主線,全程實戰講解,現場教學,現場答疑,課後自己可以獨立完成1篇meta分析和1篇網狀meta分析。 猴哥:孫老師,主講《meta分析的選題、寫作與投稿》,碩士生導師,副主任醫師。主持多項國家級基金項目,歷任3家公司數據分析師,共發表meta分析文章25篇,累積影響因子100+。
  • 全國循證醫學Meta分析及網狀Meta三天精講學習班
    通過實際操作和訓練,學員們掌握了Meta分析和各種軟體使用的方法。學員們普遍反映授課老師朱教授能深入淺出,結合實際,講得透徹,受益非淺。此外,自2018年起,應廣大學員要求,本培訓課程特增加了使用R軟體進行網狀Meta分析實際操作內容,使得學員能獨立進行常見的網狀Meta分析。
  • 2天1夜教會您獨立完成Meta分析和網狀Meta分析線上學習班(免費提供所有數據、代碼 2021年3月20-21日 線上)
    2天1夜教會您獨立完成Meta分析和網狀Meta分析線上學習班(免費提供所有數據、代碼)           瑋瑜主辦 2021年3月20-21日 周末兩天線上授課
  • 2天1夜教會您獨立完成Meta分析和網狀Meta分析線上學習班(免費提供所有數據、代碼1月30-31日 線上班)
    線上互動好 線下服務好 老師建群長期耐心答疑本培訓班以1篇meta分析和網狀meta分析為案例主線,全程實戰講解,現場教學,現場答疑,課後自己可以獨立完成1篇meta分析和1篇網狀meta分析。 猴哥:孫老師,主講《meta分析的選題、寫作與投稿》,碩士生導師,副主任醫師。主持多項國家級基金項目,歷任3家公司數據分析師,共發表meta分析文章25篇,累積影響因子100+。
  • Meta分析的類型簡介
    6.2網狀 Meta分析 在臨床實踐中 ,若有一系列的藥物可以治療某種疾病 ,但 RCT均是藥物與安慰劑的對照 ,而藥物互相之間的 RCT都沒有進行或很少 ,那麼在這種情況下 ,就需要將間接比較和直接比較的證據進行合併,即行網狀 Meta分析 (network meta—analysis)(圖 2) 。
  • 循證醫學和Meta分析(包含網狀meta)培訓班介紹(昆明,北京,上海,廣州班)
    醫藥加循證醫學和Meta分析(包含網狀meta)培訓班介紹
  • Meta分析系列之:常見的Meta分析類型
    幹預性Meta分析。一般這種meta分析以合併臨床試驗,如隨機對照試驗、非隨機對照試驗等研究的效應量為主。這類Meta分析方法學最成熟,文章也最多。例如:A藥與B藥治療某病療效及安全性對比的Meta分析
  • 當R2WinBUGS遇上網狀Meta分析(轉發領獎)
    留言說出你想學習的內容,還有優惠哦~本期活動:將本文轉發至2個100人以上的群,並轉發至朋友圈配以文字:「轉發有獎勵,每轉發至2個100人以上的群且集50個贊(截圖為憑證),送《系統評價/meta分析理論與實踐》精裝版一本,一大波書已準備好,搶完為止
  • 網狀Meta分析的步驟,看完這篇就懂了
    前面給大家介紹過目前Meta分析的5個熱點(站在風口才好發文章,關於Meta分析的5個熱點),有很多小夥伴想了解網狀Meta分析(
  • 醫生如何書寫系統評價和meta分析?
    醫生如何書寫系統評價和meta分析?   一個清晰的問題應該既有臨床意義又有嚴格定義的研究人群、幹預方式、對照和結局指標。當問題不清晰時,系統評價就會模糊、結構差、異質性強,此時會產生一系列風險,並且得出無效的結果。我們推薦在製作系統評價之前先寫作或發表一個研究計劃書(15,16)。此研究計劃書應充分定義納入排除標準、研究對象、幹預、結局指標和統計分析策略。
  • 合理利用假設檢驗,讓你看清產品數據
    你真的會數據分析嗎?什麼才是數據分析的正確打開方式?文章中舉出了幾種數據分析的常用例子與檢驗方式,一起來學習下。比如下圖中如果是看UV,那就把每天的數據匯總出來,然後按照每周或者每月拉一下平均值,做個折線圖,是升還是降,一目了然。細緻一點就是對於一些關鍵的時間節點進行單獨分析,比如7月25日的上升期是做了哪些功能或者活動,導致UV的整體提升。然而,這其實是非常粗糙的一種分析數據的方式,只是停留在數據的表面,並不足以是判斷數據變化的依據。
  • 用R語言進行連續型變量的網狀meta分析之詳細教程
    圖 33.2 設置network model在選取具有網狀meta 分析功能軟體之前,我們需要對model 進行相關設置,需要「mtc.model()」命令,具體命令如下:model <- mtc.model(network,type = "consistency",