同濟大學和南開大學兩所學校都是國內老牌高校了，解放前兩所學校的名氣就相對較大，解放後兩所學校分別被調整，同濟大學調整為土木為主的高校；而南開大學則是以文理為主的綜合性大學。兩所學校都是985工程，世界一流大學建設高校，而且很早就列入了全國重點大學行列，屬於國內傳統名校之一。
建國之初，兩所學校的實力差距並不大，綜合實力上來看，南開大學更佔優勢，畢竟他是文理為主的高校，而且又是總理母校相對更有「精氣神」；同時期的同濟大學，則是土木三駕馬車之一，但是學科領域相對單一，拓展領域略顯不足。恢復高考之後，南開大學進入鼎盛時期，聞名全國，四大名校之一；同期的同濟大學雖然也是名校，只是屬於區域名校，根本無法同南開大學抗衡。
2000年左右的高校合併潮，使得同濟大學「鹹魚翻身」，他合併了幾所學校，尤其是合併了上海鐵道大學，為同濟大學的土木工程打開了另外一個應用天空，使得同濟大學的實力迅速躥升。隨著上海市的產業轉型，向高精尖邁進，使得同濟大學的優勢倍加明顯，更為突出，尤其是高鐵、交通、建築、土木、海洋工程等領域的成果，使得同濟大學知名度大漲，實力更是爆棚。
南開大學，近些年確實有些沒落，只有醫學領域在提高，其他領域成果都不是很顯著，照比鼎盛時期的成果來講，下滑不少。從綜合實力上來講，同濟大學的實力確實強於南開大學，這是不爭的事實，但是從知名度上來講，同濟大學也確實同南開大學還有一定差距，畢竟南開大學曾經是四大名校之一，威名尚在！