投叔讀博時發的第一篇SCI論文，剛好是本人以第一作者身份發表的第一篇SCI論文——讀碩期間發表過一篇SCI論文，但並不是一作。
先提前劇透一下，這篇論文最後沒能進入投叔博士論文的正文中，僅僅是在publication中列了一下。
說到這裡，懂行的人應該已經猜到了。這篇論文其實做的是一個比較簡單的，所謂副課題，也就是side project。也正是因為這個定位，我沒能完成後續的一系列研究。
好吧，現在從頭講一下這個論文發表的經過。
剛開始讀博，投叔大概用了兩三個月的時間來warm up。具體地，是給兄弟組做幾個化合物，完成一個合作項目。在這期間，除了做實驗之外，還查文獻整理文獻，最終確定了主課題：從此我悲催的博士生涯開始了，當然，這是另一個故事。
主課題很快遭遇不順，目標分子的一個關鍵片段被人搶先報導。
當時我很疑惑，甚至產生了「紅旗到底能扛多久」的懷疑。後來跟導師仔細研究了一下已經發表的方法，覺得我們能做得更加elegant，所以還是決定把課題推下去。於是不幸接踵而至，不久又遇到了瓶頸。
遇到瓶頸，除了反覆試驗之外，肯定還是需要繼續讀文獻，找方法。一次很偶然的機會，在組會的頭腦風暴時，聊到了一個新方法。雖然這個新方法最後沒有應用在解決主課題的問題上，但我們都覺得很有價值，就這樣確定了side project。
Side project是一個多組分反應，最終可以高效地合成異吲哚。我跟導師還有組裡的博後反覆琢磨機理，覺得還是走得通的，也值得開發成一個新的有機合成方法。就這樣，在我解決主課題的空餘時間，開始了方法學研究。每天掛很多小瓶子，不停地篩選條件。
實驗科學裡，機理能走通跟實驗能做出來，完全是兩碼事。
在進行side project的研究中，我也碰到了非常多的新問題，最關鍵的一點是產率上不來。後來柳暗花明，從一個很偏門的反應中，一篇很偏門的文獻中得到靈感，找到一個無機鹽做反應助劑，產率一下子就上來了。而且最終開發的體系是水和DMSO的混合溶劑，這樣可以用氘代水和氘代DMSO做實驗，順手研究了一下反應的機理。
等到體系開發完畢後，導師就把最早一塊兒提想法的那個博後加進來，因為本來也有他的想法，要掛他名字，不如直接讓他做點事；另外還加了一個人，是我同一級的同學，剛好也是主課題做得很鬱悶，加進來找找自信。
我們三個人，一起拓展底物，前後得到20多個從未見報導的新化合物。但直到這時，我們仍然不知道這樣憑空做出來的東西有什麼用。
非常巧，在那段時間，OL的副主編，法國的一位女化學家到我們學校開講座。在她的ppt裡，出現了好幾次異吲哚結構。我很感興趣，講座完後跟她交流了一下，提到了接近收尾的這個side project。她很感興趣，建議我們投OL。
這讓我們挺意外的。本來我們幾個人覺得手裡就是個小玩意兒，大概發個一兩分文章得了。但這個女化學家很識貨，因為她知道，異吲哚非常不穩定，合成難度比較大。
說到這裡，可以講一點題外話。吲哚很常見，胺基酸中的色氨酸就有吲哚，糞便中還有3-甲基吲哚。但吲哚一旦變成異吲哚，就很不穩定了。這大概也能解釋為什麼大自然在進化中選擇了吲哚而不是異吲哚。
知道能發OL了，我們幾個人鼓起幹勁兒，把課題快快收尾。完成後，大家想著怎麼也得給這些新化合物找點所謂的「用處」吧。在合成中，我們發現這東西有很強的螢光，就先把螢光數據測了，準備在文章裡朝這個方向包裝。
後來導師建議說最好弄個純合成吧，我們就商量了一下，把異吲哚作為DA反應的雙烯體，做了一系列DA反應，又拿到一組新化合物。數據收集齊全，就投給OL了。
文章投出去後很快就被接受，只有小修改，我們花一個通宵把小修改搞定就定稿了。論文投出去到online，只用了兩周，正式出版也才三周。
這篇論文的全部過程到這裡也差不多講完，總體很順利，前後花了小半年的時間。文章發出來的時候，大家都挺高興。因為在當時，這還是我們課題組最好的文章之一。在投叔的這篇OL之前，課題組最好的文章也是一篇OL。後來我們課題組發展得非常好，OL就可有可無了。
非常可惜的是，當時沒有對螢光特性進行更深的研究，我的工作重心就又回到主課題上。我們組後面有個小夥子，拿這個方法點亮一些蛋白和細胞，發了幾篇CC。
好了，總結一下課題從設計到發論文的整個過程，看看得到了什麼經驗。
首先是一定要想明白原理。即便在實驗性學科裡，原理也是無比重要的，先把原理走通，前途一定是光明的。
第二，不停地查文獻讀文獻。即便前途光明，中間也會有波折。具體問題的解決，多數時候並不是靠靈光一現的所謂天才想法，而是靠廣泛地閱讀文獻，甚至要閱讀跟課題看上去毫無聯繫的文獻。
第三，課題完成後，還是要仔細查文獻讀文獻，看看自己手裡的東西到底怎麼樣。很多時候，面對新事物，一般人無法評估。多查查文獻，多請教一下行內的專家，這樣才能更準確地給自己的成果找到定位，進而選擇合適的期刊投稿。
第四，在實驗過程中就把數據收集好，做紮實。投稿的時候，一次性寫好，不要等審稿人提了，才去補。數據扎紮實實，會給審稿人一個好印象，增加過稿的可能性。那到底需要做哪些數據呢？很簡單，看看目標期刊以往的論文，都列了哪些數據，不要偷懶，老老實實把數據都收了，還特別要注意期刊對數據質量的要求。手裡比較差的數據，多重複做幾遍，不要怕麻煩。
投叔的博士生涯非常悲催，可能唯一算得上順利的，就是這個side project了。現在把經過記錄下來，希望能對後來人有所幫助。