牛、雞、鴨等家畜或家禽的糞便，作為肥料為果樹提供營養時，是必須進行充分的發酵處理後，才能對果樹進行使用的。否則會給果樹帶來如下危害，我是種植棗樹的，在建園之初，就因為不懂施肥而深受其害。記得當時是春天，我使用的是從棗園臨近的村子裡買來的新鮮雞糞，分別施用在棗樹樹盤的外緣，並且露天放置，沒做任何覆蓋，結果好多棗樹出現了以下情形。一，棗樹根系被燒傷。未經腐熟的糞肥施用在果樹根部附近後，發酵會繼續進行的。其發酵的過程，就是熱量產生的過程，有時其發酵堆內或臨近肥堆位置，溫度可達60℃以上，這樣的高溫會使果樹根部被燒傷，造成燒根現象，致使果樹根部腐爛，失去部分功能。
燒傷嚴重時，根系無法正常工作，無法從土壤中吸收水分和營養，最後果樹因缺乏水分和營養而死亡。我的棗園就因此損失了30多棵棗樹，其它好多棗樹，也變得不強壯，長成了弱樹，幾年之後才恢復健康。二，發酵產生氨氣，燻蒸棗樹，致使果樹葉片受傷。如果施在樹下的未腐熟糞肥，如果沒有用土覆蓋或覆蓋不徹底，其繼續發酵會產生一定數量的氨氣，氨氣在樹下聚集，對果樹的葉片，還會產生燻蒸作用，致使果樹葉片黃化、枯萎、脫落，影響果樹的正常生長。我的棗樹當年大部分落葉，棗園幾乎沒有收成。題中所提及的三種糞肥，未腐熟就使用的，對果樹所造成的危害，牛糞小些，雞糞和鴨糞很大。
所以，家禽、家畜的糞便在作為糞肥，為果樹提供營養時，必須進行發酵處理，並且要發酵腐熟，才能使用。自棗樹出現受損之後，我在以後的糞肥處理中，主要採用以下辦法，對所使用的雞糞進行發酵。【1】選擇場地。發酵糞肥是要進行場地選擇的。一是因為我用的量大，要有足夠場地堆積，二是糞肥發酵時臭味很大，儘量遠離人員活動頻繁的地點，最好處於人員活動多的地方的下風向。如果果園距村莊較近，最好場地選在村外進行，免得因氣味出現糾紛。【2】堆糞。在場地要堆糞的地方鋪一層土，厚度20釐米左右，也可以用農作物的秸稈代替土層，也就是鋪一層20~30釐米的秸稈。
這樣可以利用土層和秸稈層吸收糞肥滲出的液體。在以後把糞運走時，容易鏟起。鋪好墊層把要發酵的糞肥運進場地，堆放到墊層之上。堆放時也要分層進行，每層30釐米左右撒一層生石灰，用於殺滅糞肥中的有害菌，還可以糞肥中水分起反應，發生熱量，提高糞堆溫度，加快發酵速度，提高發酵效果。以此類推，最後把糞肥堆成高1.5米左右，長寬隨意，以利於堆砌作業為標準的大堆。如果糞肥含水量過多，也就是過於稀時，可加幹土，進行調節，調節至能夠堆起糞堆就可。【3】封土。糞肥堆好後，要用土把整個糞堆封閉起來。就是在糞堆上面和四個斜面，都蓋上一層20釐米左右的土，土要用鐵鍬等工具拍緊、拍實。
這層封土，可以使糞堆內發酵產生的熱量不散失，保持糞堆內溫度。還可以使糞肥的有效成分氨等少揮發，也減少水分因蒸發而流失。這樣的狀態下，大約5~6個月，整個糞肥就可發酵成熟，可以進行使用了，這樣的糞肥，只要使用方法，對果樹幾乎沒有任何傷害。牛、雞、鴨的糞對果樹施用，必須進行發酵，並要保證腐熟，才能免除對果樹的負面影響，腐熟的時間較長，在打算使用時，一定要做好充分準備，並採取正確的方法，進行發酵，最後才能使這些糞肥發揮作用，給種植者創收。