中國科學技術大學、四川大學、西北農林科技大學、東南大學、大連理工大學抓住高校特點，結合學校實際，出實招、求實效，深入開展「四風」方面突出問題專項整治。
中國科學技術大學開展厲行節約反對浪費專項治理。一是將厲行節約反對浪費工作情況納入領導幹部考核的重要內容。制定貫徹落實《黨政機關厲行節約反對浪費條例》實施辦法，把厲行節約反對浪費工作情況納入檢查、考核指標體系，列為領導幹部述職述廉的重要內容進行測評。二是健全具體實施辦法。出臺《關於公務招待等五項費用財務報銷的審批規定》、《公務用車管理辦法》、《關於在國內外交往中收受禮品實行登記制度的規定》等規章制度。三是加強審計監督。開發「三公」經費信息化審批系統，加強對各種費用管理中的網絡申報、審批和分類管理，及時進行信息公開，認真做好統計分析和監督管理。加強對重點項目的內部審計，及時發現和整改經費管理中存在問題。四是規範預算管理和財務報銷程序。落實綜合預算要求，將各項收入和支出納入部門預算。建立國內公務接待費用支出清單制度，如實反映接待對象、公務活動、接待費用等情況，清單作為財務報銷憑證並接受審計。2013年學校會議費同比減少92.4萬元，因公出國（境）費減少67萬元，公務接待費減少121.7萬元。
四川大學集中整治辦學治校中侵害群眾利益行為。一是整治學術不端。出臺《加強教風學風建設的若干意見》和《加強學術誠信體系建設的實施辦法》，成立學術道德與學術誠信管理辦公室和研究生廉潔文化促進會，向全校師生發放《學術道德規範讀本》，啟用論文抄襲檢測系統，對發現的學術不端行為及時嚴肅處理。二是推進陽光招生。常設招生工作領導小組和招生監察工作組，制定完善招生規章制度，堅持在教育部陽光高考信息平臺、省級招生管理部門、招生高校和考生所在中學公開招生結果的四級公示制度，確保普通類招生和特殊類招生公平。三是規範教育收費和附屬醫院辦醫行醫。深化學校管理，規範教育收費，堅決查處亂辦班、亂收費行為。堅決糾正附屬醫院醫療衛生方面損害群眾利益行為，嚴肅查處醫藥購銷和辦醫行醫中的不正之風問題，2013年共妥善處理232例醫療服務方面的信訪。
西北農林科技大學開展違規佔用學校公共資源專項治理。一是健全有關制度。根據《教育部直屬高等學校國有資產管理暫行辦法》有關精神，結合學校實際，對學校國有資產管理辦法進行修訂，對進一步健全管理機構、明確管理職責、優化資產配置、加強資產使用和處置管理等進行明確規定。二是加強公用房屋管理調控。按照公用房屋資源優先滿足教學、科研工作需要原則，依據國家有關規定，制定印發《公用房屋分配使用辦法》，嚴格控制行政辦公用房面積，嚴格規定教學、科研、辦公等各類用房使用和分配標準，明確細化有償使用收費標準，有效解決院系之間佔有公用房資源不平衡、利用效率低下等問題。三是開展全面清查。對全校利用固定資產對外出租、出借情況，重點對公用房屋、土地、儀器設備等進行清查清理，有序推進違規佔用辦公、教學、科研場所和設施等公共資源專項清查治理工作，進一步提高資產管理水平。
東南大學專項整治學術資源配置不合理問題。一是優化研究生招生指標分配。建立健全研究生招生規模、結構、布局與經濟社會發展相適應的動態調整機制，優先支持優勢學科、基礎學科、前沿學科和國家重大需求學科的招生指標，同時對不適應社會需求、培養質量低的專業逐年減招或停招；加強對研究生導師資格的年度審核，對在學術能力和師德表現上存在問題的導師及時採取措施，限制甚至取消招生資格，最大限度發揮現有招生指標效益。二是規範職稱評定。在職稱評審專家的遴選和組成上，在學部範圍內組建大專家庫並隨機抽取；科學評價教師學術業績，在匿名外審環節增加5位校外專家，提升同行評議參考價值，將評價意見作為評審重要依據。三是完善科研經費管理分配製度。將各類科研經費使用全部納入學校財務統一管理，建立科研經費全額成本核算制度，健全科研經費使用和管理的檢查約束機制，促進科研經費使用的合理化；對國家撥付的各類科研經費分配和校內科研項目立項過程，嚴格執行事前公布、事中公開和事後公示制度，推進科研經費分配公開公平。
大連理工大學排查整治科研經費使用管理不規範問題。成立科研經費審計工作領導小組，對2010年以來發生收支業務的所有科研項目進行專項檢查。摸清現有科研項目規模、經費總量、管理模式等情況，檢查科研經費管理信息系統及科研服務能力能否滿足科研活動需要。梳理現行科研項目管理、經費管理、行為規範的制度和辦法，檢查管理制度是否健全，責任主體是否明確，部門職責是否清晰。對照國家現行科研經費管理規定，檢查科研項目立項申報、預算編制、預算調整是否符合要求。查找科研經費使用管理中存在的突出問題，檢查縱向和橫向科研經費是否全部納入學校財務統一管理，外撥經費是否經過嚴格審核，是否存在違規支出科研經費行為。了解科研人員薪酬待遇水平和間接費用計提使用情況，檢查間接費用的計提、分配和使用是否合理，績效管理是否有利於調動科研人員積極性。檢查內控和監督機制是否健全，項目管理和經費使用是否公開透明，科研行為是否規範，責任追究制度是否落實。