遊戲的背景依舊是光神力與暗魔力相互滋生的帕諾普大陸。在光明與黑暗的漫長衝突下，光神創造的人類與暗神創造的邪惡生物開始了鬥爭。
作為被光神選中的潛力者，你將成為一名領主，並組建起自己的專屬軍團來對抗黑暗的侵蝕。《小小軍團2》延續了初代經典的排兵布陣策略玩法、眾多大家耳熟能詳的英雄以及簡約歐美Q版美術風格，並在此基礎上作出了更多的革新。
比如，全新的3D場景和人物、物理引擎，以及在融入輕策略放置卡牌玩法的前提下，還加入了強化的兵種克制系統。
在《小小軍團2》中，軍團英雄分為四大陣營，每個英雄都有自己獨特的技能。
就戰場定位來說，他們又可以劃分為步兵、槍兵、騎兵、弓騎兵、盾兵、牧師、弓兵、刺客和法師這九大兵種。
這九個兵種互相克制，簡單來說，可以總結為：
弓騎兵/弓兵→步兵→槍兵→騎兵→弓兵。
刺客→法師→盾兵→騎兵&弓兵。
兵種屬性中可以看到該英雄的屬性和克制關係，作為一款策略遊戲，如果想贏得更漂亮，如何合理使用你手裡的兵種就是需要思考的問題了。
作為新一代遊戲，橫豎屏同步支持的設計是非常亮眼的。
《小小軍團2》的特點之一是以「小」人匯聚千軍萬馬，在橫豎屏無縫切換的模式下，橫屏可以展現宏大的軍團對戰場面，豎版則保證玩家在通勤路上也可單手操作所有遊戲功能。
在引入放置掛機、離線收集資源的玩法後，也可以輕量化玩家的負擔，讓玩家們能夠將注意力放在更為有趣的玩法和戰鬥策略上。
遊戲包含了競技場、天空試煉、黑暗秘境、隨機冒險、地圖偶然事件等多種玩法模式。
以前期解鎖的【天空試煉】玩法為例，這個副本很像爬塔通關的設計，玩家可以擊敗一層天空島的守擂軍團後即可獲得豐厚的獎勵並爬升至下一層，如此不斷上升。
試煉中的獎勵非常豐厚，除了鑽石，金幣和高級精華，在通關10的倍數層級後，還會獲得精英英靈石。
不過【天空試煉】是限時挑戰，如果計時結束，仍未擊殺所有目標，則挑戰失敗，這也依舊保持了遊戲策略性的特點。