是分子結構介於胺基酸和蛋白質之間的一類化合物，是蛋白質的結構與功能片段，本身具有很強的生物活性。
功能性蛋白肽的分類：按來源分為：動物源功能性蛋白肽和植物源功能性蛋白肽。
動物功能性蛋白肽：動物蛋白通過特定水解酶作用而降解為對人體健康有益的片段。主要包括乳蛋白肽、膠原肽、水產肽和畜產肽等。例如：從牛奶蛋白質中可得到酪蛋白磷酸肽、免疫調節酪蛋白肽、抗氧化肽等。
植物功能性蛋白肽：植物蛋白通過水解酶酶解或發酵形成的對人體有益的肽段。用來製備活性多肽的植物蛋白主要有：豆類、穀類、麻類植物的種子和葵花籽。例如：以玉米蛋白作為原料，經不同的處理過程能得到抗氧化肽、降壓肽、抗腫瘤肽等不同功能肽。
功能性蛋白肽的生理功能：功能性蛋白肽是一類具有重要生理功能的活性物質。具有傳遞生理信息.調節生理功能的作用，對於人體的神經、消化、生殖、生長、運動、代謝、循環等系統的正常生理活動的維持與調節非常重要。
一起來看一下功能性蛋白肽在食品中的應用：1.蒙牛 新養道 珍養肽牛奶配料表：
生牛乳、
小麥低聚肽、
玉米低聚肽粉、醋酸維生素A、維生素D3、dl-α-酯酸生育酚、食品添加劑（蔗糖脂肪酸酯、單硬脂酸甘油酯、結冷膠、乳糖酶）
小麥低聚肽（添加量：5mg/100mL）
玉米低聚肽粉（添加量：5mg/100mL）
2.佳寶 兒童成長酸奶配料表：
生牛乳≥90%、白砂糖、果蔬粉、
酪蛋白磷酸肽（CPP）、嗜熱鏈球菌（Streptococcus Thermophilus）、保加利亞乳桿菌（Lactobacillus Bulgaricus）、果膠、瓊脂、食用香精
3.南方黑芝麻 黑黑穀物餐 果蔬穀物餐配料表：
黑米（添加量：20%）、白砂糖、黑糯米、葡萄糖、麥芽糊精、黑芝麻（添加量：6%）、黑豆（添加量：2%）、麥基片（小麥、大米、玉米、食用葡萄糖）、澱粉、凍幹蘋果、凍幹胡蘿蔔、植脂末、
大豆肽粉、抗壞血酸。
4.南方黑芝麻 黑黑穀物餐 紫山藥穀物餐配料表：
黑米（添加量：20%）、白砂糖、黑糯米、葡萄糖、麥芽糊精、黑芝麻（添加量：6%）、燕麥、黑豆（添加量：2%）、麥基片（小麥、大米、玉米、食用葡萄糖）、食用木薯澱粉、紫薯、紫山藥、植脂末、
大豆肽粉、抗壞血酸。
5.農夫山泉 尖叫 運動飲料 多肽型 西柚味配料表：
水、白砂糖、果葡糖漿、食品添加劑（檸檬酸、檸檬酸鈉、氯化鉀）、食用香精、牛磺酸、
大豆肽粉、食用鹽（不含碘）、煙醯胺、維生素B6（鹽酸吡哆醇）
從我們平時經常看到的添加功能性蛋白肽的產品的配料表中，能看出來經常用到的功能性蛋白肽有大豆肽、玉米肽、乳肽、酪蛋白磷酸肽等。功能性蛋白肽因其獨特的功能特性和營養特性已成為當前食品學界研究最為熱門的課題之一，另外在醫藥、化妝品等行業也得到較廣泛的應用。目前，以活性肽為功能因子的保健食品和含肽的普通食品已形成產業，成為食品和保健品領域的熱點和新的經濟增長點。
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