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今年3月9日，荷蘭阿姆斯特丹大學授予了第一萬五千個博士學位。這個學位是由阿姆斯特丹大學天文學系的Luca Bertolini教授頒發給Marco te Brömmelstroet的。 到目前為止，阿姆斯特丹大學已有長達120年的博士學位授予歷史了。
在1878年，阿姆斯特丹大學授予了第一個博士學位（數學與物理學），被授予者是Johannes Korteweg，授予者是阿姆斯特丹大學的Johannes Diderik van der Waals 博士，他也是1910年的諾貝爾獎金獲獎者。在阿姆斯特丹大學開始授予博士學位的最初幾十年裡，由於學生數量有限，每年只有10來個學生被授予博士學位。但隨著大學的不斷發展，在2009年已有381個學生獲得博士學位。在1890年，第一個被阿姆斯特丹大學授予的女博士名叫Marie du Saar，到目前為止，已有47%的博士學位被女性學生獲得。
和一些國家不同，為了滿足學生的需求，包括阿姆斯特丹大學在內的荷蘭高等院校在研究生教育階段授予學生幾種不同的學位。這些學位課程中有很多都是用英文授課的：
普通碩士課程通常為一年的課程：該課程的畢業生將獲得MSc, LLM或MA學位。
研究型碩士課程為兩年的課程，該課程的畢業生大多從事研究性質的工作或繼續攻讀博士學位。
專業型碩士課程通常是一年半，該課程包括了深入的理論研究以及以解決問題為導向的學習。
高級與行政碩士課程是專門為有一定工作經驗的學生準備的，為了在某一特定領域加強學生的知識，如阿姆斯特丹大學的MBA和國際金融碩士課程。
PhD課程代表了阿姆斯特丹大學最高學術學位的課程。大學內的每個院系都對在某一特定領域以及跨領域的PhD研究非常支持。
在PhD的所有課程中，一部分是以教授講課的授課方式，也有一部分設計單獨的項目研究或話題，這會在大學教授的指導下進行。
申請阿姆斯特丹大學博士課程的國際學生必須獲得等同於荷蘭碩士的學位。一個PhD課程至少包括三年的全職學習和獨立研究。學生以論文的形式展現他們的研究成果，並進行公開答辯。
在阿姆斯特丹大學，學生可以通過以下方式的學習和研究獲得博士學位：
博士生以僱傭的方式加入到大學的某個研究當中。博士生在大學內通常也扮演學術支持和教課的角色。
作為學生，參與一個正式課程的學習，學生需要付學費。
作為一個局外的候選者，已擁有了資金支持，在得到一個全職教授的同意後，加入到某個研究項目中。