菸草局:中國菸草基因組資料庫(1.0版)開放運行

2020-11-23 中國政府網

    3月15日，中國菸草基因組資料庫（1.0版）面向行業開放運行。中國菸草基因組資料庫的開放運行，標誌著菸草基因組計劃重大專項取得了新的進展。

    中國菸草基因組資料庫設在國家菸草基因研究中心，由國家菸草基因研究中心負責資料庫管理和維護。資料庫儲存了去年底繪製的絨毛狀菸草和林菸草全基因組序列圖譜的所有原始數據以及基因注釋結果，總數據量將近7T。這兩張序列圖譜是目前已知植物基因組序列圖譜中基因組最大、組裝精度最高、組裝結果最好的2個圖譜，染色質區覆蓋度達到95%以上，基因區覆蓋度達到98%以上，contig N50超過30Kb，scaffold N50超過1100Kb，全面達到國際公認高質量精細圖譜標準。同時，資料庫還開發了Blast、GBrowse、ClustalW、CAP3等工具，能夠實現序列相似性比較、基因組瀏覽、多序列比對、序列拼接等生物信息學分析，可對35852（絨毛狀菸草）和31670（林菸草）個預測基因及注釋結果進行檢索和查詢。

    隨著菸草基因組計劃重大專項的持續推進，中國菸草基因組資料庫後續將不斷地進行功能升級和擴展改版。栽培菸草全基因組序列圖譜、菸草核心種質重測序、菸草連鎖圖譜等數據都將儲存到中國菸草基因組資料庫。同時，重大專項產生的菸草代謝組學、菸草突變體庫等信息數據也將納入到中國菸草基因組資料庫中來，形成統一的生物信息學分析平臺，對後續菸草基因組計劃重大專項的深入開展提供數據和技術支持。 

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