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LCMS是常用的檢測手段，下面對其一些基礎知識進行介紹,，內容整理自網絡，版權歸原作者所有。
質譜分析是先將物質離子化，按離子的質荷比分離，然後測量各種離子譜峰的強度而實現分析目的的一種分析方法。質譜分析原理：分子在真空中被電子轟擊，形成離子，通過電磁場按不同m/e分離；譜圖的表示方法：以棒圖形式表示離子的相對峰度隨m/e的變化；提供的信息：分子離子及碎片離子的質量數及其相對峰度，提供分子量，元素組成及結構的信息，可以用於測定相對分子質量、化合物分子式及結構式。
質譜樣品：適合分析相對分子質量為50~2000 μ的液體、固體有機化合物樣品，試樣應儘可能為純淨的單一組分。
以下是FT-ICR質譜儀工作過程：
離子產生
離子收集
離子傳輸
FT-ICR質譜的分析器是一個具有均勻（超導）磁場的空腔，離子在垂直於磁場的圓形軌道上作迴旋運動，迴旋頻率僅與磁場強度和離子的質荷比有關，因此可以分離不同質荷比的離子，並得到質荷比相關的圖譜。
離子迴旋運動
傅立葉變換
相關概念
離子豐度（Abundance of ions）：檢測器檢測到離子信號強度。
相對離子豐度（Relative abundance of ions）：以質譜圖中指定質荷比範圍內最強峰（基峰）的強度為100%。其它離子峰對其歸一化所得到的強度。標準質譜圖均以離子相對豐度值為縱坐標。離子的豐度與物質的含量相關，因此是質譜定量的基礎。
EI：電子轟擊源質譜，常用於GC-MS系統。
API：大氣壓電離源質譜，常用於LC-MS系統。
MALDI：基質輔助雷射解吸電離源質譜，常用於生物大分子分析。
HPLC：高效液相色譜法（High Performance Liquid Chromatography \ HPLC）又稱「高壓液相色譜」、「高速液相色譜」、「高分離度液相色譜」、「近代柱色譜」等。高效液相色譜是色譜法的一個重要分支，以液體為流動相，採用高壓輸液系統，將具有不同極性的單一溶劑或不同比例的混合溶劑、緩衝液等流動相泵入裝有固定相的色譜柱，在柱內各成分被分離後，進入檢測器進行檢測，從而實現對試樣的分析。
UPLC：超高效液相色譜（Ultra Performance Liquid Chromatography，UPLC）色譜理論認為提高色譜柱的效能（efficiency）就能增加儀器的解析度（resolution），而運用粒徑低於2μm的小顆粒無疑是增加效能的好方法。但減小固定相的粒度以增加色譜柱效能一直是色譜儀器科學的瓶頸，因為小顆粒不僅要求系統能承受高於目前極限壓力（比如6000psi/400bar），需要更小的系統體積（死體積），並且需要能適應可能只有幾秒峰寬的高速檢測器。
ESI：Electron Spray Ionization的縮寫，意思是電噴霧離子源，是質譜儀中較為常用的一種離子化方式。電噴霧離子源屬於一種軟電離源,能使大質量的有機分子生成帶多電荷的離子。
APCI：Atmospheric Pressure Chemical Ionization的縮寫，大氣壓化學電離源 APCI是20世紀90年代後使用的液相色譜和質譜聯用的接口技術之一。溶液在氣流作用下形成氣溶膠，蒸發，電暈放電使溶劑電離，電子轉移或電子捕獲，使樣品帶電。
常見的離子片段 6. 其他注意事項：一、甲苯等在LCMS上有吸收峰的試劑作為溶劑的反應，在送LCMS監測前一定要先除掉，不然會影響對反應的判斷，特別是溶劑峰剛好和產物或原料峰出在一個位置時。二、當點板和LCMS有很大出入時，LCMS要換其他方法重新監測，切換正負模式或梯度，防止峰的重疊。三、一般監測前，測樣要濾膜過濾，所以要確保所測樣品要完全溶解。
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