如果為防範涉稅風險，公司想進行增值稅自查，該從哪些方面入手呢？以下是常見的容易出問題的地方，給財務朋友們提個醒。
一、進項稅額
1.用於抵扣進項稅額的各種扣稅憑證是否真實合法。
除了增值稅專用發票，海關進口增值稅專用繳款書。還可以抵扣進項稅的憑證有：農產品發票、道路通行費發票，國內旅客運輸服務票。
2.發生退貨或取得銷售折讓是否按規定作進項稅額轉出。
3.從供貨方取得的與商品銷售量、銷售額掛鈎的各種返還收入，是否衝減當期的進項稅額。是否存在將返利掛入其他應付款、其他應收款等往來帳或衝減營業費用，而不作進項稅額轉出的情況。
4.用於簡易計稅方法計稅項目、免徵增值稅項目、集體福利或者個人消費的購進貨物、加工修理修配勞務、服務、無形資產和不動產是否抵扣進項稅額。
5.非正常損失的購進貨物，以及相關的加工修理修配勞務和交通運輸服務是否抵扣進項稅額。
6.非正常損失的在產品、產成品所耗用的購進貨物（不包括固定資產）、加工修理修配勞務和交通運輸服務是否抵扣進項稅額。
7.非正常損失的不動產，以及該不動產所耗用的購進貨物、設計服務和建築服務是否抵扣進項稅額。
8.非正常損失的不動產在建工程所耗用的購進貨物、設計服務和建築服務是否抵扣進項稅額。
9.購進的貸款服務、餐飲服務、居民日常服務和娛樂服務，是否抵扣了進項稅額。
10.如果符合進項稅加計抵減，是否按規定進行了計提和抵減。
二、銷項稅額
1.銷售收入是否完整及時入帳。
是否存在現金收入不按規定入帳的情況；
是否存在不給客戶開具發票，相應的收入不按規定入帳的情況；
是否存在以貨易貨、以貨抵債收入未記收入的情況；
是否存在銷售產品不開發票，取得的收入不按規定入帳的情況；
是否存在銷售收入長期掛帳不轉收入的情況；
是否收取外單位或個人水、電、汽等費用，不計、少計收入或衝減費用；
是否將應收取的銷售款項，先支付費用（如購貨方的回扣、推銷獎、營業費用、委託代銷商品的手續費等），再將餘款入帳作收入的情況。
是否存在處置自己使用過的固定資產，未按規定繳納增值稅的情況。
2.是否存在視同銷售行為、未按規定計提銷項稅額的情況。
將自產或委託加工的貨物用於非增值稅應稅項目、集體福利或個人消費，如用於內設的食堂、賓館、醫院、託兒所、學校、俱樂部、家屬社區等部門，不計或少計應稅收入；
將自產、委託加工或購買的貨物用於投資、分配、無償捐助、贈送及將外購的材料改變用途對外銷售等，不計或少計應稅收入。
3.是否存在開具不符合規定的紅字發票衝減應稅收入的情況：發生銷貨退回、銷售折讓，開具的紅字發票和帳務處理是否符合稅法規定。
4.向購貨方收取的各種價外費用（例如手續費、補貼、集資費、返還利潤、獎勵費、違約金、運輸裝卸費等等）是否按規定納稅。
5.設有兩個以上的機構並實行統一核算的納稅人，將貨物從一個機構移送到其他機構（不在同一縣市）用於銷售，是否作銷售處理。
6.對逾期未收回的包裝物押金是否按規定計提銷項稅額。
7.增值稅混合銷售行為是否依法納稅：對增值稅稅法規定應視同銷售徵稅的行為是否按規定納稅；從事貨物運輸業務的單位和個人，發生銷售貨物並負責運輸所售貨物的混合銷售行為，是否按規定繳納增值稅。
8.兼營銷售貨物、勞務、服務、無形資產或者不動產的納稅人，適用不同稅率或者徵收率的，是否按規定分別核算適用不同稅率或者徵收率的銷售額；對不分別核算或者不能準確核算的，是否按主管稅務機關核定的貨物或者應稅勞務的銷售額繳納增值稅。
9.按照增值稅稅法規定應徵收增值稅的代購貨物、代理進口貨物的行為，是否繳納了增值稅。
10.免稅貨物是否依法核算：增值稅納稅人免徵增值稅的貨物或應稅勞務，是否符合稅法的有關規定；有無擅自擴大免稅範圍的問題；兼營免稅項目的增值稅一般納稅人，其免稅額、不予抵扣的進項稅額計算是否準確。
11.根據《關於中央財政補貼增值稅有關問題的公告》（國家稅務總局公告2013年3號）按照現行增值稅政策，納稅人取得的中央財政補貼，不屬於增值稅應稅收入，不徵收增值稅。不應開具增值稅專用發票。
12.是否存在不按文件規定的時間確認收入，遞延納稅義務。
納稅人發生應稅行為並收訖銷售款項或者取得索取銷售款項憑據的當天；先開具發票的，為開具發票的當天；
納稅人提供租賃服務採取預收款方式的，其納稅義務發生時間為收到預收款的當天；
納稅人從事金融商品轉讓的，為金融商品所有權轉移的當天；
納稅人發生視同銷售服務、無形資產或者不動產情形的，其納稅義務發生時間為服務、無形資產轉讓完成的當天或者不動產權屬變更的當天。
13.企業是否存在不符合差額徵稅規定，而按照差額徵稅方法計算增值稅的情形。
14.企業是否存在按稅法規定負有增值稅扣繳義務的扣繳義務人未依法履行扣繳稅款義務。
15、如果公司符合留抵退稅政策，是否按規定申請了留抵退稅。