Nature:鑑定出宮頸癌的新的基因組特徵

2017年1月25日/生物谷BIOON/---在一項新的研究中，來自癌症基因組圖譜研究網絡（The Cancer Genome Atlas Research Network, TCGA）的研究人員鑑定出宮頸癌的新的基因組特徵和分子特徵。這將有助於對這種疾病進行分型，並且可能有助開發出最適合每名宮頸癌病人的靶向療法。他們對178種原發性宮頸癌的基因組進行完整的分析，結果發現70%以上的宮頸瘤在一到兩種重要的細胞信號通路中發生基因組變化。令人意外的是，他們也發現一小部分宮頸瘤並不表現出人乳頭瘤病毒（HPV）感染的證據。相關研究結果於2017年1月23日在線發表在

Nature

期刊上，論文標題為「Integrated genomic and molecular characterization of cervical cancer」。

在全世界，每年有50多萬新發宮頸癌病例和25多萬宮頸癌死亡病例。美國國家癌症研究所代理主任Douglas Lowy博士說，「絕大多數宮頸癌病例是由致癌性HPV持續感染所導致的。多年來，已有有效地抵抗大多數致癌性HPV類型的預防性疫苗面世，接種它們有長期的潛力來降低宮頸癌病例數量。」

Lowy博士注意到，「然而，大多數在未來的幾十年內患上宮頸癌的女性已超過推薦進行接種疫苗的年齡，因而將不會獲得這種疫苗的保護。因此，宮頸癌仍然是一種急需有效療法的疾病，而且除了HPV的基因之外，這項最新的TCGA分析可能有助在發現靶向宮頸癌基因組的重要序列元件的藥物中取得突破性進展。」

這項研究的一個特別令人關注的方面是鑑定出一組獨特的8種宮頸癌與子宮內膜癌存在分子類似性。這些子宮內膜樣腫瘤（endometrial-like tumor）主要是HPV陰性的，而且它們都在KRAS、ARID1A和PTEN基因上發生較高頻率的突變。

美國國家癌症研究所TCGA項目辦公室主任Jean-Claude Zenklusen博士注意到，「鑑定出HPV陰性子宮內膜樣腫瘤證實並不是所有的宮頸癌都與HPV感染存在關聯，而且嚴格來說，一小部分宮頸癌可能是由遺傳因子或其他因子導致的。」 TCGA項目在過去的十年裡已研究了30多種腫瘤類型。

鑑於免疫療法在癌症治療中正變得越來越重要，研究人員研究了編碼已知的免疫靶標的基因以便觀察其中的任何一種基因是否發生擴增，這種基因擴增可能預測病人對免疫療法作出的反應性。他們發現幾種這樣的基因發生擴增，特別是CD274基因（編碼免疫關卡蛋白PD-L1）和PDCD1LG2基因（編碼免疫關卡蛋白PD-L2）。已經證實幾種關卡抑制劑是有效的免疫治療試劑。此外，這項TCGA分析鑑定出幾種新的突變基因（包括MED1、ERBB3、CASP8、HLA-A和TGFBR2）存在於宮頸癌中。他們也鑑定出幾種宮頸癌病例存在涉及BCAR4的基因融合。基因BCAR4產生一種長鏈非編碼RNA（lncRNA），而這種lncRNA已經證實誘導對拉帕替尼---抑制乳腺癌中一種關鍵通路的口服藥物---產生反應性。因此BCAR4可能是攜帶這種變化的宮頸癌的潛在治療靶標。

鑑於免疫療法在癌症治療中正變得越來越重要，研究人員研究了編碼已知的免疫靶標的基因以便觀察其中的任何一種基因是否發生擴增，這種基因擴增可能預測病人對免疫療法作出的反應性。他們發現幾種這樣的基因發生擴增，特別是CD274基因（編碼免疫關卡蛋白PD-L1）和PDCD1LG2基因（編碼免疫關卡蛋白PD-L2）。已經證實幾種關卡抑制劑是有效的免疫治療試劑。此外，這項TCGA分析鑑定出幾種新的突變基因（包括MED1、ERBB3、CASP8、HLA-A和TGFBR2）存在於宮頸癌中。他們也鑑定出幾種宮頸癌病例存在涉及BCAR4的基因融合。基因BCAR4產生一種長鏈非編碼RNA（lncRNA），而這種lncRNA已經證實誘導對拉帕替尼---抑制乳腺癌中一種關鍵通路的口服藥物---產生反應性。因此BCAR4可能是攜帶這種變化的宮頸癌的潛在治療靶標。

當分析宮頸瘤中這些分子變化背後的生物學特徵時，研究人員發現將近四分之三的宮頸癌在PI3K/MAPK信號通路和/或TGFβ信號通路中發生基因組變化，這可能也提供治療靶標。他們注意到這項研究提出的一個重要問題是HPV陽性宮頸瘤或HPV陰性宮頸瘤是否會對靶向療法作出不同的反應。（生物谷 Bioon.com）

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The Cancer Genome Atlas Research Network

doi:

10.1038/nature21386