疫情從1月起肆虐全球，印尼起初堅稱國內「零確診」，2月美國哈佛大學研究對此提出質疑，印尼當局還怒批是「侮辱」，直到3月2日才承認有確診病例。如今，印尼確診激增，衛生部公布22日單日新增283例，總確診人數達7418例，635人死亡。印尼總統佐科威先前聲稱最初不公布疫情資訊是不想造成民眾恐慌。
起初當局堅稱「零確診」
肺炎1月爆發，今年2月初，一名民眾從印尼峇裡島（Bali）結束旅遊行程回到中國後，確診肺炎，當時就有聲浪質疑印尼不可能「零確診」。
然而，印尼衛生部長普蘭多（Terawan Agus Putranto）一直堅稱印尼人不須擔心感染肺炎，因此也沒要求民眾維持社交距離，也沒加強篩檢。2月11日，美國哈佛大學（Harvard University）一份報告質疑印尼「零確診」說法，普蘭多怒批那是「侮辱」，並堅稱沒隱瞞疫情。印尼國防部長馬福德（Muhammad Mahfud）甚至聲稱「印尼不存在新冠病毒」。
佐科威坦承刻意誤導民眾
事情轉折點發生在3月2日，當天印尼政府首度宣布該國有2個確診病例，接下來數周內又有數十個確診病例，這讓印尼政府下令全國民眾維持社交距離，並停止所有不必要的活動。
印尼大學（University of Indonesia）流行病學專裡歐諾（Pandu Riono）判斷，印尼早在1月就有病例，但因為篩檢能力有限，因此未被發現。印尼總統佐科威（Joko Widodo）3月承認，政府刻意選擇讓民眾誤解國內疫情：「事實上，我們沒向大眾提供某些資訊，因為我們不想引起恐慌。」
篩檢能量及醫療用品不足
3月13日，佐科威任命國家災害應變局（National Disaster Mitigation Agency）局長莫納多（Doni Monardo）領導全國抗疫工作小組，並允許更多的實驗室篩檢肺炎。然而，印尼篩檢能量不足，抗疫工作小組發言人尤裡安託（Achmad Yurianto）表示，自3月2日以來，印尼篩檢次數低於5萬，每100萬人僅180人接受篩檢。
印尼政府的目標是全國有78間實驗室可篩檢肺炎，每日篩檢1萬人，但莫納多表示，目前只有37個實驗室有肺炎篩檢設備，未達政府設定目標的一半。莫納多也表示，印尼還面臨基本醫療用品短缺的問題，包括醫護人員需要的防護設備不足，他說這導致至少32名醫生與12名護理人員死亡。
4月初，佐科威宣布印尼進入「公共衛生緊急狀態」，允許各地方領導人實施強制的限制措施，防堵疫情蔓延。4月20日，佐科威命令所有地方首長與市長等加強追蹤與隔離措施，他說說：「政府無法單打獨鬥。」
不過，對許多印尼人來說，這太遲了。首都雅加達（Jakarta）居民理絲蒂（Risti Ameliana）表示：「這次疫情爆發對我的生活造成的影響比海嘯更嚴重，但人們對政府更不信任，這讓情況變得更艱困，因為這是全球大流行。」
人們憂心齋戒月可能導致進一步爆發
印尼是世界上穆斯林人口最多的國家，而伊斯蘭重要的「齋戒月」（Ramadan）將在4月23日開始，而穆斯林通常會在齋戒月返鄉探望親友，這也讓人們擔心印尼疫情將在齋戒月過後一發不可收拾。
印尼流行病學專裡歐諾說，除非政府採取更嚴格的措施，否則齋戒月過後，印尼可能會有1百萬人感染肺炎。佐科威21日宣布，政府將禁止所有人5月返鄉慶祝標誌齋戒月結束的開齋節（Eid al-Fitr）。