據臺灣《聯合晚報》報導，臺軍愛國者飛彈送往美國性能提升為愛國者飛彈三型，已秘密運返臺灣，第一批部署臺北市南港執行防空戰備任務，希望未來能順利陸續完成六套新購愛國者三型飛彈，加上三套現有裝備性能提至愛國者三型飛彈的換裝任務。
根據臺灣軍方規劃，愛國者三型飛彈將部署在臺北、臺中、臺南、高雄與屏東地區，執行反飛彈、反戰機的防空任務。
臺軍提升現有愛國者飛彈性能為愛國者三型，同時新購愛國者三型飛彈的疾鋒案，總預算高達1791億元(新臺幣，下同)，因為預算取得困難，成軍時程延後，從2007年至2011年間，先完成四套新購加三套性能提升案。另外短缺兩套愛國者三型採購預算，軍方希望與中東某國共同分攤研發生產經費，降低臺灣方面的預算需求，但是目前尚未編列。
目前第一套將臺軍愛國者二型飛彈提升為三型的系統，已部署臺北市南港。據指出，由於愛國者飛彈系統區分彈體與軟體，外界傳美方尚未將愛國者三型飛彈彈體運抵臺灣，但性能提升後的飛彈系統軟體，臺灣方面已經可以運用。但是，臺灣防務部門軍事發言人羅紹和並未說明飛彈彈體是否已運交臺軍。
臺灣軍方表示，臺軍愛國者飛彈性提提升為愛國者三型後，射控系統、通訊與彈體都升級。每套愛三執行獨立防護指管中心、機場、 雷達站等要地任務，愛三彈體可不靠雷達照明自行接戰目標，因體積小，每個發射架可儲存16枚，發射架與雷達距離可達30公裡，野戰部署較有彈性，目前新北市萬裡營區的愛國者二型已送至美國原廠進行性能提升。
臺軍方指，由愛國者二型性能提升的愛國者三型飛彈，部署南港、新店與萬裡，新購愛國者三型飛彈，部署臺灣中部、南部，包括臺中清泉崗空軍基地，高雄仁武區與屏東市的屏東基地，臺南市的臺南空軍基地，另外還包括嘉義水上基地。臺灣防務部門對此事不評述。 (來源：臺灣聯合新聞網)