伴隨著跌宕起伏的劇情，網友們對劇中的三大懸念也更加好奇，究竟誰才是真正的皇帝贏家，譚允賢最終情歸何處，一切答案都在今晚揭曉。
懸念一：帝位爭奪 霍建華黃軒誰才是真正的贏家？
《女醫明妃傳》朱祁鎮、朱祁鈺兩兄弟用活生生的例子，告訴我們先贏不是贏，最後佔住江山的才是真正的王者。昔日的霸氣皇帝被俘歸國後，成為階下囚。京城突發瘟疫，身為太上皇的朱祁鎮放下身段，義無反顧的選擇與他們同甘共苦。瓦剌使團前來會盟，他依然選擇主動出徵會盟，得到諸多百姓及眾臣的愛戴。與此同時，黃軒飾演的朱祁鈺則誤食汪美麟的毒藥，病情愈加嚴重。兩兄弟究竟能否冰釋前嫌，真心和解，皇權最終會落到誰的手上？
懸念二：愛情歸屬 劉詩詩最終情歸何處？
魚線夫婦，從當初的心動深愛轉為彼此的痛心傷害，身份變了，心境變了，一切似乎都回不到從前。被禁足，被陷害，被失孩子，成為妃子的允賢漸漸遠離自己的行醫理想，她的掙扎與困惑，又有誰人能理解。針線夫婦，友情之上生死搭檔，戀人未滿兇險相依，白首不相離的愛情，與他們擦肩而過。無法宣之於口的愛，君行萬裡的相陪，是放棄帝位與心愛的女子一起懸壺濟世，還是保持最真切的友情，劉詩詩最終會情歸何處？
懸念三：虐心OR歡喜 大結局能否逆襲？
「國民初戀」黃軒被「黑化」，搖身一變成了腹黑反派。朱祁鈺病逝，譚允賢意外失去孩子，隨戲班遠走天涯，網傳結局究竟是真是假？終於認清了自己內心的朱祁鈺，想要彌補對皇兄的虧欠。不忘初心的允賢，在內心深處始終留一束微光， 不畏前行。大結局是否真會如網傳一樣虐心無比，還是成功反轉收穫歡喜ending？
當然除了即將被揭曉的三大懸念外，劉詩詩飾演的譚允賢也越來越被觀眾喜愛。她接二連三的接受命運的掌摑，卻從不逃避，從未妥協。每一次都堅定地選擇站起來，最終活成了自己想像中的樣子。記得在劇中有一句臺詞，令所有人印象深刻。譚允賢說：「也許我們很快死在這裡，但在這之前，我們要好好活著。」