三色堇據說很久以前，三色堇原本叫堇菜花，而且它的花瓣如同天空裡的雲一樣，潔白無瑕。而愛神丘比特又是個小頑童，特別調皮，他手上的弓箭充滿著愛情的魔力，只要射向誰，那人便會情不自禁的愛上他第一眼看見的人。但是，小頑童丘比特的箭法太不準了，所以導致了人間的愛情故事經常出錯。
這天，丘比特又找到一個可以調皮的對象，準備用這個人來練手。結果，箭一射出，這次不是射偏了，而是恰巧吹來一陣風，讓這支箭射中了潔白的堇菜花。剎那間，堇菜花的花蕊流出了鮮血和淚水，這些鮮紅的血和淚水怎麼也抹不掉。自那以後，潔白的堇菜花就有了三種顏色，變成了今天的三色堇。
關於三色堇，還有另一個傳說。
天國裡面有一個巨大的花園，春暖花開之際，花園裡面都會長出許多奇花異草，珍奇又好看的花花草草引來不少天神來這裡賞花。
一天早晨，美神維納斯早早地就起來了，精心梳妝打扮了一番，穿上漂亮的裙子，戴上光彩奪目的首飾，領著她的孩子丘比特來到了花園裡。而此時，眾多天神也都已經到了花園裡，大家聚在一起，圍成一圈，好像在很入迷的欣賞著什麼東西，連美麗的維納斯來了，大家都沒顧上和她打招呼。
維納斯受到了冷落，心裡頓時不高興起來。想平時，她走到哪裡，大家都會被她的美貌所吸引，也總能引起別人的嘖嘖稱讚，可今天，居然有人忽略了她的存在，不開心的維納斯又生氣又好奇的湊上去一看，原來大家聚精會神欣賞的，居然是堇菜花，堇菜花開的十分茂盛，就像一個不卑不亢無所畏懼又渾身散發著迷人氣質的女子，引得眾天神都挪不開視線，讚不絕口。
習慣了眾神追捧的維納斯，始終認為天上的任何東西任何人都比不過她，只能是她最美。於是，維納斯便問起身邊的兒子丘比特：「好孩子，你認真看看，這些堇菜花和媽媽比起來，誰更美麗呢？」天真單純的丘比特脫口而出：「當然是堇菜花最美咯！」眾天神聽到後紛紛哈哈大笑，維納斯頓時火冒三丈，怒氣衝衝的離開了，一整天都沒有和任何人說話。
天黑後，天神們也漸漸散去。維納斯來到堇菜花面前，怎麼看怎麼想都覺得心裡特別惱火。於是就舉起手中的鞭子，狠狠地對著堇菜花抽打，邊恨恨地說道：「叫你比我美！叫你比我美！」就這樣打了許久，打累了才停下來。由於天黑，維納斯也看不清堇菜花現在如何了，心裡想著打了這麼久，肯定活不了了吧，頓覺心裡解氣，便得意地離開了。但讓維納斯意想不到的是，堇菜花生命力太頑強了，雖然身受重傷，但依然堅強的活著，只不過，因為受到了鞭打，堇菜花身上青一塊紫一塊的，臉上也留下了深淺不一的斑痕，就像個花貓臉一樣。
來年春天，堇菜花再度開花，但是，它從原來的單色變成了一朵花上有三種顏色的花兒，也就是現在稱呼的三色堇。而且，更讓人意外的是，這個看似花貓臉一樣的堇菜花，看起來居然比以前更加美麗更加迷人，遠遠的一瞥，就好像翩翩起舞的蝴蝶，贏得了更多天神的稱讚。
關於三色堇還有這樣的的傳說。據說三色堇上的棕色圖案，是天使來到人間的的時候，親吻了它三次而留下的。也有其他的說法是，當天使親吻三色堇的時候，她的容顏就印在花瓣上了。所以每一個見到三色堇的人，都會有幸福的結局。