曾國藩親自參與了對李秀成的審訊，李秀成還向曾國藩寫了投降書。但是曾國藩最後還是選擇殺死了李秀成，應該說這個選擇是非常正確的。
太平天國後期的兩個重要軍事將領，除了忠王李秀成之外，還有英王陳玉成。陳玉成早就被殺害了，太平天國最後的希望都寄托在李秀成的身上。
天京城被攻破後，李秀成帶了一次兩千人的隊伍掩護幼天王突圍成功。但因為幼天王的坐騎受傷，李秀成就把自己的馬讓給了幼天王。這才導致了李秀成的被捕，很快就被送到了曾國藩的面前。
有這麼一種說法，李秀成表示願意投降，並且建議由自己去招降太平天國殘餘的二、三十萬軍隊。當然如果這個計劃能夠實現，對於曾國藩來說是再立了新功。
但是老奸巨猾的曾國藩馬上就意識到這很可能是一個圈套，歷史上詐降的事非常多。比如明朝末年的祖大壽兵敗被迫投降皇太極，他也建議去招降寧遠城內的明軍，但一回到寧遠城，馬上就開始布置城防，抵禦清軍的進攻。
能夠抓到李秀成是大功一件，如果這一次李秀成逃跑了，傳出去就是莫大的恥辱。剩餘的太平軍雖然看上去數量很大，實際上作戰能力不強，消滅他們只是時間的問題。抓到了李秀成，再讓他走掉，讓慈禧太后知道了，肯定吃不完兜著走。
按照古代歷史上的規矩，曾國藩應該把這麼重要的犯人送往京城，由皇帝核准後斬首示眾。為什麼曾國藩要把李秀成馬上斬首呢？這裡邊的原因稍稍就有一點複雜。
首先，如果要把李秀成送往北京，就必然要經過長途跋涉，萬一消息走漏，剩餘的太平軍肯定拼死相救。如果李秀成被救走，那麼太平軍很有可能捲土重來。殺掉了李秀成就一勞永逸，永絕後患。
然後，曾國藩其實是有小心思的。天京城被攻破後，這是湘軍的最後一場大戰。所有的所有的將士都把這當成了最後一次發財的機會，他們把天城洗劫一空。萬一把李秀成送到北京城，李秀成把天京城的寶藏情況報告給慈禧太后，那湘軍搶奪金銀財寶的事就被坐實了。殺掉李秀成，實際上就是在滅口。
最後一個原因沒有辦法證實。傳說李秀成勸說曾國藩造反稱帝，他自己願意當馬前卒，為曾國藩衝鋒陷陣。曾國藩一心想當名臣，沒有想過要造反。但如果李秀成把這個細節報告給慈禧太后，那麼這裡邊可能就會有麻煩。
綜上所述，曾國藩經過深思熟慮，認為李秀成這個人不能留，必須速戰速決，把他出掉。一來可以瓦解太平軍的士氣，二來可以消除對自己的隱患和威脅。