皇家騎士團是數碼寶貝中實力強橫的超級強者，為數碼世界的網絡最高位守護神，每一個都是以絕對強度著稱。一直以來大家都默認皇家騎士團都是效力於世界之樹. 伊古德拉希爾，即數碼世界名義上的神，但是在動漫中皇家騎士團的成員卻多次效力於他人，甚至有時候與世界樹為敵。
要說「世界之樹. 伊古德拉希爾」最討厭的皇家騎士，「阿爾法獸」可以是排第一位了，在《數碼獸X進化：第十三位皇家騎士》中因數碼獸數量日益變多，數碼世界的資源和空間達到了臨界點，「世界之樹. 伊古德拉希爾」實行了「方舟計劃」利用X抗體，去除掉大多數的數碼獸，但是有些感染X抗體後的數碼獸不但沒事，反而更加強大，而主角「多路獸」是世界樹的實驗體自實X抗體，被「世界之樹.伊古德拉希爾」派去的皇家騎士團追殺。
在追殺的過程中「紅蓮騎士獸」開始對「世界之樹.伊古德拉希爾」的做法開始懷疑是不是正確的，後來為尋找正義自己也X抗體化變為「紅蓮騎士獸X」完完全全到世界樹的對立面。
後來當「多路獸」進化為「阿爾法獸」的時候，面對傳說中的聖騎士，「奧米加獸」也動搖了，和「阿爾法」一起去世界樹那裡尋找答案，後來隨著「阿爾法獸」的犧牲，從「阿爾法獸」的手中接過X抗體的「奧米加獸」也叛變了，利用「終端之力」將世界樹全部刪除。
而在漫畫《數碼獸編年史》中「阿爾法獸」聯手「龍王獸」化身為「阿爾法獸-龍王劍形態」準備砍樹，由此可見「阿爾法獸」和世界樹水火不容。
而在遊戲《數碼寶貝.網絡偵探駭客追憶》中，又出現了皇家騎士團內亂的兩大陣容，一方是「龍帝艾可薩獸」、「八足馬獸」、「顱骨獸」、「君主獸」、「領主獸」、「芳香獸」的世界樹陣容，另一方是「奧米加獸」、「紅蓮騎士獸」、「金甲龍獸」、「頑固獸」、「傑斯獸」、「聖輝V龍獸」的保護人容陣容，這裡面一半皇家騎士與世界樹為敵。
這裡面最經典的畫面就是「龍帝艾可薩獸」以一敵五。
而在動畫《數碼寶貝5:拯救者》中共出現了九位皇家騎士，真是皇家騎士粉絲的福音，出現的皇家騎士分別為：「奧米加獸」、「紅蓮騎士獸」、「八足馬獸」、「聖輝V龍獸」、「顱骨獸」、「劍皇獸」、「杜納斯獸」、「金甲龍獸」、「芳香獸」。它們剛開始效力於世界樹，但是隨著「八腳馬獸」的叛變走到人類一方，到最後除了死去的「芳香獸」和「劍皇獸」其它都皇家騎士內心的信念也動搖了，聯手大門大它們一起打敗世界樹。
在《數碼寶貝tir》中三方勢力大混戰，「奧米加獸（非皇家騎士那隻）」代表人類一方，「傑斯獸」代表「動態平衡」即「常恆性」，而「阿爾法獸」卻出乎意料地代表經常敵對的「世界樹」而且還是「龍王劍形態」。
而在《數碼寶貝·無限地帶》中「劍皇獸」和「杜納斯獸」卻為光明獸的賣命，為了讓光明獸復活到處破壞數碼世界和殺戮無辜的數碼獸從中吸取數據，所作所為甚至有辱網絡最高位守護神的稱號，而且「光明獸」的究極體為「光明獸-墮落形態」是七魔王之，這樣的話「劍皇獸」和「杜納斯獸」已經淪為七魔王的手下，但最後發現被「光明獸」欺騙了。
總的來說皇家騎士不存在固定效忠誰，只是遵循著心中的正義和更好地守護數碼世界還有推動數碼世界最好發展方向。