本片主要說的還是調查那二十七名死者的案子，看到電影簡介裡說二十七這個數字有價值，可是看到影片最後才發現與數字沒有任何關係，就是最初二十七名死者而已。現在按照時間順序說說此片的主要案件：十年前有一個叫波旬的邪教，教主就是宋慈的恩師耿知年（以下叫他老耿）。可能是當時該教派對社會造成了不良影響或者是損害了大人物的利益，所以朝廷要剿滅該教。老耿一看形勢不妙，雖然當時他也是官吏，但是他的一些做法造成的影響太大，壓不住了，於是金蟬脫殼，殺了一些無關人等來頂罪，邪教引入地下。其中有一趙姓大戶，全家十二口。因為行兇的人幾乎都是趙家的左鄰右舍，非專業殺手，最後雨墨因躲在櫃中而倖免於難逃出後被宋慈撿到並撫養長大。而雨墨的父親因為傷重昏迷也躲過了，後來改名換姓，自毀容貌，還把舌頭割了去做了鐵匠。鐵匠只是明面的身份，實際秘密加入已轉入地下的波旬教。雨墨小小年紀就是個武學奇才，她在宋慈身邊長大，宋慈找人教她武功，而且她自己慢慢學會了家傳絕學神掌且從未被人發現，她到底是跟誰學的呢？時間回到電影開始，宋慈秀了一波推理，然後按照他心中的公理，把那個所謂被陷害的趙公子放生了。第二天趙公子被發現吊死了，在勘驗現場的時候突然又出現一批吊著的死人，至此簡介裡的二十七死者全部出現了。回到衙門檢驗的時候下大雨了，宋慈開始沒發現死因，因為沒有傷口，而且又不像中毒。到這裡我就想說說了，你宋慈做屍檢就靠看的嗎？這裡不細說了，反正就是通過詭異的場面慢慢發現了全部屍體都被抽去了全身骨頭，通過頭上一個二寸傷口拿出來的，雖然此處漏洞很多，不過可以忽略，不影響整體。宋慈在趙公子手上聞到香味，想到某地方，然後去調查，過程中導致一名可能見過兇手的服務員被殺死，雨墨追逐過程中與兇手發生打鬥，沒打過人家被打暈，宋慈趕到後兇手逃走。其實兇手完全可以在此時把二人全部滅口，你都殺二十八個了，這點心理素質沒有嗎？雖然兇手是雨墨的父親，但是他當時根本不知道啊，你剛剛跟人家比武的時候不一樣往要害部位捅麼！宋慈根據死者頭頂傷口推斷出取骨工具的大概模樣，於是去了本地一鐵匠鋪調研。雨墨認出鐵匠就是自己的父親老趙，自己推理出一切都是老趙所為，未動聲色。老趙拿出一裝工具的盒子，盒子內有一標記與工具正好形成正反模。我當時真以為這是一把上古神兵，不然一個工具箱有必要做的如此契合嗎？宋慈請教恩師老耿。老耿是位名醫，家裡很大，裝修的不錯。劇中展示了一下老耿給人看病的情況，告訴病人哪裡藥便宜。我感覺吧，你這樣一個一心為病人著想的大夫，估計平時診費也不會貴，你是怎麼養得起那麼多下人的啊，家裡那些奢華的用品都哪裡來的啊？別忘記了這裡只是一個小縣城。不過，這些還是可以忽略，不影響劇情。加快節奏說一下，老耿引火自焚一樣拿出本書，記載十年前剿滅邪教的一些記錄。宋慈離開的時候聞到曼陀羅花香，而且俯瞰老耿院落觀眾會發現與邪教教徽相像。回到衙門調查，此宋慈在屍體上聞到老耿家裡的花香味，此時雨墨用特殊手法把屍體點燃，宋慈鎖定嫌疑人老耿。夜探老耿家，發現作案工具，接著必然的被發現被捆綁。老耿估計是當教主時間長了，連自己都相信長生不老，用人骨舉行某種儀式來達到目的。老趙藉此機會把當年殘殺家人的兇手全部抓來取骨，折磨致死。老趙武功高強，所以把取骨工具偷偷藏到老耿家裡，達到轉移視線的目的。（其實到底是誰取骨呢，個人認為老耿嫌疑更大，畢竟是個大夫，手法肯定比老趙要好，而且萬一儀式有啥特殊要求的話，也只有老耿自己知道。不過這樣一來，老趙其實只殺了見過他的服務員一人，其它人只是抓來以後拍散骨頭後交給老耿料理。不過這樣一來，宋慈最後的推理偏差較大了，讓他很沒面子）繼續宋慈被抓那段，馬上被燒死的時候，雨墨帶著衙役及時出現，宋慈想要抓活的，結果一親信為宋慈擋刀而殉職。然後在宋慈默許下老耿團夥全部被消滅。在成功搗毀犯罪團夥之後，可以給知縣一個交代了，雖然心裡知道還有別的事，但我就是不告訴你潘縣長。宋慈自以為了解了一切，認為兇案都是雨墨所為，於是決定試試雨墨殺心大不大，雨墨中計，宋慈很失望，但是朝夕相處這麼久知道雨墨始終只是為了復仇而已。為了心中的公理決定放她一碼。接下來就是我認為全劇最為精彩的地方，適合的音樂響起，雨墨走到門口，沒有多餘的廢話，沒有那麼多囉嗦，舉刀自盡。刀很快，倒下的也很快，沒有痛苦，也沒有臨終臺詞。就像她這個人，從來都是那麼乾脆直接。其實背景音樂搭配的很不錯，這裡其實一點也不煽情，只是有些無奈罷了。她應該算是一個英雄，她認為公理大於真相。半年後，宋慈來到鐵匠鋪，給老趙講故事。隱晦告訴他雨墨是你女兒，為你頂罪了，但結局很不幸，老趙當時就精神奔潰了。最後於宋慈戴上官帽的背影中本片結束。