恆溫恆溼箱在做溫溼度實驗時所需用水一般要專用水箱來供水，如果水質不潔對於試驗箱是否有影響，試驗箱使用水有什麼標準，如果使用一般的自來水會有影響嗎?
用一般自來水溼度效果可以達到，但如果長期用自來水做溼度用水，水管中很容易生出水垢，而且自來水中的雜質還會吸附到產品表面，水箱也會不乾淨。所以建議客戶使用純淨水或蒸餾水，因為恆溫恆溼箱中是設有回水再利用的，所以成本也不用消耗太大，對水管、水箱、水路等都比較好。
恆溫恆溼箱的電阻率也是和使用水有關係的，水的絕緣性越好電阻率就越大，因普通用水加溼粒子比較大，長時間進行溼度試驗，那麼對溼度試驗箱傳感器的使用壽命必然會有影響，可能會造成溼度傳感器短路。對此，實驗用水要求相對要嚴格一些，採用純淨水或蒸餾水更好。
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由以上可以看出，恆溫恆溼箱的水路日常清洗保養尤為重要。清洗保養可參考以下步驟：
首先將恆溫恆溼箱的機房門打開、把總電源往下關閉；將排水閥旋轉打開，水將經回水管排回下水箱，水全部排回下水桶；將回水管抽出，水馬達電源線連接頭以及抽水馬達出水管拔起；此時抽水馬達出口將會有水漏出，這是正常現象，請以手指將抽水馬達出水口按住，並迅速的將下水桶的水倒掉；此後即可清洗各部分組件；清洗之後再將下水桶放至原位，將回水管抽水馬達電源線連接頭,以及抽水馬達出水管插回；打開下水桶蓋倒入蒸餾水或純水，排水閥關閉；最後把總電源往上打開，水將自動由下水桶，抽水馬達抽至水路系統各部件。
恆溫恆溼箱在正常使用狀況下，請每周至少清洗主機水槽1次。若水箱內有水垢或其他沉澱物，可將少量的水和醋酸加入水箱內搖動幾下，幾分鐘後用水衝洗，即可把水垢或沉澱物衝洗乾淨。