檢查肥害嚴重的枯枝，可發現和施肥部位相對的地上部位的主枝、側枝，發生嚴重的爛皮。在幹施化肥時，常會出現根系受傷，甚至腐爛，枝葉枯焦凋萎。
挖根觀察，施肥部位及附近表土層內的根，會形成網絡的麻布狀，根系全爛，根皮腐爛脫落，並向根頸、主幹、主枝延伸。
肥害造成的損失是很大的，發生較輕而沒有死亡的橘樹，一般就近的一次新梢不能抽發，如果肥害發生在花前，則不能現蕾開花了。
肥害發生的原因：
不同的化肥及不同的施用方法，以及土壤情況（如乾濕度）等，都與肥害密切相關。化肥與農家肥配合施用一般很少會發生肥害，而單獨施化肥則容易發生肥害。
同樣是化肥，施氯化銨、氯化鉀時容易對柑橘產生肥害。氯離子對柑橘的急性肥害，主要中毒症狀表現為老葉落光，柑橘果實隨之脫落，嚴重時可導致失收。
其次是硫酸銨、尿素、氨水、碳酸氫銨等。施複合肥與過磷酸鈣則一般不會出現肥害，但在秋冬季不宜施用含氯高的複合肥。秋冬雨水較少，氯離子在土壤中濃度很高，橘樹吸收後水分吸收減少，根尖死亡，生長受到嚴重抑制，遇到凍害時雪上加霜，最終會造成整株橘樹死亡。
另外，在施肥時用量太多和施用方法不當，也很容易造成肥害，在生產上這是最常見的。同樣的施肥量，挖穴幹施比開溝用水澆施容易發生肥害，如果在橘園土壤乾燥時挖穴幹施，施後久晴不雨，一旦下雨，肥害會來得更加迅速、嚴重。
防止肥害措施：
橘園提倡增施農家肥，一般以有機土雜肥為主，這種肥料養分齊全，肥勁足，有效期長，對橘樹安全。
可在春季施用各種餅肥（菜籽餅、花生餅等），以及各種欄肥、垃圾肥，但必須充分腐熟後施用，防止燒根。如果來不及腐熟就要施用，可以在樹冠滴水線以外挖溝，進行深施，讓其慢慢腐熟後不斷供樹體吸收。
在施用化肥時，一般追肥時必須結合施後澆水，使肥料溶解利於吸收。不要在土壤乾燥時挖穴幹施化肥，用量更不能太多，尤其是氮素化肥一次太多，施用時最好拌些園土或過磷酸鈣，不要使根系直接接觸肥料，以免灼傷橘根。
進行葉面追肥時，濃度不能太高，以不超過0.5%為宜。如果橘園施肥出現肥害，要及時採取一些必要措施，緩解肥害，挽回損失。
當發現枝基部老葉枯焦脫落時，可迅速把施肥部位的土壤挖開，用清水衝洗施肥穴內土壤，衝淡肥液濃度，並切斷已爛死的粗根，再覆新土。主幹部位已發生肥害爛皮的，可塗上殺菌劑，防止病害蔓延。